「mrcImage1dShiftByCorrelation」の版間の差分

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行89:		行89:
	sigpos0  sigval0		sigpos0  sigval0
	sigpos1  sigval1		sigpos1  sigval1
−	.
	.		.
	.		.
行97:		行96:
	== 実行例 ==		== 実行例 ==
−	===[[:Media:Input-1VOM-Rot1-2D.mrc|入力ファイル]]の画像===	+	===[[:Media:Input-1VOM-N-1D.mrc|入力ファイル]]の画像===
−	<table>	+	<table>
−	<tr>	+	<tr>
−	<td>[[画像:Input-1VOM-Rot1-2D.png]]</td>	+	<td>[[画像:Input-1VOM-N-1D.png]]</td>
−	<td><p align="left">最小<br>	+	<td><p align="left">最小<br>
−	最大<br>	+	最大<br>
−	平均値<br>	+	平均値<br>
−	標準偏差<br>	+	標準偏差<br>
−	標準誤差<br></p>	+	標準誤差<br></p>
−	</td>	+	</td>
−	<td><p align="left">-2.31309e-06 (29, 7, 0)<br>	+	<td><p align="left">-24564.9 (1, 0, 0)<br>
−	49749.2 (52, 51, 0)<br>	+	1.12206e+06 (40, 0, 0)<br>
−	6572.32<br>	+	577190<br>
−	8769.91<br>	+	290698<br>
−	109.624<br></p>	+	22981.7<br></p>
−	</td>	+	</td>
−	</tr>	+	</tr>
−	</table>	+	</table>
	<br>		<br>
−	===[[:Media:Input-1VOM-2D.mrc|参照ファイル]]の画像===	+	===[[:Media:Input-1VOM-1D.mrc|参照ファイル]]の画像===
	<table>		<table>
	<tr>		<tr>
−	<td>[[画像:Input-1VOM-2D.png]]</td>	+	<td>[[画像:Input-1VOM-1D.png]]</td>
	<td><p align="left">最小<br>		<td><p align="left">最小<br>
	最大<br>		最大<br>
行127:		行126:
	標準誤差<br></p>		標準誤差<br></p>
	</td>		</td>
−	<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>	+	<td><p align="left">9528.98 (1, 0, 0)<br>
−	49749.7 (27, 28, 0)<br>	+	1.05166e+06 (41, 0, 0)<br>
−	7212.9<br>	+	577032<br>
−	8827.15<br>	+	281935<br>
−	110.339<br></p>	+	22288.9<br></p>
	</td>		</td>
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
		+	<br>
		+
		+	===-s のデータ===
		+	<pre>
		+	0 1
		+	1 1
		+
		+	</pre>
		+	<br>
		+
		+	===オプション必須項目のみの場合===
		+	<div>出力結果</div>
		+	<pre>
		+	start1
		+	corstart
		+	0 -0.0184223
		+	1 -0.0573648
		+	2 -0.0963073
		+	3 -0.13525
		+	4 -0.174192
		+
		+	-中略-
		+
		+	35 -1.38141
		+	36 -1.42035
		+	37 -1.45929
		+	38 -1.49824
		+	39 -1.53718
		+
		+	-中略-
		+
		+	75 -0.17629
		+	76 -0.137348
		+	77 -0.0984052
		+	78 -0.0594627
		+	79 -0.0205202
		+	Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
		+	</pre>
	<br>		<br>
行143:		行180:
	start1		start1
	corstart		corstart
−	0 -1.3806	+	0 -0.0184223
−	1 -1.51544	+	1 -0.0573648
−	2 -1.50183	+	2 -0.0963073
−	3 -1.50929	+	3 -0.13525
−	4 -1.56575	+	4 -0.174192
		+
		+	-中略-
		+
		+	35 -1.38141
		+	36 -1.42035
		+	37 -1.45929
		+	38 -1.49824
		+	39 -1.53718
		+	Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
		+	</pre>
		+	<br>
		+
		+	===オプション　-d===
		+	====d=0.5で実行====
		+	<div>出力結果</div>
		+	<pre>
		+	start1
		+	corstart
		+	0 -0.0184223
		+	0.5 -0.0378935
		+	1 -0.0573648
		+	1.5 -0.076836
		+	2 -0.0963073
		+	2.5 -0.115779
		+	3 -0.13525
		+	3.5 -0.154721
		+	4 -0.174192
		+
		+	-中略-
		+
		+	35 -1.38141
		+	35.5 -1.40088
		+	36 -1.42035
		+	36.5 -1.43982
		+	37 -1.45929
		+	37.5 -1.47877
		+	38 -1.49824
		+	38.5 -1.51771
		+	39 -1.53718
		+	39.5 -1.55665
		+	Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
		+	</pre>
		+	<br>
		+
		+	===オプション　-norm===
		+	<div>出力結果</div>
		+	<pre>
		+	0 -0.0371553
		+	1 -0.115694
		+	2 -0.194234
		+	3 -0.272774
		+	4 -0.351314
		+
		+	-中略-
		+
		+	75 -0.355545
		+	76 -0.277005
		+	77 -0.198465
		+	78 -0.119926
		+	79 -0.0413864
		+	Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0371553
		+	</pre>
		+	<br>
		+
		+	===オプション　-m===
		+	====m=1で実行====
		+	<div>出力結果</div>
		+	<pre>
		+	start1
		+	corstart
		+	0 0.999919
		+	1 0.999344
		+	2 0.998179
		+	3 0.996434
		+	4 0.994119
		+
		+	-中略-
−	35 -1.70977	+	75 0.993978
−	36 -1.65662	+	76 0.996324
−	37 -1.64502	+	77 0.9981
−	38 -1.66481	+	78 0.999296
−	39 -1.70334	+	79 0.999903
−	Input-1VOM-Rot1-2D.mrc Input-1VOM-2D.mrc 0.000000 -1.3806	+	Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 0.999919
	</pre>		</pre>
	<br>		<br>

