「llExtract」の版間の差分
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(同じ利用者による、間の4版が非表示) | |||
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− | '''llExtract'''とは[[Eos]]の[[コマンド]] | + | '''llExtract'''とは[[mrcImage]]([[FFT]])を[[LL]]に変換する[[Eos]]の[[コマンド]]である。出力ファイルは[[llDataPrint]] |
− | + | からグラフとして確認することが出来る。 | |
== オプション一覧 == | == オプション一覧 == | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-1</td> | <td>-1</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>出力ファイル | + | <td>出力ファイル: [[LL]](NearSide)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-2</td> | <td>-2</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>出力ファイル | + | <td>出力ファイル: [[LL]](FarSide)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行173: | 行173: | ||
</pre> | </pre> | ||
+ | <div>[[llExtractCtrlFileCreate]]にて作成することが出来る。</div> | ||
<div>入力されたオプションがある設定は読み込まないが、各設定値の行の省略は不可</div> | <div>入力されたオプションがある設定は読み込まないが、各設定値の行の省略は不可</div> | ||
<br> | <br> | ||
行178: | 行179: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
===[[:Media:1ATOMFil.fft|入力ファイル]]の画像=== | ===[[:Media:1ATOMFil.fft|入力ファイル]]の画像=== | ||
+ | <div>[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT.png]]<br> | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT.png]]<br> | ||
− | [[ | + | 全体<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT1.png]]<br> | ||
+ | 中心付近<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">サイズ<br> | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
行194: | 行199: | ||
<td><p align="left">( 512, 1146, 1)<br> | <td><p align="left">( 512, 1146, 1)<br> | ||
mrcComplexFloatFT <br> | mrcComplexFloatFT <br> | ||
− | ( 2. | + | ( 2.000, 2.000, 0.000)<br> |
− | + | 4.08519e-10 (257, 572, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.109661 (0, 0, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.00909953<br> |
− | 0. | + | 0.00776913<br> |
− | + | 1.01425e-05<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行206: | 行211: | ||
===オプション -c=== | ===オプション -c=== | ||
− | ====コンフィグファイル1==== | + | ====[[Media:Input-LLConf.txt|コンフィグファイル1]]==== |
<div>以下のデータで実行</div> | <div>以下のデータで実行</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | + | llData | |
− | 2 | + | 2 2 |
− | + | 255 572 | |
− | + | In | |
− | + | Nea | |
− | + | Far | |
+ | 0.0 | ||
+ | 0.0 | ||
+ | 0.0 | ||
0 | 0 | ||
0 | 0 | ||
+ | 0.0 | ||
+ | 256 | ||
+ | 12 | ||
+ | 1024 | ||
+ | 0 | ||
+ | 0 0 0 0 255 0 255 0.5 | ||
+ | 2 2 72 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 4 4 144 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | -3 11 -66 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | -1 13 6 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 1 15 78 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 3 17 150 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | -4 24 -60 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | -2 26 12 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 0 28 84 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 2 30 156 0 255 0 255 1.0 | ||
+ | 4 32 228 0 255 0 255 1.0 | ||
</pre> | </pre> | ||
行235: | 行248: | ||
<div>-1 のデータ</div> | <div>-1 のデータ</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ | + | LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ 5.00000e-01 0 0 |
− | + | 0.00000e+00 1.09661e-01 1.00179e-05 | |
− | + | 9.76562e-04 1.07064e-01 1.66569e-07 | |
− | 9. | + | 1.95312e-03 9.94539e-02 1.79314e-06 |
− | + | 2.92969e-03 8.73620e-02 1.63306e-06 | |
− | 1. | + | 3.90625e-03 7.16275e-02 9.95900e-07 |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
-中略- | -中略- | ||
− | + | 2.48047e-01 2.45430e-02 1.00179e-05 | |
− | + | 2.49023e-01 2.57134e-02 1.00179e-05 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
− | LAYERLINE 1 NEAR................................................................................ | + | LAYERLINE 1 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 2 2 |
