「ctfEnvelopFunction」の版間の差分

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行14:		行14:
	<td>-o</td>		<td>-o</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>出力ファイル設定</td>	+	<td>出力ファイル設定: [[ASCII]]</td>
	<td>stdout</td>		<td>stdout</td>
	</tr>		</tr>
行32:		行32:
	<td>-kV</td>		<td>-kV</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>加速電圧: [kV]</td>	+	<td>[[加速電圧]]: [kV]</td>
	<td>200</td>		<td>200</td>
	</tr>		</tr>
行38:		行38:
	<td>-Cs</td>		<td>-Cs</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>球面収差: [mm]</td>	+	<td>[[球面収差係数]]: [mm]</td>
	<td>1.7</td>		<td>1.7</td>
	</tr>		</tr>
行56:		行56:
	<td>-Ain</td>		<td>-Ain</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>IlluminationAperture[mrad]</td>	+	<td>[[照射角度]][mrad]</td>
	<td>0.02</td>		<td>0.02</td>
	</tr>		</tr>
行83:		行83:
	<td>　</td>		<td>　</td>
	</tr>		</tr>
−	</table>	+	</table>
	===モードの詳細===		===モードの詳細===

---

2014年8月19日 (火) 02:25時点における版

ctfEnvelopFunctionとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-o	選択	出力ファイル設定: ASCII	stdout
-Rmax	選択	最大空間周波数: [/A]	0.1
-dR	選択	空間周波数間隔: [/A]	0.0001
-kV	選択	加速電圧: [kV]	200
-Cs	選択	球面収差係数: [mm]	1.7
-df	必須	デフォーカス: [A]:under(+)	100000
-A	選択	AmplitudeContrast/PhaseContrast	0.0
-Ain	選択	照射角度[mrad]	0.02
-ctfMode	選択	CTFMode	32
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

CTFModeの詳細

モード	説明
32	照射角度
64	エネルギー拡散

実行例

オプション必須項目のみの場合

df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 9.999994e-01
2.000000e-04 9.999977e-01
3.000000e-04 9.999949e-01
4.000000e-04 9.999909e-01
5.000000e-04 9.999858e-01
6.000000e-04 9.999795e-01
7.000000e-04 9.999721e-01
8.000000e-04 9.999635e-01
9.000000e-04 9.999539e-01

-中略-

9.900110e-02 5.728893e-01
9.910110e-02 5.722460e-01
9.920111e-02 5.716026e-01
9.930111e-02 5.709595e-01
9.940111e-02 5.703164e-01
9.950111e-02 5.696734e-01
9.960111e-02 5.690305e-01
9.970111e-02 5.683877e-01
9.980112e-02 5.677449e-01
9.990112e-02 5.671023e-01

オプション　-Rmax

Rmax=0.003, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 9.999994e-01
2.000000e-04 9.999977e-01
3.000000e-04 9.999949e-01
4.000000e-04 9.999909e-01
5.000000e-04 9.999858e-01
6.000000e-04 9.999795e-01
7.000000e-04 9.999721e-01
8.000000e-04 9.999635e-01
9.000000e-04 9.999539e-01
9.999999e-04 9.999430e-01
1.100000e-03 9.999311e-01
1.200000e-03 9.999180e-01
1.300000e-03 9.999037e-01
1.400000e-03 9.998884e-01
1.500000e-03 9.998719e-01
1.600000e-03 9.998542e-01
1.700000e-03 9.998354e-01
1.800000e-03 9.998155e-01
1.899999e-03 9.997944e-01
1.999999e-03 9.997722e-01
2.099999e-03 9.997489e-01
2.200000e-03 9.997244e-01
2.300000e-03 9.996988e-01
2.400000e-03 9.996720e-01
2.500000e-03 9.996441e-01
2.600000e-03 9.996151e-01
2.700000e-03 9.995849e-01
2.800000e-03 9.995536e-01
2.900000e-03 9.995211e-01

