「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分
行72: | 行72: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | |||
<br> | <br> | ||
行119: | 行118: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット=== | ||
+ | <pre> | ||
+ | 相関ファイル1 相関ファイル2 Rot1 Rot2 Mode | ||
+ | . . . . . | ||
+ | . . . . . | ||
+ | |||
+ | </pre> | ||
+ | <div>相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している</div> | ||
+ | <div>ファイル構成については[[mrcImagesSinogramCorrelation]]を参照</div> | ||
<br> | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
+ | ===[[Media:Input-1VOM-SinCor.zip|入力ファイル]]のデータ=== | ||
+ | <div>-i1 のデータ</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation | ||
+ | Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-1.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.925733 (174, 223, 0)<br> | ||
+ | 0.986152 (271, 281, 0)<br> | ||
+ | 0.203463<br> | ||
+ | 0.411921<br> | ||
+ | 0.00114423<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-2.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.969656 (10, 168, 0)<br> | ||
+ | 0.96977 (10, 357, 0)<br> | ||
+ | 0.199734<br> | ||
+ | 0.487223<br> | ||
+ | 0.0013534<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-3.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.79716 (206, 183, 0)<br> | ||
+ | 0.986575 (190, 120, 0)<br> | ||
+ | 0.251101<br> | ||
+ | 0.368028<br> | ||
+ | 0.0010223<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>-i2 のデータ</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation | ||
+ | Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | |||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-1.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.999642 (131, 329, 0)<br> | ||
+ | 0.921779 (132, 73, 0)<br> | ||
+ | 0.0604004<br> | ||
+ | 0.241042<br> | ||
+ | 0.00066956<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-2.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.995358 (132, 121, 0)<br> | ||
+ | 0.991247 (133, 4, 0)<br> | ||
+ | 0.0859721<br> | ||
+ | 0.247723<br> | ||
+ | 0.000688118<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-3.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.98175 (356, 217, 0)<br> | ||
+ | 0.97865 (0, 217, 0)<br> | ||
+ | 0.0731451<br> | ||
+ | 0.245175<br> | ||
+ | 0.000681042<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>-i3 のデータ</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation | ||
+ | Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | |||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-1.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-1 (285, 75, 0)<br> | ||
+ | 1 (285, 61, 0)<br> | ||
+ | nan<br> | ||
+ | nan<br> | ||
+ | nan<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-2.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-1 (158, 33, 0)<br> | ||
+ | 1 (158, 30, 0)<br> | ||
+ | 0.0945901<br> | ||
+ | 0.227151<br> | ||
+ | 0.000630976<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-3.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.970911 (132, 30, 0)<br> | ||
+ | 1 (135, 30, 0)<br> | ||
+ | 0.104829<br> | ||
+ | 0.220026<br> | ||
+ | 0.000611183<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>-i4 のデータ</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation | ||
+ | Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
+ | |||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-1.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.778626 (27, 38, 0)<br> | ||
+ | 1 (27, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.946219<br> | ||
+ | 0.047809<br> | ||
+ | 0.000132803<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-2.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.699187 (27, 191, 0)<br> | ||
+ | 1 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.93032<br> | ||
+ | 0.0611702<br> | ||
+ | 0.000169917<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-3.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.699187 (0, 191, 0)<br> | ||
+ | 1 (67, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.93353<br> | ||
+ | 0.0580325<br> | ||
+ | 0.000161201<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> |
2014年3月11日 (火) 06:37時点における版
WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとは複数のシノグラムの相関からコモンラインを算出するEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-In1 | 選択 | 入力ファイルリスト1: 正規相関 | NULL |
-In2 | 選択 | 入力ファイルリスト2: 1次元微分相関 | NULL |
-In3 | 選択 | 入力ファイルリスト3: 2次元微分相関 | NULL |
-In4 | 選択 | 入力ファイルリスト4: 相関長 | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定 | NULL |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-M | 選択 | Mode : choice of used Correlation | 15 |
-v | 選択 | variance of Gaussian weight function | 5 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-mの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | get memory of mrcImage |
1 | don't get memory of mrcImage |
-M の詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | -In1 を使用 |
2 | -In2 を使用 |
4 | -In3 を使用 |
8 | -In4 を使用 |
15 | 全ての入力ファイルを使用 |
-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット
相関ファイル1 相関ファイル2 Rot1 Rot2 Mode . . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルのデータ
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
最小 最大 |
-0.925733 (174, 223, 0) 0.986152 (271, 281, 0) |
最小 最大 |
-0.969656 (10, 168, 0) 0.96977 (10, 357, 0) |
最小 最大 |
-0.79716 (206, 183, 0) 0.986575 (190, 120, 0) |
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
最小 最大 |
-0.999642 (131, 329, 0) 0.921779 (132, 73, 0) |
最小 最大 |
-0.995358 (132, 121, 0) 0.991247 (133, 4, 0) |
最小 最大 |
-0.98175 (356, 217, 0) 0.97865 (0, 217, 0) |
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
最小 最大 |
-1 (285, 75, 0) 1 (285, 61, 0) |
最小 最大 |
-1 (158, 33, 0) 1 (158, 30, 0) |
最小 最大 |
-0.970911 (132, 30, 0) 1 (135, 30, 0) |
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
最小 最大 |
0.778626 (27, 38, 0) 1 (27, 0, 0) |
最小 最大 |
0.699187 (27, 191, 0) 1 (0, 0, 0) |
最小 最大 |
0.699187 (0, 191, 0) 1 (67, 0, 0) |