− | + | 0.00000e+00 2.36747e-04 3.27016e+02 | |
− | + | 9.76562e-04 2.19473e-05 3.21478e+02 | |
− | 1. | + | 1.95312e-03 9.17815e-05 1.00204e+02 |
− | + | 2.92969e-03 2.42726e-04 4.08337e+01 | |
− | + | 3.90625e-03 7.48780e-04 1.25217e+01 | |
-中略- | -中略- | ||
− | + | 2.48047e-01 5.52613e-03 7.64794e+01 | |
− | + | 2.49023e-01 6.03607e-03 8.58422e+01 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
− | LAYERLINE 2 NEAR................................................................................ | + | LAYERLINE 2 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 4 4 |
− | + | 0.00000e+00 1.56065e-03 2.94032e+02 | |
− | + | 9.76562e-04 1.02912e-03 2.90051e+02 | |
− | + | 1.95312e-03 7.23528e-04 2.77422e+02 | |
− | 2. | + | 2.92969e-03 6.94803e-04 2.59534e+02 |
− | + | 3.90625e-03 8.97704e-04 2.50892e+02 | |
-中略- | -中略- | ||
− | + | LAYERLINE 3 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 -3 11 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | LAYERLINE 3 NEAR................................................................................ 1.00000e+ | + | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
-中略- | -中略- | ||
− | + | LAYERLINE 11 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 4 32 | |
− | + | ||
− | + | -中略- | |
− | + | ||
− | + | 2.45117e-01 2.10039e-02 3.42847e+02 | |
+ | 2.46094e-01 2.36644e-02 3.43764e+02 | ||
+ | 2.47070e-01 2.59560e-02 3.44583e+02 | ||
+ | 2.48047e-01 2.78412e-02 3.45314e+02 | ||
+ | 2.49023e-01 2.92789e-02 3.45958e+02 | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
</pre> | </pre> | ||
行304: | 行300: | ||
<div>-2 のデータ</div> | <div>-2 のデータ</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | LAYERLINE 0 FAR ................................................................................ | + | LAYERLINE 0 FAR ................................................................................ 5.00000e-01 0 0 |
− | + | 0.00000e+00 1.09661e-01 1.00179e-05 | |
− | + | 9.76562e-04 1.07064e-01 1.00179e-05 | |
− | 9. | + | 1.95312e-03 9.94539e-02 1.00179e-05 |
− | + | 2.92969e-03 8.73620e-02 1.00179e-05 | |
− | 1. | + | 3.90625e-03 7.16275e-02 1.00179e-05 |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
-中略- | -中略- | ||
− | + | 2.48047e-01 2.45430e-02 5.44967e-07 | |
− | + | 2.49023e-01 2.57134e-02 8.66931e-07 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
− | LAYERLINE 1 FAR ................................................................................ | + | LAYERLINE 1 FAR ................................................................................ 1.00000e+00 2 2 |
− | + | 0.00000e+00 2.36747e-04 3.27016e+02 | |
− | + | 9.76562e-04 5.38817e-04 3.33733e+02 | |
− | 1. | + | 1.95312e-03 9.34154e-04 3.39000e+02 |
− | + | 2.92969e-03 1.47219e-03 3.43420e+02 | |
− | + | 3.90625e-03 2.23950e-03 3.46949e+02 | |
-中略- | -中略- | ||
− | + | 2.48047e-01 6.32650e-03 7.40293e+01 | |
− | + | 2.49023e-01 6.41878e-03 8.40146e+01 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
− | LAYERLINE 2 FAR ................................................................................ | + | LAYERLINE 2 FAR ................................................................................ 1.00000e+00 4 4 |
− | + | 0.00000e+00 1.56065e-03 2.94032e+02 | |
− | + | 9.76562e-04 2.26294e-03 2.94056e+02 | |
− | + | 1.95312e-03 3.08391e-03 2.92763e+02 | |
− | 2. | + | 2.92969e-03 3.96259e-03 2.91127e+02 |
− | + | 3.90625e-03 4.82953e-03 2.89482e+02 | |
-中略- | -中略- | ||
− | + | LAYERLINE 3 FAR ................................................................................ 1.00000e+00 -3 11 | |
− | + | ||
− | + | -中略- | |
− | + | ||
− | + | LAYERLINE 11 FAR ................................................................................ 1.00000e+00 4 32 | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
