「mrcImage3DWindowing」の版間の差分

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(→‎オプション　-w)
(他の1人の利用者による、間の4版が非表示)
行110: 行110:
 
</td>  
 
</td>  
 
<td><p align="left">0<br>  
 
<td><p align="left">0<br>  
−
60.6<br>  
+
2<br>  
−
26.9463<br>  
+
0.384947<br>  
−
22.1197<br>  
+
0.605556<br>  
−
0.264381<br></p>  
+
0.00086508<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行140: 行140:
  
 
===オプション　-w===
 
===オプション　-w===
−
====w=(50, 50, 50)で実行====  
+
モード：０での実行に対応
 +
====w=(30, 30, 30)で実行====  
 +
ガウス関数の各方向の幅（各方位毎に1/eとなる幅）を-wで設定
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-w50-mrcImage3DWindowing.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Outdata-w30-mrcImage3DWindowing.png]]</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行151: 行153:
 
</td>  
 
</td>  
 
<td><p align="left">0<br>  
 
<td><p align="left">0<br>  
−
1.56886<br>  
+
1.01888<br>  
−
0.137331<br>  
+
0.0335928<br>  
−
0.245037<br>  
+
0.0897063<br>  
−
0.000350053<br></p>  
+
0.000128152<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
===オプション　-center===
 +
====w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-w30-center50-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0<br>
 +
1.97241<br>
 +
0.211832<br>
 +
0.358028<br>
 +
0.000511469<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1, w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.384876<br>
 +
1.61512<br>
 +
0.000101475<br>
 +
0.0101141<br>
 +
1.44488e-05<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
  
−
===オプション　-===
+
=====r=10で実行=====
−
====で実行====  
+
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1r-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.37003<br>
 +
1.62997 <br>
 +
0.0205337<br>
 +
0.160314<br>
 +
0.00022902<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====wr=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1wr-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.192438<br>
 +
0.807562<br>
 +
0.000716062<br>
 +
0.0127312<br>
 +
1.81875e-05<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====wz=10, r=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1wz-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.37003 <br>
 +
1.62997 <br>
 +
0.0203072<br>
 +
0.156551<br>
 +
0.000223645<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
====m=2, w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td></td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0<br>
 +
0<br>
 +
nan<br>
 +
nan<br>
 +
nan<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====r=20で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m2r-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0<br>
 +
2<br>
 +
0.0551567<br>
 +
0.263582<br>
 +
0.000376545<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====wr=30で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m2wr-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0<br>
 +
2<br>
 +
0.0264886<br>
 +
0.18454<br>
 +
0.000263629<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
====m=3で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m3-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0<br>
 +
0.815055<br>
 +
1.66338e-06<br>
 +
0.00116436<br>
 +
1.66338e-06<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====r=20で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m3r-mrcImage3DWindowing.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.353868<br>
 +
1.64613<br>
 +
0.0310787<br>
 +
0.202673<br>
 +
0.000289533<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
=====wr=30, r=20で実行=====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata--mrcImage3DWindowing.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Outdata-m3wr-mrcImage3DWindowing.png]]</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行170: 行366:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left"><br>  
+
<td><p align="left">-0.352732<br>  
−
<br>  
+
1.64613<br>  
−
<br>  
+
0.035894<br>  
−
<br>  
+
0.168266<br>  
−
<br></p>  
+
0.000240379<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2014年1月6日 (月) 07:13時点における版

mrcImage3DWindowingとは入力データ（3D）に窓関数を掛け合わせるEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-center 選択 中心座標 (cx, cy, cz) (0, 0, 0)
-w 選択 幅 (wx, wy, wz) (0, 0 , 0)
-r 選択 半径 0
-wr 選択 Width for R 0
-wz 選択 Width for z 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0 GaussianRectangularSolid
1 CosCylindar(+Offset)
2 CosSphere
3 CosSphere(+Offset)


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

2
0.384947
0.605556

0.00086508

オプション必須項目のみの場合

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

0
nan
nan

nan
デフォルトではw=(0, 0, 0)で幅が0なので何も出力されない

オプション　-w

モード：０での実行に対応

w=(30, 30, 30)で実行

ガウス関数の各方向の幅（各方位毎に1/eとなる幅）を-wで設定

Outdata-w30-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

1.01888
0.0335928
0.0897063

0.000128152

オプション　-center

w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行

Outdata-w30-center50-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

1.97241
0.211832
0.358028

0.000511469

オプション　-m

m=1, w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行

その他のオプションなし
Outdata-m1-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.384876

1.61512
0.000101475
0.0101141

1.44488e-05
r=10で実行
Outdata-m1r-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.37003

1.62997
0.0205337
0.160314

0.00022902
wr=10で実行
Outdata-m1wr-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.192438

0.807562
0.000716062
0.0127312

1.81875e-05
wz=10, r=10で実行
Outdata-m1wz-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.37003

1.62997
0.0203072
0.156551

0.000223645

m=2, w=(30, 30, 30), center=(50, 50, 50)で実行

その他のオプションなし

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

0
nan
nan

nan
r=20で実行
Outdata-m2r-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

2
0.0551567
0.263582

0.000376545
wr=30で実行
Outdata-m2wr-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

2
0.0264886
0.18454

0.000263629

m=3で実行

その他のオプションなし
Outdata-m3-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0

0.815055
1.66338e-06
0.00116436

1.66338e-06
r=20で実行
Outdata-m3r-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.353868

1.64613
0.0310787
0.202673

0.000289533
wr=30, r=20で実行
Outdata-m3wr-mrcImage3DWindowing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.352732

1.64613
0.035894
0.168266

0.000240379

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