「mrc2bild」の版間の差分

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(実行例)
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  mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere.bild -zoom 0.01 -m 1
 
  mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere.bild -zoom 0.01 -m 1
 
  mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere2.bild -zoom 0.02 -m 1 -skip 3 3 3
 
  mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere2.bild -zoom 0.02 -m 1 -skip 3 3 3
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[[画像:test.mrc3d.png]]
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[[画像:test-arrow.bild.png]]
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[[画像:test-arrow2.bild.png]]
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[[画像:test-sphere.bild.png]]
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[[画像:test-sphere2.bild.png]]

2015年11月11日 (水) 07:58時点における版

mrc2bildとは、mrcファイルからbild形式のファイル(chimera)に変換することを実施するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル設定(1個:スカラー)::mrcImage NULL
-i3 選択 入力ファイル設定(3個:ベクトル): mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル設定 bild NULL
-color 選択 色の設定(デフォールト:白 r, g, b) 1.0 1.0 1.0
-zoom 選択 拡大率 1.0
-arrow 選択 矢印の形 0.1 0.4 0.75
-skip 選択 ボクセルのスキップ 1 1 1
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 Arrows (-i3)
1 Spheres (-i)


実行例

mrc2bid -i3 data/test.mrc3d data/test.mrc3d data/test.mrc3d -o data/test-arrow.bild  -zoom 0.01
mrc2bild -i3 data/test.mrc3d data/test.mrc3d data/test.mrc3d -o data/test-arrow2.bild  -zoom 0.02 -skip 3 3 3
mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere.bild -zoom 0.01 -m 1
mrc2bild -i data/test.mrc3d -o data/test-sphere2.bild -zoom 0.02 -m 1 -skip 3 3 3


test.mrc3d.png test-arrow.bild.png test-arrow2.bild.png test-sphere.bild.png test-sphere2.bild.png