「llExtract」の版間の差分
提供: Eospedia
行210: | 行210: | ||
<pre> | <pre> | ||
LLData | LLData | ||
− | + | 2.5 2.5 | |
1 1 | 1 1 | ||
-iのファイル名 | -iのファイル名 | ||
行222: | 行222: | ||
0 | 0 | ||
0 | 0 | ||
− | + | 4 | |
− | + | 1280 | |
0 | 0 | ||
− | 10 | + | 1 15 6.25 10.0 50.0 10.0 50.0 40.0 |
+ | 2 2 15.0 20.0 60.0 20.0 60.0 30.0 | ||
+ | 2 30 22.5 30.0 70.0 30.0 70.0 20.0 | ||
+ | 3 11 26.25 40.0 80.0 40.0 80.0 10.0 | ||
</pre> | </pre> | ||
行232: | 行235: | ||
<div>-1 のデータ</div> | <div>-1 のデータ</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ | + | LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ 4.00000e+01 1 15 |
− | + | 7.81250e-03 4.75181e-03 3.45110e+00 | |
− | 1. | + | 8.59375e-03 4.93187e-03 1.28935e+01 |
− | + | 9.37500e-03 5.06885e-03 2.22849e+01 | |
− | 3. | + | 1.01562e-02 5.16248e-03 3.16742e+01 |
− | + | 1.09375e-02 5.21332e-03 4.11042e+01 | |
− | 6. | + | 1.17188e-02 5.22277e-03 5.06143e+01 |
− | + | 1.25000e-02 5.19300e-03 6.02422e+01 | |
− | 8. | + | 1.32813e-02 5.12698e-03 7.00254e+01 |
− | + | 1.40625e-02 5.02840e-03 8.00021e+01 | |
− | + | ||
− | + | -中略- | |
− | 1. | + | |
− | 1. | + | 3.59375e-02 1.42865e-03 7.60526e+01 |
− | 1. | + | 3.67187e-02 1.28697e-03 9.75779e+01 |
− | 1. | + | 3.75000e-02 1.22130e-03 1.21849e+02 |
− | 1. | + | 3.82813e-02 1.25465e-03 1.46886e+02 |
+ | 3.90625e-02 1.38519e-03 1.70028e+02 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 1 NEAR................................................................................ 3.00000e+01 2 2 | ||
+ | 1.56250e-02 2.45618e-02 4.26320e-01 | ||
+ | 1.64062e-02 2.51792e-02 6.55033e+00 | ||
+ | 1.71875e-02 2.56040e-02 1.28444e+01 | ||
+ | 1.79687e-02 2.58259e-02 1.93007e+01 | ||
+ | 1.87500e-02 2.58380e-02 2.59156e+01 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 4.37500e-02 1.16819e-02 5.55012e+01 | ||
+ | 4.45312e-02 1.08921e-02 6.66763e+01 | ||
+ | 4.53125e-02 1.00111e-02 7.87734e+01 | ||
+ | 4.60938e-02 9.08816e-03 9.21548e+01 | ||
+ | 4.68750e-02 8.19041e-03 1.07275e+02 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 2 NEAR................................................................................ 2.00000e+01 2 30 | ||
+ | 2.34375e-02 2.19277e-02 3.06912e+02 | ||
+ | 2.42187e-02 2.23369e-02 3.13087e+02 | ||
+ | 2.50000e-02 2.26138e-02 3.19446e+02 | ||
+ | 2.57812e-02 2.27523e-02 3.25992e+02 | ||
+ | 2.65625e-02 2.27487e-02 3.32729e+02 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 5.15625e-02 1.22076e-02 3.22988e+02 | ||
+ | 5.23437e-02 1.15468e-02 3.32616e+02 | ||
+ | 5.31250e-02 1.07697e-02 3.42527e+02 | ||
+ | 5.39063e-02 9.89288e-03 3.52883e+02 | ||
+ | 5.46875e-02 8.93828e-03 3.91357e+00 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 3 NEAR................................................................................ 1.00000e+01 3 11 | ||
+ | 3.12500e-02 1.85198e-02 2.63578e+02 | ||
+ | 3.20312e-02 1.86078e-02 2.70889e+02 | ||
+ | 3.28125e-02 1.86063e-02 2.78342e+02 | ||
+ | 3.35938e-02 1.85114e-02 2.85943e+02 | ||
+ | 3.43750e-02 1.83204e-02 2.93701e+02 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 5.93750e-02 1.79796e-02 3.19400e+02 | ||
+ | 6.01562e-02 1.80080e-02 3.28315e+02 | ||
+ | 6.09375e-02 1.78950e-02 3.37159e+02 | ||
+ | 6.17188e-02 1.76400e-02 3.45945e+02 | ||
+ | 6.25000e-02 1.72439e-02 3.54687e+02 | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
</pre> | </pre> | ||
行255: | 行304: | ||
<div>-2 のデータ</div> | <div>-2 のデータ</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | LAYERLINE 0 FAR ................................................................................ | + | LAYERLINE 0 FAR ................................................................................ 4.00000e+01 1 15 |
− | 6. | + | 7.81250e-03 4.27632e-03 6.07429e+01 |
− | 7. | + | 8.59375e-03 4.54366e-03 5.14264e+01 |
− | 8. | + | 9.37500e-03 4.76728e-03 4.23648e+01 |
− | 1. | + | 1.01562e-02 4.94371e-03 3.34829e+01 |
− | 1. | + | 1.09375e-02 5.07039e-03 2.47222e+01 |
