「mrcImageAssignedToTFofPDB」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
行32: 行32:
 
<td>-H</td>  
 
<td>-H</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>HighLevel</td>  
+
<td>閾値(HighLevel)</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-L</td>  
 
<td>-L</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Lowlevel</td>  
+
<td>閾値(Lowlevel)</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行112: 行112:
 
-中略-
 
-中略-
  
−
ATOM   1072 N  TYR A 137      8.072  9.694 11.240 1.00 22.19           N  
+
ATOM   641 CE2 PHE A 82      14.813  20.233 17.454 1.00 9.42           C  
−
ATOM   1073 CA TYR A 137      6.799 10.326 10.949 1.00 21.10          C   
+
ATOM   642 CZ PHE A 82      14.402 19.552 16.322 1.00 10.16           C   
−
ATOM   1074 C   TYR A 137      6.558 10.381  9.457 1.00 21.55           C  
+
ATOM   643 N   ALA A 83      13.147 24.056  19.362 1.00 8.77           N  
−
ATOM   1075 O  TYR A 137      5.430 10.686  9.022 1.00 22.61           O  
+
ATOM   644 CA  ALA A 83      14.417 24.796  19.338 1.00 10.28           C  
−
ATOM   1076 CB  TYR A 137      6.716 11.763 11.446 1.00 20.05           C   
+
ATOM   645 C  ALA A 83      15.540 23.828 19.671 1.00 9.49           C   
−
ATOM   1077 CG  TYR A 137      6.733 11.981 12.947 1.00 21.79           C  
+
ATOM   646 O  ALA A 83      15.406 23.022 20.607 1.00 8.40           O  
−
ATOM   1078 CD1 TYR A 137      6.487 10.945 13.835 1.00 22.83           C   
+
ATOM   647 CB  ALA A 83      14.390 25.939 20.368 1.00 9.40           C   
−
ATOM   1079 CD2 TYR A 137      6.962 13.274 13.426 1.00 23.07           C  
+
ATOM   648 N  ILE A 84      16.654 23.891 18.940 1.00 10.76           N  
−
ATOM   1080 CE1 TYR A 137      6.470 11.218 15.200 1.00 24.28           C   
+
ATOM   649  CA ILE A 84      17.724 22.889 19.092 1.00 12.94           C   
−
ATOM  1081 CE2 TYR A 137      6.939 13.548 14.787 1.00 22.74           C   
+
ATOM   650  C   ILE A 84      18.491 22.984 20.427 1.00 14.25           C   
  
 
-中略-
 
-中略-
行173: 行173:
 
-中略-
 
-中略-
  
−
ATOM   1072 N  TYR A 137      8.072  9.694 11.240 1.00  0.00   0      N  
+
ATOM   641 CE2 PHE A 82      14.813  20.233 17.454 1.00  0.14   0      C  
−
ATOM   1073 CA TYR A 137      6.799 10.326 10.949 1.00  0.00   0      C   
+
ATOM   642 CZ PHE A 82      14.402 19.552 16.322 1.00  0.03   0      C   
−
ATOM   1074 C   TYR A 137      6.558 10.381  9.457 1.00  0.00   0      C  
+
ATOM   643 N   ALA A 83      13.147 24.056  19.362 1.001743.76   0      N  
−
ATOM   1075 O  TYR A 137      5.430 10.686  9.022 1.00  0.00   0      O  
+
ATOM   644 CA  ALA A 83      14.417 24.796  19.338 1.00257.20   0      C  
−
ATOM  1076 CB  TYR A 137      6.716 11.763 11.446 1.00 0.00   0      C   
+
ATOM   645  C   ALA A 83      15.540 23.828 19.671 1.00 84.14   0      C   
−
ATOM  1077 CG  TYR A 137      6.733 11.981 12.947 1.00  0.00   0      C  
+
ATOM   646  O   ALA A 83      15.406 23.022 20.607 1.002170.21   0      O  
−
ATOM   1078 CD1 TYR A 137      6.487 10.945 13.835 1.00 0.00   0      C   
+
ATOM   647 CB  ALA A 83      14.390 25.939 20.368 1.00 24.56   0      C   
−
ATOM  1079 CD2 TYR A 137      6.962 13.274 13.426 1.00 0.00   0      C  
+
ATOM   648  N   ILE A 84      16.654 23.891 18.940 1.00 52.89   0      N  
−
ATOM   1080 CE1 TYR A 137      6.470 11.218 15.200 1.00 0.00   0      C   
+
ATOM   649  CA ILE A 84      17.724 22.889 19.092 1.00 67.56   0      C   
−
ATOM  1081 CE2 TYR A 137      6.939 13.548 14.787 1.00 0.00   0      C   
+
ATOM   650  C   ILE A 84      18.491 22.984 20.427 1.00 45.37   0      C   
  
