RELION2のUbuntuへの導入

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2017年2月24日 (金) 04:11時点におけるShinji (トーク | 投稿記録)による版

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Ubuntu-16.04 LTS へのインストール 

必要なライブラリのインストール

sudo apt-get update

sudo apt-get install -y vim git libx11-dev gfortrun ubuntu-make build-essential openmpi-bin openmpi-common openssh-client openssh-server libibnetdisc-dev


nvidiaのGPUを搭載している場合、cudaをインストール(自分のPCのアーキテクチャを確認するコマンドは[arch])

https://developer.nvidia.com/cuda-downloads


openmpiのインストール

https://likymice.wordpress.com/2015/03/13/install-open-mpi-in-ubuntu-14-04-13-10/


relion2.0のインストール

https://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/relion/index.php/Download_%26_install