オプション　-dR

dR=0.0002, Rmax=0.003, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
2.000000e-04 9.999977e-01
4.000000e-04 9.999909e-01
6.000000e-04 9.999795e-01
8.000000e-04 9.999635e-01
9.999999e-04 9.999430e-01
1.200000e-03 9.999180e-01
1.400000e-03 9.998884e-01
1.600000e-03 9.998542e-01
1.800000e-03 9.998155e-01
2.000000e-03 9.997722e-01
2.200000e-03 9.997244e-01
2.400000e-03 9.996720e-01
2.600000e-03 9.996151e-01
2.799999e-03 9.995536e-01
2.999999e-03 9.994875e-01

オプション　-kV

kV=1000, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 9.999994e-01
2.000000e-04 9.999977e-01
3.000000e-04 9.999949e-01
4.000000e-04 9.999909e-01
5.000000e-04 9.999858e-01
6.000000e-04 9.999795e-01
7.000000e-04 9.999721e-01
8.000000e-04 9.999635e-01
9.000000e-04 9.999539e-01

-中略-

9.900110e-02 5.723011e-01
9.910110e-02 5.716560e-01
9.920111e-02 5.710110e-01
9.930111e-02 5.703661e-01
9.940111e-02 5.697213e-01
9.950111e-02 5.690766e-01
9.960111e-02 5.684319e-01
9.970111e-02 5.677873e-01
9.980112e-02 5.671429e-01
9.990112e-02 5.664985e-01

オプション　-Cs

Cs=2.1, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 9.999994e-01
2.000000e-04 9.999977e-01
3.000000e-04 9.999949e-01
4.000000e-04 9.999909e-01
5.000000e-04 9.999858e-01
6.000000e-04 9.999795e-01
7.000000e-04 9.999721e-01
8.000000e-04 9.999635e-01
9.000000e-04 9.999539e-01

-中略-

9.900110e-02 5.730467e-01
9.910110e-02 5.724038e-01
9.920111e-02 5.717610e-01
9.930111e-02 5.711183e-01
9.940111e-02 5.704757e-01
9.950111e-02 5.698332e-01
9.960111e-02 5.691907e-01
9.970111e-02 5.685483e-01
9.980112e-02 5.679060e-01
9.990112e-02 5.672638e-01

オプション　-Ain

Ain=0.1, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 9.999858e-01
2.000000e-04 9.999430e-01
3.000000e-04 9.998719e-01
4.000000e-04 9.997722e-01
5.000000e-04 9.996441e-01
6.000000e-04 9.994875e-01
7.000000e-04 9.993026e-01
8.000000e-04 9.990891e-01
9.000000e-04 9.988473e-01

-中略-

9.900110e-02 8.948820e-07
9.910110e-02 8.700968e-07
9.920111e-02 8.459706e-07
9.930111e-02 8.224916e-07
9.940111e-02 7.996417e-07
9.950111e-02 7.774053e-07
9.960111e-02 7.557654e-07
9.970111e-02 7.347090e-07
9.980112e-02 7.142174e-07
9.990112e-02 6.942782e-07

オプション　-ctfMode

ctfMode=64, df=100000で実行

0.000000e+00 1.000000e+00
1.000000e-04 1.000000e+00
2.000000e-04 1.000000e+00
3.000000e-04 1.000000e+00
4.000000e-04 1.000000e+00
5.000000e-04 1.000000e+00
6.000000e-04 1.000000e+00
7.000000e-04 1.000000e+00
8.000000e-04 1.000000e+00
9.000000e-04 1.000000e+00

-中略-

9.900110e-02 1.000000e+00
9.910110e-02 1.000000e+00
9.920111e-02 1.000000e+00
9.930111e-02 1.000000e+00
9.940111e-02 1.000000e+00
9.950111e-02 1.000000e+00
9.960111e-02 1.000000e+00
9.970111e-02 1.000000e+00
9.980112e-02 1.000000e+00
9.990112e-02 1.000000e+00