「ctfEnvelopFunction」の版間の差分
提供: Eospedia
(→実行例) |
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行14: | 行14: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行20: | 行20: | ||
<td>-Rmax</td> | <td>-Rmax</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>最大空間周波数: [/A]</td> |
<td>0.1</td> | <td>0.1</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行26: | 行26: | ||
<td>-dR</td> | <td>-dR</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>空間周波数間隔: [/A]</td> |
<td>0.0001</td> | <td>0.0001</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行32: | 行32: | ||
<td>-kV</td> | <td>-kV</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>[[加速電圧]]: [kV]</td> |
<td>200</td> | <td>200</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-Cs</td> | <td>-Cs</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>[[球面収差係数]]: [mm]</td> |
<td>1.7</td> | <td>1.7</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-df</td> | <td>-df</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td> | + | <td>デフォーカス: [A]:under(+)</td> |
<td>100000</td> | <td>100000</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行56: | 行56: | ||
<td>-Ain</td> | <td>-Ain</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>[[照射半角]][mrad]</td> |
<td>0.02</td> | <td>0.02</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行83: | 行83: | ||
<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
行105: | 行105: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>32</td> | <td>32</td> | ||
− | <td>照射角度</td> | + | <td>[[照射角度]]</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
行111: | 行111: | ||
<td>エネルギー拡散</td> | <td>エネルギー拡散</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
− | + | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
行142: | 行141: | ||
9.990112e-02 5.671023e-01 | 9.990112e-02 5.671023e-01 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -Rmax=== | ===オプション -Rmax=== | ||
行177: | 行184: | ||
2.900000e-03 9.995211e-01 | 2.900000e-03 9.995211e-01 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-Rmax-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -dR=== | ===オプション -dR=== | ||
行198: | 行213: | ||
2.999999e-03 9.994875e-01 | 2.999999e-03 9.994875e-01 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-dR-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -kV=== | ===オプション -kV=== | ||
行226: | 行249: | ||
9.990112e-02 5.664985e-01 | 9.990112e-02 5.664985e-01 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-kV-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -Cs=== | ===オプション -Cs=== | ||
行254: | 行285: | ||
9.990112e-02 5.672638e-01 | 9.990112e-02 5.672638e-01 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-Cs-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -Ain=== | ===オプション -Ain=== | ||
行282: | 行321: | ||
9.990112e-02 6.942782e-07 | 9.990112e-02 6.942782e-07 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-Ain-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -ctfMode=== | ===オプション -ctfMode=== | ||
行310: | 行357: | ||
9.990112e-02 1.000000e+00 | 9.990112e-02 1.000000e+00 | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-ctfMode64-ctfEnvelopFunction.png]]<br> | ||
+ | gnuplotにて表示<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> |
2014年9月29日 (月) 05:26時点における最新版
ctfEnvelopFunctionとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-o | 選択 | 出力ファイル設定: ASCII | stdout |
-Rmax | 選択 | 最大空間周波数: [/A] | 0.1 |
-dR | 選択 | 空間周波数間隔: [/A] | 0.0001 |
-kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
-Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 1.7 |
-df | 必須 | デフォーカス: [A]:under(+) | 100000 |
-A | 選択 | AmplitudeContrast/PhaseContrast | 0.0 |
-Ain | 選択 | 照射半角[mrad] | 0.02 |
-ctfMode | 選択 | CTFMode | 32 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
CTFModeの詳細
モード | 説明 |
---|---|
32 | 照射角度 |
64 | エネルギー拡散 |
実行例
オプション必須項目のみの場合