 
-中略-
 
-中略-
行191: 行191:
 
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74  0      O   
 
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74  0      O   
 
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43  0      O  
 
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43  0      O  
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-H===
 +
====H=80で実行====
 +
<div>-o のデータ(一部)</div>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
ATOM      1  N  MET A  1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67  0      N 
 +
ATOM      2  CA  MET A  1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.34  0      C 
 +
ATOM      3  C  MET A  1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.01  0      C 
 +
ATOM      4  O  MET A  1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM      5  CB  MET A  1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.14  0      C 
 +
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.03  0      C 
 +
ATOM    643  N  ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00 80.00  0      N 
 +
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00 80.00  0      C 
 +
ATOM    645  C  ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 80.00  0      C 
 +
ATOM    646  O  ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00 80.00  0      O 
 +
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56  0      C 
 +
ATOM    648  N  ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89  0      N 
 +
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56  0      C 
 +
ATOM    650  C  ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
HETATM 1547  O  HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1548  O  HOH A 360      4.226  11.323  17.624  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1549  O  HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20  0      O 
 +
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74  0      O 
 +
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 80.00  0      O 
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-L===
 +
====L=1で実行====
 +
<div>-o のデータ(一部)</div>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
ATOM      1  N  MET A  1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67  0      N 
 +
ATOM      2  CA  MET A  1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  1.00  0      C 
 +
ATOM      3  C  MET A  1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  1.00  0      C 
 +
ATOM      4  O  MET A  1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  1.00  0      O 
 +
ATOM      5  CB  MET A  1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  1.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  1.00  0      C 
 +
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  1.00  0      C 
 +
ATOM    643  N  ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.001743.76  0      N 
 +
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00257.20  0      C 
 +
ATOM    645  C  ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 84.14  0      C 
 +
ATOM    646  O  ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.002170.21  0      O 
 +
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56  0      C 
 +
ATOM    648  N  ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89  0      N 
 +
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56  0      C 
 +
ATOM    650  C  ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
HETATM 1547  O  HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  1.00  0      O 
 +
HETATM 1548  O  HOH A 360      4.226  11.323  17.624  1.00  1.00  0      O 
 +
HETATM 1549  O  HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20  0      O 
 +
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  1.00  0      O 
 +
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43  0      O 
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1で実行====
 +
<div>-o のデータ(一部)</div>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
ATOM      1  N  MET A  1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM      2  CA  MET A  1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM      3  C  MET A  1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM      4  O  MET A  1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM      5  CB  MET A  1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    643  N  ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    645  C  ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    646  O  ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    648  N  ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    650  C  ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00  0.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
HETATM 1547  O  HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1548  O  HOH A 360      4.226  11.323  17.624  1.00113.33  0      O 
 +
HETATM 1549  O  HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.03  0      O 
 +
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00  0.00  0      O 
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====m=2で実行====
 +
<div>-o のデータ(一部)</div>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
ATOM      1  N  MET A  1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67  0      N 
 +
ATOM      2  CA  MET A  1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.34  0      C 
 +
ATOM      3  C  MET A  1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.01  0      C 
 +
ATOM      4  O  MET A  1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM      5  CB  MET A  1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.14  0      C 
 +
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.03  0      C 
 +
ATOM    643  N  ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.001743.76  0      N 
 +
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00257.20  0      C 
 +
ATOM    645  C  ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 84.14  0      C 
 +
ATOM    646  O  ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.002170.21  0      O 
 +
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56  0      C 
 +
ATOM    648  N  ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89  0      N 
 +
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56  0      C 
 +
ATOM    650  C  ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
HETATM 1547  O  HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1548  O  HOH A 360      4.226  11.323  17.624  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1549  O  HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20  0      O 
 +
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74  0      O 
 +
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43  0      O 
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====m=3で実行====
 +
<div>-o のデータ(一部)</div>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
ATOM      1  N  MET A  1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM      2  CA  MET A  1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM      3  C  MET A  1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM      4  O  MET A  1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM      5  CB  MET A  1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00  0      C 
 +
 +
-中略-
 +
 +
ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    643  N  ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    645  C  ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    646  O  ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00  0.00  0      O 
 +
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    648  N  ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00  0.00  0      N 
 +
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00  0.00  0      C 
 +
ATOM    650  C  ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00  0.00  0      C
 +
 +
-中略-
 +
 +
HETATM 1547  O  HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1548  O  HOH A 360      4.226  11.323  17.624  1.00113.33  0      O 
 +
HETATM 1549  O  HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00  0.00  0      O 
 +
HETATM 1550  O  HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.03  0      O 
 +
HETATM 1551  O  HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00  0.00  0      O 
  
