「mrcImage2DProjection」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
(ページの作成:「'''MrcImage2DProjection'''とは2D投影を行うEosコマンドである。 == オプション一覧 == <table border="1"> <tr> <th>オプショ...」)
 
 
(2人の利用者による、間の4版が非表示)
行1: 行1:
'''MrcImage2DProjection'''とは2D[[投影]]を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。
+
'''mrcImage2DProjection'''とは2D[[投影]]を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。
 +
繊維状の構造がz軸方向に伸びている場合に利用する物である。
 +
基本的にx軸に沿った投影を行っている。
 +
内部では、[[lmrcRefFilamentProjection]]が呼び出されており、x軸方向の大きさ(y軸方向と同じ大きさであることが想定されている)とz軸方向の大きさが投影像のx、y方向のピクセル数である点を注意せよ。
  
 
== オプション一覧 ==
 
== オプション一覧 ==
行39: 行42:
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 +
<tr>
 +
<td>-c</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>コンフィグファイル設定</td>
 +
<td>NULL</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-m</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>モードを設定</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-h</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>ヘルプを表示</td>
 +
<td> </td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
== 実行例 ==
 +
===[[Media:Input-ThickFilaments0.mrc | 入力ファイル]]のデータ===
 +
 +
<pre>
 +
N            : (        69,        69,        100)
 +
Mode        :          2  mrcFloatImage       
 +
StartN      : (        0,          0,          0)
 +
M            : (        1,          1,          1)
 +
Length      : (    10.000,    10.000,    10.000)
 +
A,B,G        : (    90.00,      90.00,      90.00)
 +
C,R,S        : (        1,          2,          3)
 +
Min,Max,Mean : (        0,      1.44,    0.00306)
 +
</pre>
 +
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>-h</td>  
+
<td>[[画像:Outdata-mrcImage2DProjection.png]]</td>  
<td>選択</td>  
+
<td><p align="left">最小<br>
<td>ヘルプを表示</td>  
+
最大<br>
<td> </td>  
+
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>  
 +
<td><p align="left">-0.787823 (24, 61, 0)<br>
 +
3.86799 (20, 24, 0)<br>
 +
0.207849<br>
 +
0.552886<br>
 +
0.00660825<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
===オプション -w===
 +
====w=15で実行====
 +
<table>
 +
<tr>  
 +
<td>[[画像:Outdata-w-mrcImage2DProjection.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.840167 (22, 38, 0)<br>
 +
3.50401 (20, 47, 0)<br>
 +
0.296917<br>
 +
0.622977<br>
 +
0.00889967<br></p>
 +
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
  
 +
===オプション -p===
 +
====p=15で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-p-mrcImage2DProjection.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.611925 (45, 54, 0)<br>
 +
4.39429 (20, 61, 0)<br>
 +
0.207956<br>
 +
0.579118<br>
 +
0.00692178<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
  
== 実行例 ==
+
===オプション -a===
 +
====a=15で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-a-mrcImage2DProjection.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.07764 (30, 22, 0)<br>
 +
4.35892 (28, 31, 0)<br>
 +
0.202807<br>
 +
0.547871<br>
 +
0.00646751<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>

2013年12月18日 (水) 02:27時点における最新版

mrcImage2DProjectionとは2D投影を行うEosコマンドである。 繊維状の構造がz軸方向に伸びている場合に利用する物である。 基本的にx軸に沿った投影を行っている。 内部では、lmrcRefFilamentProjectionが呼び出されており、x軸方向の大きさ(y軸方向と同じ大きさであることが想定されている)とz軸方向の大きさが投影像のx、y方向のピクセル数である点を注意せよ。

オプション一覧

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 NULL
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-w 選択 Omega 0
-p 選択 Phi 0
-a 選択 Alpha 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  


実行例

入力ファイルのデータ

N            : (        69,         69,        100)
Mode         :           2  mrcFloatImage         
StartN       : (         0,          0,          0)
M            : (         1,          1,          1)
Length       : (    10.000,     10.000,     10.000)
A,B,G        : (     90.00,      90.00,      90.00)
C,R,S        : (         1,          2,          3)
Min,Max,Mean : (         0,       1.44,    0.00306)


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImage2DProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.787823 (24, 61, 0)

3.86799 (20, 24, 0)
0.207849
0.552886

0.00660825

オプション -w

w=15で実行

Outdata-w-mrcImage2DProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.840167 (22, 38, 0)

3.50401 (20, 47, 0)
0.296917
0.622977

0.00889967

オプション -p

p=15で実行

Outdata-p-mrcImage2DProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.611925 (45, 54, 0)

4.39429 (20, 61, 0)
0.207956
0.579118

0.00692178

オプション -a

a=15で実行

Outdata-a-mrcImage2DProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.07764 (30, 22, 0)

4.35892 (28, 31, 0)
0.202807
0.547871

0.00646751