df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 9.999994e-01 2.000000e-04 9.999977e-01 3.000000e-04 9.999949e-01 4.000000e-04 9.999909e-01 5.000000e-04 9.999858e-01 6.000000e-04 9.999795e-01 7.000000e-04 9.999721e-01 8.000000e-04 9.999635e-01 9.000000e-04 9.999539e-01 -中略- 9.900110e-02 5.728893e-01 9.910110e-02 5.722460e-01 9.920111e-02 5.716026e-01 9.930111e-02 5.709595e-01 9.940111e-02 5.703164e-01 9.950111e-02 5.696734e-01 9.960111e-02 5.690305e-01 9.970111e-02 5.683877e-01 9.980112e-02 5.677449e-01 9.990112e-02 5.671023e-01
オプション -Rmax
Rmax=0.003, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 9.999994e-01 2.000000e-04 9.999977e-01 3.000000e-04 9.999949e-01 4.000000e-04 9.999909e-01 5.000000e-04 9.999858e-01 6.000000e-04 9.999795e-01 7.000000e-04 9.999721e-01 8.000000e-04 9.999635e-01 9.000000e-04 9.999539e-01 9.999999e-04 9.999430e-01 1.100000e-03 9.999311e-01 1.200000e-03 9.999180e-01 1.300000e-03 9.999037e-01 1.400000e-03 9.998884e-01 1.500000e-03 9.998719e-01 1.600000e-03 9.998542e-01 1.700000e-03 9.998354e-01 1.800000e-03 9.998155e-01 1.899999e-03 9.997944e-01 1.999999e-03 9.997722e-01 2.099999e-03 9.997489e-01 2.200000e-03 9.997244e-01 2.300000e-03 9.996988e-01 2.400000e-03 9.996720e-01 2.500000e-03 9.996441e-01 2.600000e-03 9.996151e-01 2.700000e-03 9.995849e-01 2.800000e-03 9.995536e-01 2.900000e-03 9.995211e-01
オプション -dR
dR=0.0002, Rmax=0.003, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 2.000000e-04 9.999977e-01 4.000000e-04 9.999909e-01 6.000000e-04 9.999795e-01 8.000000e-04 9.999635e-01 9.999999e-04 9.999430e-01 1.200000e-03 9.999180e-01 1.400000e-03 9.998884e-01 1.600000e-03 9.998542e-01 1.800000e-03 9.998155e-01 2.000000e-03 9.997722e-01 2.200000e-03 9.997244e-01 2.400000e-03 9.996720e-01 2.600000e-03 9.996151e-01 2.799999e-03 9.995536e-01 2.999999e-03 9.994875e-01
オプション -kV
kV=1000, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 9.999994e-01 2.000000e-04 9.999977e-01 3.000000e-04 9.999949e-01 4.000000e-04 9.999909e-01 5.000000e-04 9.999858e-01 6.000000e-04 9.999795e-01 7.000000e-04 9.999721e-01 8.000000e-04 9.999635e-01 9.000000e-04 9.999539e-01 -中略- 9.900110e-02 5.723011e-01 9.910110e-02 5.716560e-01 9.920111e-02 5.710110e-01 9.930111e-02 5.703661e-01 9.940111e-02 5.697213e-01 9.950111e-02 5.690766e-01 9.960111e-02 5.684319e-01 9.970111e-02 5.677873e-01 9.980112e-02 5.671429e-01 9.990112e-02 5.664985e-01
オプション -Cs
Cs=2.1, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 9.999994e-01 2.000000e-04 9.999977e-01 3.000000e-04 9.999949e-01 4.000000e-04 9.999909e-01 5.000000e-04 9.999858e-01 6.000000e-04 9.999795e-01 7.000000e-04 9.999721e-01 8.000000e-04 9.999635e-01 9.000000e-04 9.999539e-01 -中略- 9.900110e-02 5.730467e-01 9.910110e-02 5.724038e-01 9.920111e-02 5.717610e-01 9.930111e-02 5.711183e-01 9.940111e-02 5.704757e-01 9.950111e-02 5.698332e-01 9.960111e-02 5.691907e-01 9.970111e-02 5.685483e-01 9.980112e-02 5.679060e-01 9.990112e-02 5.672638e-01
オプション -Ain
Ain=0.1, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 9.999858e-01 2.000000e-04 9.999430e-01 3.000000e-04 9.998719e-01 4.000000e-04 9.997722e-01 5.000000e-04 9.996441e-01 6.000000e-04 9.994875e-01 7.000000e-04 9.993026e-01 8.000000e-04 9.990891e-01 9.000000e-04 9.988473e-01 -中略- 9.900110e-02 8.948820e-07 9.910110e-02 8.700968e-07 9.920111e-02 8.459706e-07 9.930111e-02 8.224916e-07 9.940111e-02 7.996417e-07 9.950111e-02 7.774053e-07 9.960111e-02 7.557654e-07 9.970111e-02 7.347090e-07 9.980112e-02 7.142174e-07 9.990112e-02 6.942782e-07
オプション -ctfMode
ctfMode=64, df=100000で実行
0.000000e+00 1.000000e+00 1.000000e-04 1.000000e+00 2.000000e-04 1.000000e+00 3.000000e-04 1.000000e+00 4.000000e-04 1.000000e+00 5.000000e-04 1.000000e+00 6.000000e-04 1.000000e+00 7.000000e-04 1.000000e+00 8.000000e-04 1.000000e+00 9.000000e-04 1.000000e+00 -中略- 9.900110e-02 1.000000e+00 9.910110e-02 1.000000e+00 9.920111e-02 1.000000e+00 9.930111e-02 1.000000e+00 9.940111e-02 1.000000e+00 9.950111e-02 1.000000e+00 9.960111e-02 1.000000e+00 9.970111e-02 1.000000e+00 9.980112e-02 1.000000e+00 9.990112e-02 1.000000e+00