「mrc2Dto3D」の版間の差分

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== オプション一覧 ==
 
== オプション一覧 ==
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<th>オプション</th>
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<th>必須項目/選択項目</th>
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<th>説明</th>
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<th>デフォルト</th>
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<tr>
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<td>-i</td>
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<td>選択</td>
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<td>入力ファイル設定</td>
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<td>NULL</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-I</td>
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<td>選択</td>
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<td>入力ファイル設定</td>
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<td>NULL</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-o</td>
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<td>必須</td>
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<td>出力ファイル設定</td>
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<td>NULL</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-O</td>
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<td>選択</td>
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<td>出力ファイル設定</td>
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<td>NULL</td>
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<tr>
 +
<td>-single</td>
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<td>選択</td>
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<td>傾斜軸を一つに設定</td>
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<td>1</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-InterpolationMode</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>展開モード</td>
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<td>1</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-Double</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>傾斜軸を2つに設定</td>
 +
<td> </td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-DoubleCounter</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
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2つの傾斜軸を選択し、設定する</td>
 +
<td>NULL</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-CounterThreshold</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
 +
波形の谷の閾値</td>
 +
<td>1e-6</td>
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</tr>
 +
<tr>
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<td>-CounterThresholdMode</td>
 +
<td>選択</td>
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<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
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波形の谷の閾値のモード</td>
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<td>0</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-WeightMode</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
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重心のモード</td>
 +
<td>0</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-thicknessWeight</td>
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<td>選択</td>
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<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
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重心の深さ</td>
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<td> </td>
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</tr>
 +
<tr>
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<td>-Sub</td>
 +
<td>選択</td>
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<td>-Doubleを宣言した上で使用<br>
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下位サンプリング</td>
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<td>1</td>
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</tr>
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<tr>
 +
<td>-PlusXrot</td>
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<td>選択</td>
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<td>rasmolのためにx軸を180°回転</td>
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<td> </td>
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</tr>
 +
<tr>
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<td>-SIRT</td>
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<td>選択</td>
 +
<td>同時反復再構成法</td>
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<td> </td>
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</tr>
 +
<tr>
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<td>-max</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>-SIRTを宣言した上で使用<br>
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同時反復再構成法の最大値設定</td>
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<td>30</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-rms</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>-SIRTを宣言した上で使用<br>
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同時反復再構成法の平方2乗平均を設定</td>
 +
<td>1.0</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-CTF</td>
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<td>選択</td>
 +
<td>-SIRTを宣言した上で使用<br>
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CTFInfoファイルを設定</td>
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<td>NULL</td>
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</tr>
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<tr>
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<td>-m</td>
 +
<td>選択</td>
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<td>モード</td>
 +
<td>0</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-h</td>
 +
<td>選択</td>
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<td>ヘルプを表示</td>
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<td> </td>
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2010年11月8日 (月) 09:19時点における版

mrc2Dto3D電子顕微鏡画像である2D画像3D画像にするEosコマンドである。

オプション一覧

</table>
オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル設定 NULL
-I 選択 入力ファイル設定 NULL
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-O 選択 出力ファイル設定 NULL
-single 選択 傾斜軸を一つに設定 1
-InterpolationMode 選択 展開モード 1
-Double 選択 傾斜軸を2つに設定  
-DoubleCounter 選択 -Doubleを宣言した上で使用
2つの傾斜軸を選択し、設定する
NULL
-CounterThreshold 選択 -Doubleを宣言した上で使用
波形の谷の閾値
1e-6
-CounterThresholdMode 選択 -Doubleを宣言した上で使用
波形の谷の閾値のモード
0
-WeightMode 選択 -Doubleを宣言した上で使用
重心のモード
0
-thicknessWeight 選択 -Doubleを宣言した上で使用
重心の深さ
 
-Sub 選択 -Doubleを宣言した上で使用
下位サンプリング
1
-PlusXrot 選択 rasmolのためにx軸を180°回転  
-SIRT 選択 同時反復再構成法  
-max 選択 -SIRTを宣言した上で使用
同時反復再構成法の最大値設定
30
-rms 選択 -SIRTを宣言した上で使用
同時反復再構成法の平方2乗平均を設定
1.0
-CTF 選択 -SIRTを宣言した上で使用
CTFInfoファイルを設定
NULL
-m 選択 モード 0
-h 選択 ヘルプを表示