---

2014年3月25日 (火) 06:40時点における最新版

mrcImage1dShiftByCorrelationとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-r	必須	参照ファイル: mrcImage	NULL
-range	選択	Search range of shift.	0
-s	必須	File to define position of signal: ASCII	NULL
-d	選択	Spacing of molecule(Pixel)	1.0
-norm	選択	Normalize before correlation
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	Phase residual
1	Normal correlation

-s のフォーマット

sigpos0  sigval0
sigpos1  sigval1
.
.

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-24564.9 (1, 0, 0) 1.12206e+06 (40, 0, 0) 577190 290698 22981.7

参照ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

9528.98 (1, 0, 0) 1.05166e+06 (41, 0, 0) 577032 281935 22288.9

-s のデータ

0	1
1	1

オプション必須項目のみの場合

start1 
corstart
0 -0.0184223 
1 -0.0573648 
2 -0.0963073 
3 -0.13525 
4 -0.174192 

-中略-

35 -1.38141 
36 -1.42035 
37 -1.45929 
38 -1.49824 
39 -1.53718 

-中略-

75 -0.17629 
76 -0.137348 
77 -0.0984052 
78 -0.0594627 
79 -0.0205202 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223

オプション　-range

range=40で実行

start1 
corstart
0 -0.0184223 
1 -0.0573648 
2 -0.0963073 
3 -0.13525 
4 -0.174192  

-中略-

35 -1.38141 
36 -1.42035 
37 -1.45929 
38 -1.49824 
39 -1.53718 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223

オプション　-d

d=0.5で実行

start1 
corstart
0 -0.0184223 
0.5 -0.0378935 
1 -0.0573648 
1.5 -0.076836 
2 -0.0963073 
2.5 -0.115779 
3 -0.13525 
3.5 -0.154721 
4 -0.174192 

-中略-

35 -1.38141 
35.5 -1.40088 
36 -1.42035 
36.5 -1.43982 
37 -1.45929 
37.5 -1.47877 
38 -1.49824 
38.5 -1.51771 
39 -1.53718 
39.5 -1.55665 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223

オプション　-norm

0 -0.0371553 
1 -0.115694 
2 -0.194234 
3 -0.272774 
4 -0.351314 

-中略-

75 -0.355545 
76 -0.277005 
77 -0.198465 
78 -0.119926 
79 -0.0413864 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0371553

オプション　-m

m=1で実行

start1 
corstart
0 0.999919 
1 0.999344 
2 0.998179 
3 0.996434 
4 0.994119 

-中略-

75 0.993978 
76 0.996324 
77 0.9981 
78 0.999296 
79 0.999903 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 0.999919