mrcImageAbnormalValueRemove

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mrcImageAbnormalValueRemoveとは電子顕微鏡画像の中の異常値を取り除くEosコマンドである。電子顕微鏡画像の異常値は、CCDカメラの素子の個人差、結晶化したなどが由来であることが多い。これにより、CTF補正などの画像処理への悪影響を低減することができる。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 NULL
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-v 選択 3.0
-u 選択 UnsignedMax(65535) UnsignedHalf(16384)
-m 選択 モード 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 ランダム値
1 近似値
2 Random Value using SD and mean within Normal Area
3 Mean Value using SD and mean within Normal Area

実行例

入力ファイルの画像

B120-2-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-65.0178

94.4699
4.85274
20.4635

0.255794

必須項目のオプションのみの場合

B120-2.outdata-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-56.108

66.0024
4.49193
19.7521

0.246901

オプション -v

v=1で実行

B120-2.outdata-v1-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-62.7258

74.644
4.1715
14.3336

0.17917

v=5で実行

B120-2.outdata-v5-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-65.0178

94.4699
4.85274
20.4635

0.255794

オプション -mode

mode=0で実行

B120-2.outdata-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-56.108

66.0024
4.49193
19.7521

0.246901

mode=1で実行

B120-2.outdata-m1-mrcImageAbnormalValueRemove.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-56.108

66.0024
4.6678
19.8468

0.248085