「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分

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行14: 行14:
 
<td>-In1</td>  
 
<td>-In1</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト1設定:<br>
+
<td>入力ファイルリスト1: [[ASCII]](正規相関)</td>  
−
normal correlation</td>  
+
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行21: 行20:
 
<td>-In2</td>  
 
<td>-In2</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト2設定:<br>
+
<td>入力ファイルリスト2: [[ASCII]](1次元微分相関)</td>  
−
derivation1D correlation</td>  
+
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行28: 行26:
 
<td>-In3</td>  
 
<td>-In3</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト3設定:<br>
+
<td>入力ファイルリスト3: [[ASCII]](2次元微分相関)</td>  
−
derivation2D correlation</td>  
+
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行35: 行32:
 
<td>-In4</td>  
 
<td>-In4</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト4設定:<br>
+
<td>入力ファイルリスト4: [[ASCII]](相関長)</td>  
−
length correlation</td>  
+
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行42: 行38:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>出力ファイル設定</td>  
+
<td>出力ファイル: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行60: 行56:
 
<td>-M</td>  
 
<td>-M</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Mode : choice of used Correlation</td>  
+
<td>使用する相関ファイルの組み合わせ</td>  
 
<td>15</td>  
 
<td>15</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行76: 行72:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 
===-mの詳細===
 
===-mの詳細===
行92: 行89:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 
===-M の詳細===
 
===-M の詳細===
行100: 行98:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>1</td>  
+
<td>+1</td>  
−
<td>ued to Normal Correlation</td>  
+
<td>-In1 を使用</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>2</td>  
+
<td>+2</td>  
−
<td>ued to Derivation1D Correlation</td>  
+
<td>-In2 を使用</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>4</td>  
+
<td>+4</td>  
−
<td>ued to Derivation2D Correlation</td>  
+
<td>-In3 を使用</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>8</td>  
+
<td>+8</td>  
−
<td>ued to Length Correlation</td>  
+
<td>-In4 を使用</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>15</td>  
 
<td>15</td>  
−
<td>ued to All Correlation</td>  
+
<td>全ての入力ファイルを使用</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<div>2つ以上のモードを組み合わせて使用する</div>
 +
<br>
  
