defocusDeterminationFromThonRing
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defocusDeterminationFromThonRingとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 選択 | 入力ファイル設定 | stdin |
-iN | 選択 | InputNameInInformationFile | stdin |
-iR | 選択 | InputReferenceForLength | stdin |
-o | 選択 | 出力ファイル設定 | stdout |
-oI | 選択 | OutputInformationFile1(mrcImageMultiCTFCompensation and mrcImageCTFCompensation) | stdout |
-oI2 | 選択 | OutputInformationFile2(llDataCTFCompensate -I2) | stdout |
-oI3 | 選択 | OutputInformationFile3(llExtractWithLayerSeparation) Options: -truePitch, -PixelSize, -deltadY and -ctfMode |
stdout |
-kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
-Cs | 選択 | 球面収差: [mm] | 2.1 |
-AoveP | 選択 | The ratio of amplitude contrast to phase contrast | 0.05 |
-ctfMode | 選択 | CTFMode | 0 |
-truePitch | 選択 | True Pitch | 430 |
-PixelSize | 選択 | Pixel Size [A] | 5 |
-deltadY | 選択 | ||
-deltadY | 選択 | A range of deltadY to determine dY. | 0.5 |
-R | 選択 | 可変入力: ThonRing[/A] | NULL |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | |
1 |
CTFModeの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | Phase CTF |
1 | PhaseCTF + ratio*AmpCTF |