「llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate」の版間の差分
提供: Eospedia
細 (Kinoshita がページ「LlExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate」を「llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate」に移動しました) |
(→メインオプション) |
||
(同じ利用者による、間の1版が非表示) | |||
行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>入力ファイル</td> | + | <td>入力ファイル: [[llData]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行20: | 行20: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行49: | 行49: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-truePitch</td> | <td>-truePitch</td> | ||
− | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>truePitch: [A]</td> | <td>truePitch: [A]</td> | ||
<td>770</td> | <td>770</td> | ||
行55: | 行55: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-rMax</td> | <td>-rMax</td> | ||
− | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>rMax: [A]</td> | <td>rMax: [A]</td> | ||
<td>50</td> | <td>50</td> | ||
行89: | 行89: | ||
<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
行105: | 行105: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
+ | ===[[:Media:1ATOMFil.fft|入力ファイル]]の画像=== | ||
+ | <div>[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT.png]]<br> | ||
+ | 全体<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT1.png]]<br> | ||
+ | 中心付近<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | Length<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">( 512, 1146, 1)<br> | ||
+ | mrcComplexFloatFT <br> | ||
+ | ( 2.000, 2.000, 0.000)<br> | ||
+ | 4.08519e-10 (257, 572, 0)<br> | ||
+ | 0.109661 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.00909953<br> | ||
+ | 0.00776913<br> | ||
+ | 1.01425e-05<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
+ | ====t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | LengthY 2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize 2.000000 [A/Pixel] | ||
+ | Final CalculatedY 6.296703 | ||
+ | CalculatedY 6 | ||
+ | Error[Pixel] -54 | ||
+ | 36 50.000000 0.100000 0.500000 | ||
+ | 0 0 3 0 28 -28 | ||
+ | 1 6 2 -13 15 | ||
+ | 2 12 3 2 -26 30 | ||
+ | 3 18 2 -11 17 | ||
+ | 4 24 3 4 -24 32 | ||
+ | 5 30 2 -9 19 | ||
+ | 6 36 2 6 -22 | ||
+ | 7 42 2 -7 21 | ||
+ | 8 48 2 8 -20 | ||
+ | 9 54 3 -5 23 -33 | ||
+ | 10 60 2 10 -18 | ||
+ | 11 66 3 -3 25 -31 | ||
+ | 12 72 2 12 -16 | ||
+ | 13 78 3 -1 27 -29 | ||
+ | 14 84 2 14 -14 | ||
+ | 15 90 3 1 -27 29 | ||
+ | 16 96 2 -12 16 | ||
+ | 17 102 3 3 -25 31 | ||
+ | 18 108 2 -10 18 | ||
+ | 19 114 3 5 -23 33 | ||
+ | 20 120 2 -8 20 | ||
+ | 21 126 2 7 -21 | ||
+ | 22 132 2 -6 22 | ||
+ | 23 138 2 9 -19 | ||
+ | 24 144 3 -4 24 -32 | ||
+ | 25 150 2 11 -17 | ||
+ | 26 156 3 -2 26 -30 | ||
+ | 27 162 2 13 -15 | ||
+ | 28 168 3 0 28 -28 | ||
+ | 29 174 2 -13 15 | ||
+ | 30 180 3 2 -26 30 | ||
+ | 31 186 2 -11 17 | ||
+ | 32 192 3 4 -24 32 | ||
+ | 33 198 2 -9 19 | ||
+ | 34 204 2 6 -22 | ||
+ | 35 210 2 -7 21 | ||
+ | </pre> |
2014年8月25日 (月) 01:48時点における最新版
llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 選択 | 入力ファイル: llData | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル: ASCII | stdout |
-t | 必須 | Turn | -13 |
-u | 必須 | Unit | 28 |
-N | 選択 | Helix | 1 |
-dY | 選択 | Position of the 1st layer line: [ピクセル] | 3 |
-truePitch | 必須 | truePitch: [A] | 770 |
-rMax | 必須 | rMax: [A] | 50 |
-RMax | 選択 | RMax: [A] | 0.1 |
-RZMax | 選択 | RZMax: [A] | 0.1 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
実行例
入力ファイルの画像
mrcFFTExpression(m=1)にて表示
サイズ モード |
( 512, 1146, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション必須項目のみの場合
t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行
LengthY 2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize 2.000000 [A/Pixel] Final CalculatedY 6.296703 CalculatedY 6 Error[Pixel] -54 36 50.000000 0.100000 0.500000 0 0 3 0 28 -28 1 6 2 -13 15 2 12 3 2 -26 30 3 18 2 -11 17 4 24 3 4 -24 32 5 30 2 -9 19 6 36 2 6 -22 7 42 2 -7 21 8 48 2 8 -20 9 54 3 -5 23 -33 10 60 2 10 -18 11 66 3 -3 25 -31 12 72 2 12 -16 13 78 3 -1 27 -29 14 84 2 14 -14 15 90 3 1 -27 29 16 96 2 -12 16 17 102 3 3 -25 31 18 108 2 -10 18 19 114 3 5 -23 33 20 120 2 -8 20 21 126 2 7 -21 22 132 2 -6 22 23 138 2 9 -19 24 144 3 -4 24 -32 25 150 2 11 -17 26 156 3 -2 26 -30 27 162 2 13 -15 28 168 3 0 28 -28 29 174 2 -13 15 30 180 3 2 -26 30 31 186 2 -11 17 32 192 3 4 -24 32 33 198 2 -9 19 34 204 2 6 -22 35 210 2 -7 21