− | 1. | + | 1.17188e-02 5.14562e-03 1.60346e+01 |
− | 1. | + | 1.25000e-02 5.16855e-03 7.37801e+00 |
− | 1. | + | 1.32813e-02 5.13916e-03 3.58712e+02 |
− | + | 1.40625e-02 5.05822e-03 3.49997e+02 | |
− | 1. | + | 1.48437e-02 4.92738e-03 3.41187e+02 |
− | 1. | + | |
− | 2. | + | -中略- |
− | 2. | + | |
− | + | 3.51562e-02 4.39810e-03 8.37058e+00 | |
− | + | 3.59375e-02 4.34286e-03 6.19610e-01 | |
− | 2. | + | 3.67187e-02 4.24027e-03 3.52995e+02 |
+ | 3.75000e-02 4.09173e-03 3.45481e+02 | ||
+ | 3.82813e-02 3.89925e-03 3.38068e+02 | ||
+ | 3.90625e-02 3.66543e-03 3.30750e+02 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 1 FAR ................................................................................ 3.00000e+01 2 2 | ||
+ | 1.56250e-02 2.49306e-02 1.39663e-01 | ||
+ | 1.64062e-02 2.57017e-02 3.53969e+02 | ||
+ | 1.71875e-02 2.62836e-02 3.47601e+02 | ||
+ | 1.79687e-02 2.66632e-02 3.41043e+02 | ||
+ | 1.87500e-02 2.68306e-02 3.34298e+02 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 4.37500e-02 1.52194e-02 3.14808e+02 | ||
+ | 4.45312e-02 1.42945e-02 3.04495e+02 | ||
+ | 4.53125e-02 1.32131e-02 2.93628e+02 | ||
+ | 4.60938e-02 1.20105e-02 2.81950e+02 | ||
+ | 4.68750e-02 1.07350e-02 2.69087e+02 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 2 FAR ................................................................................ 2.00000e+01 2 30 | ||
+ | 2.34375e-02 1.58475e-02 2.82280e+02 | ||
+ | 2.42187e-02 1.60496e-02 2.76790e+02 | ||
+ | 2.50000e-02 1.61500e-02 2.71070e+02 | ||
+ | 2.57812e-02 1.61427e-02 2.65119e+02 | ||
+ | 2.65625e-02 1.60238e-02 2.58933e+02 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 5.15625e-02 8.30352e-03 2.59903e+02 | ||
+ | 5.23437e-02 7.43559e-03 2.49610e+02 | ||
+ | 5.31250e-02 6.46842e-03 2.38266e+02 | ||
+ | 5.39063e-02 5.43589e-03 2.25119e+02 | ||
+ | 5.46875e-02 4.39760e-03 2.08723e+02 | ||
+ | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
+ | LAYERLINE 3 FAR ................................................................................ 1.00000e+01 3 11 | ||
+ | 3.12500e-02 2.01139e-02 3.48878e+02 | ||
+ | 3.20312e-02 2.00614e-02 3.41063e+02 | ||
+ | 3.28125e-02 1.98990e-02 3.33142e+02 | ||
+ | 3.35938e-02 1.96252e-02 3.25106e+02 | ||
+ | 3.43750e-02 1.92399e-02 3.16944e+02 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | 5.93750e-02 1.62983e-02 2.87742e+02 | ||
+ | 6.01562e-02 1.61019e-02 2.79858e+02 | ||
+ | 6.09375e-02 1.57728e-02 2.72147e+02 | ||
+ | 6.17188e-02 1.53151e-02 2.64624e+02 | ||
+ | 6.25000e-02 1.47348e-02 2.57313e+02 | ||
0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 | ||
</pre> | </pre> | ||
<br> | <br> |
2014年2月26日 (水) 08:39時点における版
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-t | 選択 | タイトル: ASCII[80] | NULL |
-s | 選択 | Step[A]: (xStep, yStep) | (1.0, 1.0) |
-M | 選択 | Max[GridUnit]: (MaxX, MaxY) | (1.0, 1.0) |
-i | 選択 | 入力ファイル: mrcImage(FFT) | NULL |
-1 | 選択 | 出力ファイル: NearSide: [llData] | NULL |
-2 | 選択 | 出力ファイル: FarSide: [llData] | NULL |
-R | 選択 | 回転角度: [Degree] | 0.0 |
-O | 選択 | Omega: [Degree] | 0.0 |
-S | 選択 | Shear: [Degree] | 0.0 |
-I | 選択 | ievery | 0 |
-axl | 選択 | axl | 0.0 |
-ayl | 選択 | ayl | 0.0 |
-x | 選択 | xShift: [GridUnit] | 0.0 |
-l | 選択 | llMax | 0 |
-d | 選択 | delRInv: [A] | 0.0 |
-f | 選択 | flagOutputInfo | |
-L | 選択 | 可変入力: LayerLineInfo: (n, l, Y, leftMin, leftMax, rightMin, rightMax, weight) ... | (0, 0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 1.0) |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定: ASCII | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-s: (Lengthx, Lengthy) に設定する必要がある
-d: Nx * Lengthx に設定する必要がある
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
コンフィグファイルのフォーマット
タイトル xStep yStep MaxX MaxY 入力ファイル名 出力ファイル名(NearSide) 出力ファイル名(FarSide) 回転角度 Omega Share ievery axl ayl xShift llMax delRInv flagOutputInfo n0 l0 Y0 leftMin0 leftMax0 rightMin0 rightMax0 weight0 n1 l1 Y1 leftMin1 leftMax1 rightMin1 rightMax1 weight1 . .