 +
===-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット===
 +
<pre>
 +
相関ファイル  mrcファイル1  mrcファイル2  Rot1  Rot2  Mode
 +
        .                      .                    .            .        .        .
 +
        .                      .                    .            .        .        .
 +
 +
</pre>
 +
<div>相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している</div>
 +
<div>ファイル構成については[[mrcImagesSinogramCorrelation]]を参照</div>
 +
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[Media:Input-1VOM-SinCor.zip|入力ファイル]]のデータ===
 +
====-i1 のデータ====
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
 +
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-1.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.925733 (174, 223, 0)<br>
 +
0.986152 (271, 281, 0)<br>
 +
0.203463<br>
 +
0.411921<br>
 +
0.00114423<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-2.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.969656 (10, 168, 0)<br>
 +
0.96977 (10, 357, 0)<br>
 +
0.199734<br>
 +
0.487223<br>
 +
0.0013534<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor1-3.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.79716 (206, 183, 0)<br>
 +
0.986575 (190, 120, 0)<br>
 +
0.251101<br>
 +
0.368028<br>
 +
0.0010223<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====-i2 のデータ====
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
 +
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-1.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.999642 (131, 329, 0)<br>
 +
0.921779 (132, 73, 0)<br>
 +
0.0604004<br>
 +
0.241042<br>
 +
0.00066956<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-2.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.995358 (132, 121, 0)<br>
 +
0.991247 (133, 4, 0)<br>
 +
0.0859721<br>
 +
0.247723<br>
 +
0.000688118<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor2-3.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.98175 (356, 217, 0)<br>
 +
0.97865 (0, 217, 0)<br>
 +
0.0731451<br>
 +
0.245175<br>
 +
0.000681042<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====-i3 のデータ====
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
 +
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-1.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1 (285, 75, 0)<br>
 +
1 (285, 61, 0)<br>
 +
nan<br>
 +
nan<br>
 +
nan<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-2.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1 (158, 33, 0)<br>
 +
1 (158, 30, 0)<br>
 +
0.0945901<br>
 +
0.227151<br>
 +
0.000630976<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor3-3.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.970911 (132, 30, 0)<br>
 +
1 (135, 30, 0)<br>
 +
0.104829<br>
 +
0.220026<br>
 +
0.000611183<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====-i4 のデータ====
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
 +
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-1.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.778626 (27, 38, 0)<br>
 +
1 (27, 0, 0)<br>
 +
0.946219<br>
 +
0.047809<br>
 +
0.000132803<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-2.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.699187 (27, 191, 0)<br>
 +
1 (0, 0, 0)<br>
 +
0.93032<br>
 +
0.0611702<br>
 +
0.000169917<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-SinCor4-3.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.699187 (0, 191, 0)<br>
 +
1 (67, 0, 0)<br>
 +
0.93353<br>
 +
0.0580325<br>
 +
0.000161201<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
weight calculation start
 +
 +
deltaweight = 1.414214
 +
FinalCorrelationMin = 10.000000
 +
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[2][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[3][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
 +
deltaweight = 1.189207
 +
FinalCorrelationMin = 3.000000
 +
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
 +
deltaweight = 1.090508
 +
FinalCorrelationMin = 3.000000
 +
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
deltaweight = 1.000000
 +
FinalCorrelationMin = 3.000000
 +
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
 +
deltaweight = 1.000000
 +
FinalCorrelationMin = 3.000000
 +
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-o のデータ</div>
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
Weight of I3 is 0.000000
 +
Weight of I4 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-M===
 +
====M=3で実行====
 +
=====他のオプション設定なし=====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.771105
 +
Weight of I2 is 3.459215
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
=====v=1で実行=====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.840896
 +
Weight of I2 is 3.772301
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
=====m=1で実行=====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
Input data get end : CommonLinePositionData
 +
weight calculation start
 +
 +
deltaweight = 1.414214
 +
FinalCorrelationMin = 2.628996
 +
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.414214
 +
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 7.071068
 +
 +
deltaweight = 1.189207
 +
FinalCorrelationMin = 2.616069
 +
weight[0][1.000000, 2.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.000000
 +
weight[1][5.000000, 10.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 9.756828
 +
 +
deltaweight = 1.090508
 +
FinalCorrelationMin = 2.612862
 +
weight[0][0.840896, 1.189207] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.840896
 +
weight[1][8.204482, 11.602890] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.476005
 +
 +
-中略-
 +
 +
deltaweight = 1.000000
 +
FinalCorrelationMin = 2.612196
 +
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
 +
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817
 +
 +
deltaweight = 1.000000
 +
FinalCorrelationMin = 2.612196
 +
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
 +
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817
 +
 +
deltaweight = 1.000000
 +
FinalCorrelationMin = 2.612196
 +
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
 +
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-o のデータ</div>
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.771105
 +
Weight of I2 is 11.567817
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=5で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=6で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=7で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
Weight of I3 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=9で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.840327
 +
Weight of I2 is 3.769748
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=10で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.840327
 +
Weight of I2 is 3.769748
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=11で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.766941
 +
Weight of I2 is 0.766941
 +
Weight of I3 is 11.505344
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=12で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=13で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.000000
 +
Weight of I2 is 0.000000
 +
Weight of I3 is 0.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====M=14で実行====
 +
<pre>
 +
Weight of I1 is 0.766941
 +
Weight of I2 is 0.766941
 +
Weight of I3 is 11.505344
 +
</pre>
 +
<br>

2014年3月11日 (火) 07:25時点における最新版

WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-In1 選択 入力ファイルリスト1: ASCII(正規相関) NULL
-In2 選択 入力ファイルリスト2: ASCII(1次元微分相関) NULL
-In3 選択 入力ファイルリスト3: ASCII(2次元微分相関) NULL
-In4 選択 入力ファイルリスト4: ASCII(相関長) NULL
-o 必須 出力ファイル: ASCII NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-M 選択 使用する相関ファイルの組み合わせ 15
-v 選択 variance of Gaussian weight function 5
-h 選択 ヘルプを表示 　