-中略- | -中略- | ||
− | + | 2.45117e-01 2.58909e-02 3.47760e+02 | |
− | + | 2.46094e-01 2.80857e-02 3.47725e+02 | |
− | + | 2.47070e-01 2.95940e-02 3.47578e+02 | |
− | + | 2.48047e-01 3.04287e-02 3.47325e+02 | |
− | + | 2.49023e-01 3.06231e-02 3.46968e+02 | |
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
</pre> | </pre> | ||
<br> | <br> |
2015年3月18日 (水) 00:49時点における最新版
llExtractとはmrcImage(FFT)をLLに変換するEosのコマンドである。出力ファイルはllDataPrint からグラフとして確認することが出来る。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-t | 選択 | タイトル: ASCII[80] | NULL |
-s | 選択 | Step[A]: (xStep, yStep) | (1.0, 1.0) |
-M | 選択 | Max[GridUnit]: (MaxX, MaxY) | (1.0, 1.0) |
-i | 選択 | 入力ファイル: mrcImage(FFT) | NULL |
-1 | 選択 | 出力ファイル: LL(NearSide) | NULL |
-2 | 選択 | 出力ファイル: LL(FarSide) | NULL |
-R | 選択 | 回転角度: [Degree] | 0.0 |
-O | 選択 | Omega: [Degree] | 0.0 |
-S | 選択 | Shear: [Degree] | 0.0 |
-I | 選択 | ievery | 0 |
-axl | 選択 | axl | 0.0 |
-ayl | 選択 | ayl | 0.0 |
-x | 選択 | xShift: [GridUnit] | 0.0 |
-l | 選択 | llMax | 0 |
-d | 選択 | delRInv: [A] | 0.0 |
-f | 選択 | flagOutputInfo | |
-L | 選択 | 可変入力: LayerLineInfo: (n, l, Y, leftMin, leftMax, rightMin, rightMax, weight) ... | (0, 0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 1.0) |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定: ASCII | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-s: (Lengthx, Lengthy) に設定する必要がある
-d: Nx * Lengthx に設定する必要がある
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
コンフィグファイルのフォーマット
タイトル xStep yStep MaxX MaxY 入力ファイル名 出力ファイル名(NearSide) 出力ファイル名(FarSide) 回転角度 Omega Share ievery axl ayl xShift llMax delRInv flagOutputInfo n0 l0 Y0 leftMin0 leftMax0 rightMin0 rightMax0 weight0 n1 l1 Y1 leftMin1 leftMax1 rightMin1 rightMax1 weight1 . .
llExtractCtrlFileCreateにて作成することが出来る。
入力されたオプションがある設定は読み込まないが、各設定値の行の省略は不可
実行例
入力ファイルの画像
mrcFFTExpression(m=1)にて表示
サイズ モード |
( 512, 1146, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション -c
コンフィグファイル1
以下のデータで実行
llData 2 2 255 572 In Nea Far 0.0 0.0 0.0 0 0.0 0.0 256 12 1024 0 0 0 0 0 255 0 255 0.5 2 2 72 0 255 0 255 1.0 4 4 144 0 255 0 255 1.0 -3 11 -66 0 255 0 255 1.0 -1 13 6 0 255 0 255 1.0 1 15 78 0 255 0 255 1.0 3 17 150 0 255 0 255 1.0 -4 24 -60 0 255 0 255 1.0 -2 26 12 0 255 0 255 1.0 0 28 84 0 255 0 255 1.0 2 30 156 0 255 0 255 1.0 4 32 228 0 255 0 255 1.0
-1 のデータ
LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ 5.00000e-01 0 0 0.00000e+00 1.09661e-01 1.00179e-05 9.76562e-04 1.07064e-01 1.66569e-07 1.95312e-03 9.94539e-02 1.79314e-06 2.92969e-03 8.73620e-02 1.63306e-06 3.90625e-03 7.16275e-02 9.95900e-07 -中略- 2.48047e-01 2.45430e-02 1.00179e-05 2.49023e-01 2.57134e-02 1.00179e-05 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 LAYERLINE 1 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 2 2 0.00000e+00 2.36747e-04 3.27016e+02 9.76562e-04 2.19473e-05 3.21478e+02 1.95312e-03 9.17815e-05 1.00204e+02 2.92969e-03 2.42726e-04 4.08337e+01 3.90625e-03 7.48780e-04 1.25217e+01 -中略- 2.48047e-01 5.52613e-03 7.64794e+01 2.49023e-01 6.03607e-03 8.58422e+01 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 LAYERLINE 2 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 4 4 0.00000e+00 1.56065e-03 2.94032e+02 9.76562e-04 1.02912e-03 2.90051e+02 1.95312e-03 7.23528e-04 2.77422e+02 2.92969e-03 6.94803e-04 2.59534e+02 3.90625e-03 8.97704e-04 2.50892e+02 -中略- LAYERLINE 3 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 -3 11 -中略- LAYERLINE 11 NEAR................................................................................ 1.00000e+00 4 32 -中略- 2.45117e-01 2.10039e-02 3.42847e+02 2.46094e-01 2.36644e-02 3.43764e+02 2.47070e-01 2.59560e-02 3.44583e+02 2.48047e-01 2.78412e-02 3.45314e+02 2.49023e-01 2.92789e-02 3.45958e+02 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-2 のデータ
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