「ctfWeightMapCreation」の版間の差分
提供: Eospedia
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<td>-dRinv</td> | <td>-dRinv</td> | ||
− | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>dRinv[A]</td> | <td>dRinv[A]</td> | ||
<td>1024*5/3</td> | <td>1024*5/3</td> | ||
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<td>-dRmaxInv</td> | <td>-dRmaxInv</td> | ||
− | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>dRmaxInv[A]</td> | <td>dRmaxInv[A]</td> | ||
<td>10.0</td> | <td>10.0</td> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
+ | ===df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行=== | ||
+ | ====他のオプション設定なし==== | ||
+ | <pre> | ||
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+ | ====オプション -kV==== | ||
+ | =====kV=100で実行===== | ||
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+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 0.090820 1.000000 0.089324 | ||
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+ | 0.094727 1.000000 0.105902 | ||
+ | 0.095703 1.000000 0.110378 | ||
+ | 0.096680 1.000000 0.114993 | ||
+ | 0.097656 1.000000 0.119748 | ||
+ | 0.098633 1.000000 0.124646 | ||
+ | 0.099609 1.000000 0.129690 | ||
+ | </pre> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ====オプション -Cs==== | ||
+ | =====Cs=で実行===== | ||
+ | <pre> | ||
+ | 0.000000 1.000000 1.000000 | ||
+ | 0.000977 1.000000 -0.000000 | ||
+ | 0.001953 1.000000 -0.000001 | ||
+ | 0.002930 1.000000 -0.000002 | ||
+ | 0.003906 1.000000 -0.000003 | ||
+ | 0.004883 1.000000 -0.000005 | ||
+ | 0.005859 1.000000 -0.000007 | ||
+ | 0.006836 1.000000 -0.000009 | ||
+ | 0.007812 1.000000 -0.000011 | ||
+ | 0.008789 1.000000 -0.000013 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 0.090820 1.000000 0.031918 | ||
+ | 0.091797 1.000000 0.033352 | ||
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+ | 0.099609 1.000000 0.046605 | ||
+ | </pre> |
2013年12月9日 (月) 00:50時点における版
ctfWeightMapCreationとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-o | 選択 | 出力ファイル設定 | stdout |
-kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
-Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 1.7 |
-df | 必須 | デフォーカス量: [A] (+がアンダーフォーカス) | 2.7 |
-white | 選択 | 白色ノイズ比(Noise/Signal) | 1.0 |
-noise | 選択 | Noise Power Spectrum | NULL |
-splusn | 選択 | Signal+Noise Power Spectrum | NULL |
-dRinv | 必須 | dRinv[A] | 1024*5/3 |
-dRmaxInv | 必須 | dRmaxInv[A] | 10.0 |
-SinWin | 選択 | (RminInv[A], RmaxInv[A]) | (20.0, 10.0) |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | No correction : F = G |
1 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H))(Only 1 or -1) |
2 | Phase contrast : F = G*H (Winer filter (S/N << 1)) |
3 | Phase contrast : F = G/H (Inverse filter) |
4 | Phase contrast : F = G*(H/(H*H + N*N)) (Winer filter (white noise : Required Option -white)) |
5 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H)*abs(G*G-N*N)/(G*G)) (Winer filter: Required Option -noise, -splusn)) |
実行例
df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行
他のオプション設定なし
0.000000 1.000000 1.000000 0.000977 1.000000 -0.000000 0.001953 1.000000 -0.000001 0.002930 1.000000 -0.000002 0.003906 1.000000 -0.000003 0.004883 1.000000 -0.000005 0.005859 1.000000 -0.000007 0.006836 1.000000 -0.000009 0.007812 1.000000 -0.000011 0.008789 1.000000 -0.000014 -中略- 0.090820 1.000000 0.026869 0.091797 1.000000 0.028082 0.092773 1.000000 0.029335 0.093750 1.000000 0.030629 0.094727 1.000000 0.031964 0.095703 1.000000 0.033343 0.096680 1.000000 0.034765 0.097656 1.000000 0.036232 0.098633 1.000000 0.037744 0.099609 1.000000 0.039302
オプション -kV
kV=100で実行
0.000000 1.000000 1.000000 0.000977 1.000000 -0.000000 0.001953 1.000000 -0.000001 0.002930 1.000000 -0.000003 0.003906 1.000000 -0.000004 0.004883 1.000000 -0.000007 0.005859 1.000000 -0.000009 0.006836 1.000000 -0.000012 0.007812 1.000000 -0.000014 0.008789 1.000000 -0.000016 -中略- 0.090820 1.000000 0.089324 0.091797 1.000000 0.093274 0.092773 1.000000 0.097352 0.093750 1.000000 0.101561 0.094727 1.000000 0.105902 0.095703 1.000000 0.110378 0.096680 1.000000 0.114993 0.097656 1.000000 0.119748 0.098633 1.000000 0.124646 0.099609 1.000000 0.129690
オプション -Cs
Cs=で実行
0.000000 1.000000 1.000000 0.000977 1.000000 -0.000000 0.001953 1.000000 -0.000001 0.002930 1.000000 -0.000002 0.003906 1.000000 -0.000003 0.004883 1.000000 -0.000005 0.005859 1.000000 -0.000007 0.006836 1.000000 -0.000009 0.007812 1.000000 -0.000011 0.008789 1.000000 -0.000013 -中略- 0.090820 1.000000 0.031918 0.091797 1.000000 0.033352 0.092773 1.000000 0.034832 0.093750 1.000000 0.036361 0.094727 1.000000 0.037939 0.095703 1.000000 0.039567 0.096680 1.000000 0.041247 0.097656 1.000000 0.042979 0.098633 1.000000 0.044765 0.099609 1.000000 0.046605