入力されたオプションがある設定は読み込まないが、各設定値の行の省略は不可
実行例
入力ファイルの画像
|
サイズ モード |
( 512, 1146, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション -c
コンフィグファイル1
以下のデータで実行
LLData 2.5 2.5 1 1 -iのファイル名 -1のファイル名 -2のファイル名 0 0 0 0 0 0 0 4 1280 0 1 15 6.25 10.0 50.0 10.0 50.0 40.0 2 2 15.0 20.0 60.0 20.0 60.0 30.0 2 30 22.5 30.0 70.0 30.0 70.0 20.0 3 11 26.25 40.0 80.0 40.0 80.0 10.0
-1 のデータ
LAYERLINE 0 NEAR................................................................................ 4.00000e+01 1 15 7.81250e-03 4.75181e-03 3.45110e+00 8.59375e-03 4.93187e-03 1.28935e+01 9.37500e-03 5.06885e-03 2.22849e+01 1.01562e-02 5.16248e-03 3.16742e+01 1.09375e-02 5.21332e-03 4.11042e+01 1.17188e-02 5.22277e-03 5.06143e+01 1.25000e-02 5.19300e-03 6.02422e+01 1.32813e-02 5.12698e-03 7.00254e+01 1.40625e-02 5.02840e-03 8.00021e+01 -中略- 3.59375e-02 1.42865e-03 7.60526e+01 3.67187e-02 1.28697e-03 9.75779e+01 3.75000e-02 1.22130e-03 1.21849e+02 3.82813e-02 1.25465e-03 1.46886e+02 3.90625e-02 1.38519e-03 1.70028e+02 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 LAYERLINE 1 NEAR................................................................................ 3.00000e+01 2 2 1.56250e-02 2.45618e-02 4.26320e-01 1.64062e-02 2.51792e-02 6.55033e+00 1.71875e-02 2.56040e-02 1.28444e+01 1.79687e-02 2.58259e-02 1.93007e+01 1.87500e-02 2.58380e-02 2.59156e+01 -中略- 4.37500e-02 1.16819e-02 5.55012e+01 4.45312e-02 1.08921e-02 6.66763e+01 4.53125e-02 1.00111e-02 7.87734e+01 4.60938e-02 9.08816e-03 9.21548e+01 4.68750e-02 8.19041e-03 1.07275e+02 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 LAYERLINE 2 NEAR................................................................................ 2.00000e+01 2 30 2.34375e-02 2.19277e-02 3.06912e+02 2.42187e-02 2.23369e-02 3.13087e+02 2.50000e-02 2.26138e-02 3.19446e+02 2.57812e-02 2.27523e-02 3.25992e+02 2.65625e-02 2.27487e-02 3.32729e+02 -中略- 5.15625e-02 1.22076e-02 3.22988e+02 5.23437e-02 1.15468e-02 3.32616e+02 5.31250e-02 1.07697e-02 3.42527e+02 5.39063e-02 9.89288e-03 3.52883e+02 5.46875e-02 8.93828e-03 3.91357e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 LAYERLINE 3 NEAR................................................................................ 1.00000e+01 3 11 3.12500e-02 1.85198e-02 2.63578e+02 3.20312e-02 1.86078e-02 2.70889e+02 3.28125e-02 1.86063e-02 2.78342e+02 3.35938e-02 1.85114e-02 2.85943e+02 3.43750e-02 1.83204e-02 2.93701e+02 -中略- 5.93750e-02 1.79796e-02 3.19400e+02 6.01562e-02 1.80080e-02 3.28315e+02 6.09375e-02 1.78950e-02 3.37159e+02 6.17188e-02 1.76400e-02 3.45945e+02 6.25000e-02 1.72439e-02 3.54687e+02 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-2 のデータ
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