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(メインオプション)
 
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<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>入力ファイル</td>  
+
<td>入力ファイル: [[llData]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>出力ファイル</td>  
+
<td>出力ファイル: [[ASCII]]</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行49: 行49:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-truePitch</td>  
 
<td>-truePitch</td>  
<td>選択</td>  
+
<td>必須</td>  
 
<td>truePitch: [A]</td>  
 
<td>truePitch: [A]</td>  
 
<td>770</td>  
 
<td>770</td>  
行55: 行55:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-rMax</td>  
 
<td>-rMax</td>  
<td>選択</td>  
+
<td>必須</td>  
 
<td>rMax: [A]</td>  
 
<td>rMax: [A]</td>  
 
<td>50</td>  
 
<td>50</td>  
行89: 行89:
 
<td> </td>  
 
<td> </td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
</table>  
+
</table>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
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== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[:Media:1ATOMFil.fft|入力ファイル]]の画像===
 +
<div>[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT.png]]<br>
 +
全体<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT1.png]]<br>
 +
中心付近<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">サイズ<br>
 +
モード<br>
 +
Length<br>
 +
最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">(      512,      1146,          1)<br>
 +
mrcComplexFloatFT <br>
 +
(    2.000,      2.000,      0.000)<br>
 +
4.08519e-10 (257, 572, 0)<br>
 +
0.109661 (0, 0, 0)<br>
 +
0.00909953<br>
 +
0.00776913<br>
 +
1.01425e-05<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
====t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行====
 +
<pre>
 +
LengthY    2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize        2.000000 [A/Pixel]
 +
Final CalculatedY        6.296703
 +
      CalculatedY                6 
 +
      Error[Pixel]            -54 
 +
36 50.000000 0.100000 0.500000
 +
0 0 3 0 28 -28
 +
1 6 2 -13 15
 +
2 12 3 2 -26 30
 +
3 18 2 -11 17
 +
4 24 3 4 -24 32
 +
5 30 2 -9 19
 +
6 36 2 6 -22
 +
7 42 2 -7 21
 +
8 48 2 8 -20
 +
9 54 3 -5 23 -33
 +
10 60 2 10 -18
 +
11 66 3 -3 25 -31
 +
12 72 2 12 -16
 +
13 78 3 -1 27 -29
 +
14 84 2 14 -14
 +
15 90 3 1 -27 29
 +
16 96 2 -12 16
 +
17 102 3 3 -25 31
 +
18 108 2 -10 18
 +
19 114 3 5 -23 33
 +
20 120 2 -8 20
 +
21 126 2 7 -21
 +
22 132 2 -6 22
 +
23 138 2 9 -19
 +
24 144 3 -4 24 -32
 +
25 150 2 11 -17
 +
26 156 3 -2 26 -30
 +
27 162 2 13 -15
 +
28 168 3 0 28 -28
 +
29 174 2 -13 15
 +
30 180 3 2 -26 30
 +
31 186 2 -11 17
 +
32 192 3 4 -24 32
 +
33 198 2 -9 19
 +
34 204 2 6 -22
 +
35 210 2 -7 21
 +
</pre>

2014年8月25日 (月) 01:48時点における最新版

llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: llData NULL
-o 選択 出力ファイル: ASCII stdout
-t 必須 Turn -13
-u 必須 Unit 28
-N 選択 Helix 1
-dY 選択 Position of the 1st layer line: [ピクセル] 3
-truePitch 必須 truePitch: [A] 770
-rMax 必須 rMax: [A] 50
-RMax 選択 RMax: [A] 0.1
-RZMax 選択 RZMax: [A] 0.1
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

1ATOMFil-FFT.png
全体

1ATOMFil-FFT1.png
中心付近

サイズ

モード
Length
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 512, 1146, 1)

mrcComplexFloatFT
( 2.000, 2.000, 0.000)
4.08519e-10 (257, 572, 0)
0.109661 (0, 0, 0)
0.00909953
0.00776913

1.01425e-05


オプション必須項目のみの場合

t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行

LengthY     2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize        2.000000 [A/Pixel]
Final CalculatedY         6.296703
      CalculatedY                6  
      Error[Pixel]             -54  
36 50.000000 0.100000 0.500000
0 0 3 0 28 -28 
1 6 2 -13 15 
2 12 3 2 -26 30 
3 18 2 -11 17 
4 24 3 4 -24 32 
5 30 2 -9 19 
6 36 2 6 -22 
7 42 2 -7 21 
8 48 2 8 -20 
9 54 3 -5 23 -33 
10 60 2 10 -18 
11 66 3 -3 25 -31 
12 72 2 12 -16 
13 78 3 -1 27 -29 
14 84 2 14 -14 
15 90 3 1 -27 29 
16 96 2 -12 16 
17 102 3 3 -25 31 
18 108 2 -10 18 
19 114 3 5 -23 33 
20 120 2 -8 20 
21 126 2 7 -21 
22 132 2 -6 22 
23 138 2 9 -19 
24 144 3 -4 24 -32 
25 150 2 11 -17 
26 156 3 -2 26 -30 
27 162 2 13 -15 
28 168 3 0 28 -28 
29 174 2 -13 15 
30 180 3 2 -26 30 
31 186 2 -11 17 
32 192 3 4 -24 32 
33 198 2 -9 19 
34 204 2 6 -22 
35 210 2 -7 21