「mrcImageAutoRotationCorrelation3D」の版間の差分
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<td>[[オイラー角]]の第３角の範囲:min max delta(INPUT)</td> | <td>[[オイラー角]]の第３角の範囲:min max delta(INPUT)</td> | ||
<td>0.0 360.0 5.0</td> < | <td>0.0 360.0 5.0</td> < | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Xrange</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Ｘ方向の全範囲</td> | ||
| + | <td>0 0</td> < | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Yrange</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Y方向の全範囲</td> | ||
| + | <td>0 0</td> < | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Zrange</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Z方向の全範囲</td> | ||
| + | <td>0 0</td> < | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
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<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
<td>相関関数の選択：(INPUT)</td> | <td>相関関数の選択：(INPUT)</td> | ||
| + | <td>0</td> < | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-MR</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>画像回転の取り扱い：(INPUT) 1: 平均値で周辺を埋める 0: 楕円体としての回転 +16: 直方体としての回転</td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | <td>単粒子であり、周辺が媒体と考えられる場合には、０が推奨、そうではなく、周辺まで像があるときには、１６が推奨</td> < | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-m</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>画像の補間モード：(INPUT); 0: 最近傍、1:１次補間、2:３次補間</td> | ||
<td>0</td> < | <td>0</td> < | ||
</tr> | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
| − | </table> | + | </table> |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
2013年6月26日 (水) 20:33時点における版
mrcImageAutoRotationCorrelation3DとはmrcImageファイルの３次元データ間の相関値を計算するためのEosのコマンドである。
アルゴリズム
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト | |
|---|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力テストファイル:mrcImage(INPUT) | NULL | |
| -r | 必須 | 参照テストファイル:mrcImage(INPUT) | NULL | |
| -o | 選択 | 出力ファイル:パラメータ | stdout(設定しなければ標準出力） | |
| -cor | 選択 | 出力ファイル:相関マップ | NULL | |
| -fit | 選択 | 類似度の一番高い位置、回転角でのテスト画像:mrcImage(OUTPUT) | NULL | |
| -EA | 選択 | オイラー角の選択:４文字(INPUT) | YOYS | <|
| -Rot1 | 選択 | オイラー角の第１角の範囲:min max delta(INPUT) | 0.0 360.0 5.0 | <|
| -Rot2 | 選択 | オイラー角の第２角の範囲:min max delta(INPUT) | 0.0 180.0 5.0 | <|
| -Rot3 | 選択 | オイラー角の第３角の範囲:min max delta(INPUT) | 0.0 360.0 5.0 | <|
| -Xrange | 選択 | min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Ｘ方向の全範囲 | 0 0 | <|
| -Yrange | 選択 | min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Y方向の全範囲 | 0 0 | <|
| -Zrange | 選択 | min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Z方向の全範囲 | 0 0 | <|
| -M | 選択 | 相関関数の選択：(INPUT) | 0 | <|
| -MR | 選択 | 画像回転の取り扱い：(INPUT) 1: 平均値で周辺を埋める 0: 楕円体としての回転 +16: 直方体としての回転 | 0 | 単粒子であり、周辺が媒体と考えられる場合には、０が推奨、そうではなく、周辺まで像があるときには、１６が推奨 | <
| -m | 選択 | 画像の補間モード：(INPUT); 0: 最近傍、1:１次補間、2:３次補間 | 0 | <
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|
相関関数のモード
0: Normal Correlation FxG* 1: Phase Correlation FxG*/ |FxG*| 2: Phase Correlation FxG*/sqrt(|FxG*|) 3: Normalized Normal Correlation FxG*/|F||G|) 16: (0,0) = 0
