「lmrcImageClusterAnalysis(API)」の版間の差分
提供: Eospedia
(→画像間の距離) |
|||
| 行70: | 行70: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>lmrcImageClusterAnalysisModeEuclidDistance</td> | <td>lmrcImageClusterAnalysisModeEuclidDistance</td> | ||
| − | <td></td> | + | <td>lmrcImageEuclidDistanceCalc2から算出</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethod</td> | <td>lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethod</td> | ||
| − | <td></td> | + | <td>lmrcImageEuclidDistanceCalc2から算出して二乗する</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethodLinearCorrelation</td> | <td>lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethodLinearCorrelation</td> | ||
| − | <td></td> | + | <td>d=lmrcImageLinearCorrelation2から算出し、exp(SQR(d-1.0)/(1/log(1e4)))-1.0とする</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>lmrcImageClusterAnalysisModeLinearCorrelation</td> | <td>lmrcImageClusterAnalysisModeLinearCorrelation</td> | ||
| − | <td></td> | + | <td>上記と同じ</td> |
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
2015年3月3日 (火) 02:59時点における版
DataManip/mrcImage/src/lmrcImageClusterAnalysisはmrcImageClusterAnalysisのためのAPI です。
定数
構造体
typedef enum lmrcImageClusterAnalysisMode {
lmrcImageClusterAnalysisModeCorrelation = 0,
lmrcImageClusterAnalysisModeEuclidDistance = 1,
lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethod = 2,
lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethodLinearCorrelation = 3,
lmrcImageClusterAnalysisModeLinearCorrelation = 4
} lmrcImageClusterAnalysisMode;
#ifdef GLOBAL_DECLARATION
char* lmrcImageClusterAnalysisModeMessage[] = {
"By Correlation",
"By Euclid Distance",
"By Ward Method (default) : Euclid Length (no rotation) or its square (rotation)",
"By Ward Method using Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)",
"By Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)",
NULL
};
#endif
typedef struct lmrcImageClusterAnalysisInfo {
lmrcImageClusterAnalysisMode mode; /* ClusterAnalysisMode */
int flagIteration; /* */
int flagAutoRotation;
char** filename; /* filename */
int correlationMode; /* correlationMode */
mrcImage* averagedImage;
lmrcImageAutoRotationCorrelationInfo arInitial;
int flagPVM;
int flagLogIn;
FILE* fptLogIn;
int previousFileNumber;
int flagLog;
FILE* fptLog; /* All Log */
int flagLog2;
FILE* fptLog2; /* Cluster Node Log */
/* Output */
float** Distance;
} lmrcImageClusterAnalysisInfo;
API
クラスター解析
void lmrcImageClusterAnalysis(int* group, mrcImage* in, int finalclusternum, int N, lmrcImageClusterAnalysisInfo* linfo);
平均画像のマージ（in1に上書きします）
void lmrcImageClusterMerge(mrcImage* in1, mrcImage* in2, int* index, int* averagednum, int m, int n, int* N);
画像間の距離
2画像in1, in2間の距離を算出し、disへ格納します。
void lmrcImageDistanceCalc(float* dis, mrcImage* in1, mrcImage* in2, int mode);
| mode | 距離の算出方法 |
|---|---|
| lmrcImageClusterAnalysisModeCorrelation | lmrcImageCorrelationinSpaceから算出して-1を掛ける |
| lmrcImageClusterAnalysisModeEuclidDistance | lmrcImageEuclidDistanceCalc2から算出 |
| lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethod | lmrcImageEuclidDistanceCalc2から算出して二乗する |
| lmrcImageClusterAnalysisModeWardMethodLinearCorrelation | d=lmrcImageLinearCorrelation2から算出し、exp(SQR(d-1.0)/(1/log(1e4)))-1.0とする |
| lmrcImageClusterAnalysisModeLinearCorrelation | 上記と同じ |
float lmrcImageDistanceCalcByWardMethod(mrcImage* in1, mrcImage* in2, int num1, int num2, int mode);
float lmrcImageDistanceCalcWithAutoRotation(mrcImage* out, mrcImage* cor, mrcImage* in1, mrcImage* in2, lmrcImageAutoRotationCorrelationInfo* linfo, int lmode, int mode);
| mode | 距離の算出方法 |
|---|---|
| lmrcImageClusterAnalysisModeCorrelation | |
| lmrcImageClusterAnalysisModeEuclidDistance | |
| lmrcImageClusterAnalysisModeLinearCorrelation |
float lmrcImageDistanceCalcByWardMethodWithAutoRotation(mrcImage* out, mrcImage* cor, mrcImage* in1, mrcImage* in2, int num1, int num2, lmrcImageAutoRotationCorrelationInfo* linfo, int lmode, int mode);
float lmrcImageClusterAnalysisByIteration(int* group, mrcImage* in, int clusternum, int N, int mode);
ファイル入出力
ログの書き出し
void lmrcImageClusterAnalysisDistanceToLog(FILE* fpt, int n, int m, int prevM, int prevN, float distance);
ログの読み込み
void lmrcImageClusterAnalysisDistanceFromLog(int* skip, float* distance, FILE* fpt);
