lpdbSurface(API)

DataManip/pdbFile/src/lpdbSurfaceはpdbSurfaceのためのAPI です。

定数

lpdbSurfaceAsTemperatureFactorの引数modeで使用します。

typedef enum lpdbSurfaceMode {
	lpdbSurfaceModeSimple=0
} lpdbSurfaceMode;

構造体

typedef struct lpdbSurfaceInfo {
	double order;  /* Angstrom */
	int    refine; /* mesh size is equal to order/refine */ 
	int    size;   /* contour surface thickness is equal to order/refine*(2*size+1) */
	double mergin; /* Search Area */
	double weight; /* Weight Value */
	double thresHold; /* exp(-thresHold) */
	int    DensityMode;
} lpdbSurfaceInfo;

API

温度因子を算出し、pdb->PDB->TemperatureFactorへ格納します。

extern void lpdbSurfaceAsTemperatureFactor(pdbFile* pdb, lpdbSurfaceInfo* info, lpdbSurfaceMode mode);