 
-後略-
 
-後略-
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>

2014年2月17日 (月) 08:34時点における版

mrcImageAssignedToTFofPDBとは画像の値をPDBに組み込むEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-p 必須 入力ファイル: PDB NULL
-o 必須 出力ファイル: PDB NULL
-H 選択 閾値(HighLevel)
-L 選択 閾値(Lowlevel)
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0 デフォルト
1 Origin is Center (1) or BottomLeft (0)
2 Posi-Nega Reverse (2) or Direct (0)


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P-PDB.png

重心

最大半径

最大半径(座標)

6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01

3.286664e+01

24.77 23.85 28.04


入力データ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00 14.06           N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00 17.27           C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00 16.41           C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00 16.12           O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00 17.94           C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  9.42           C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00 10.16           C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00  8.77           N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00 10.28           C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00  9.49           C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00  8.40           O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00  9.40           C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 10.76           N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 12.94           C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 14.25           C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00 34.57           O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00 41.71           O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 24.44           O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00 40.11           O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 35.00           O  

-後略-


Input-121P1.png
xy平面

Input1-121P1.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (24, 28, 5)
88.3104
323.414

0.914753


オプション必須項目のみの場合

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.34   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.01   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00   0       C 

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.14   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.03   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.001743.76   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00257.20   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 84.14   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.002170.21   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37   0       C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43   0       O 

-後略-


オプション　-H

H=80で実行

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.34   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.01   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00   0       C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.14   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.03   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00 80.00   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00 80.00   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 80.00   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00 80.00   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37   0       C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 80.00   0       O  

-後略-


オプション　-L

L=1で実行

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  1.00   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  1.00   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  1.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  1.00   0       C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  1.00   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  1.00   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.001743.76   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00257.20   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 84.14   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.002170.21   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37   0       C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  1.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00  1.00   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  1.00   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43   0       O  

-後略-


オプション　-m

m=1で実行

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  0.00   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.00   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.00   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00   0       C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.00   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.00   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00  0.00   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00  0.00   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00  0.00   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00  0.00   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00  0.00   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00  0.00   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00  0.00   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00  0.00   0       C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00113.33   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.03   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00  0.00   0       O  

-後略-


m=2で実行

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  2.67   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.34   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.01   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00   0       C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.14   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.03   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.001743.76   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00257.20   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00 84.14   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.002170.21   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00 24.56   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00 52.89   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00 67.56   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00 45.37   0       C  

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00 71.20   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.74   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00 85.43   0       O  

-後略-


m=3で実行

-o のデータ(一部)
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00  0.00   0       N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00  0.00   0       C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00  0.00   0       C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00  0.00   0       O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00  0.00   0       C  

-中略-

ATOM    641  CE2 PHE A  82      14.813  20.233  17.454  1.00  0.00   0       C  
ATOM    642  CZ  PHE A  82      14.402  19.552  16.322  1.00  0.00   0       C  
ATOM    643  N   ALA A  83      13.147  24.056  19.362  1.00  0.00   0       N  
ATOM    644  CA  ALA A  83      14.417  24.796  19.338  1.00  0.00   0       C  
ATOM    645  C   ALA A  83      15.540  23.828  19.671  1.00  0.00   0       C  
ATOM    646  O   ALA A  83      15.406  23.022  20.607  1.00  0.00   0       O  
ATOM    647  CB  ALA A  83      14.390  25.939  20.368  1.00  0.00   0       C  
ATOM    648  N   ILE A  84      16.654  23.891  18.940  1.00  0.00   0       N  
ATOM    649  CA  ILE A  84      17.724  22.889  19.092  1.00  0.00   0       C  
ATOM    650  C   ILE A  84      18.491  22.984  20.427  1.00  0.00   0       C 

-中略-

HETATM 1547  O   HOH A 359      -4.312  38.871  -6.155  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1548  O   HOH A 360       4.226  11.323  17.624  1.00113.33   0       O  
HETATM 1549  O   HOH A 361      22.341  27.132  10.735  1.00  0.00   0       O  
HETATM 1550  O   HOH A 362      14.256  10.610  17.524  1.00  0.03   0       O  
HETATM 1551  O   HOH A 363      26.542  18.231  27.104  1.00  0.00   0       O  

-後略-



「https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php?title=mrcImageAssignedToTFofPDB&oldid=6448」から取得