-mの詳細

モード 説明
0 get memory of mrcImage
1 don't get memory of mrcImage


-M の詳細

モード 説明
+1 -In1 を使用
+2 -In2 を使用
+4 -In3 を使用
+8 -In4 を使用
15 全ての入力ファイルを使用
2つ以上のモードを組み合わせて使用する


-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

相関ファイル  mrcファイル1  mrcファイル2  Rot1  Rot2  Mode
         .                       .                     .             .        .         .
         .                       .                     .             .        .         .
相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している
ファイル構成についてはmrcImagesSinogramCorrelationを参照


実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor
Input-1VOM-SinCor1-1.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.925733 (174, 223, 0)

0.986152 (271, 281, 0)
0.203463
0.411921

0.00114423


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
Input-1VOM-SinCor1-2.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.969656 (10, 168, 0)

0.96977 (10, 357, 0)
0.199734
0.487223

0.0013534


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
Input-1VOM-SinCor1-3.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.79716 (206, 183, 0)

0.986575 (190, 120, 0)
0.251101
0.368028

0.0010223


-i2 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor
Input-1VOM-SinCor2-1.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.999642 (131, 329, 0)

0.921779 (132, 73, 0)
0.0604004
0.241042

0.00066956


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
Input-1VOM-SinCor2-2.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.995358 (132, 121, 0)

0.991247 (133, 4, 0)
0.0859721
0.247723

0.000688118


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
Input-1VOM-SinCor2-3.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.98175 (356, 217, 0)

0.97865 (0, 217, 0)
0.0731451
0.245175

0.000681042


-i3 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor
Input-1VOM-SinCor3-1.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (285, 75, 0)

1 (285, 61, 0)
nan
nan

nan


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
Input-1VOM-SinCor3-2.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (158, 33, 0)

1 (158, 30, 0)
0.0945901
0.227151

0.000630976


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
Input-1VOM-SinCor3-3.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.970911 (132, 30, 0)

1 (135, 30, 0)
0.104829
0.220026

0.000611183


-i4 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
Input-1VOM-SinCor4-1.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.778626 (27, 38, 0)

1 (27, 0, 0)
0.946219
0.047809

0.000132803


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Input-1VOM-SinCor4-2.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (27, 191, 0)

1 (0, 0, 0)
0.93032
0.0611702

0.000169917


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Input-1VOM-SinCor4-3.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (0, 191, 0)

1 (67, 0, 0)
0.93353
0.0580325

0.000161201


オプション必須項目のみの場合

出力結果
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
weight calculation start

deltaweight = 1.414214
FinalCorrelationMin = 10.000000 
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.189207
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.090508
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

-中略-

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000


-o のデータ
Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000
Weight of I4 is 0.000000


オプション　-M

M=3で実行

他のオプション設定なし
Weight of I1 is 0.771105
Weight of I2 is 3.459215


v=1で実行
Weight of I1 is 0.840896
Weight of I2 is 3.772301


m=1で実行
出力結果
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
weight calculation start

deltaweight = 1.414214
FinalCorrelationMin = 2.628996 
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.414214
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 7.071068

deltaweight = 1.189207
FinalCorrelationMin = 2.616069 
weight[0][1.000000, 2.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.000000
weight[1][5.000000, 10.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 9.756828

deltaweight = 1.090508
FinalCorrelationMin = 2.612862 
weight[0][0.840896, 1.189207] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.840896
weight[1][8.204482, 11.602890] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.476005

-中略-

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817


-o のデータ
Weight of I1 is 0.771105
Weight of I2 is 11.567817


M=5で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000


M=6で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000


M=7で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000


M=9で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748


M=10で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748


M=11で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344


M=12で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000


M=13で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000


M=14で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344



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