mrcImageAssignedToTFofPDB
提供: Eospedia
mrcImageAssignedToTFofPDBとは画像の値をPDBに組み込むEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -p | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: PDB | NULL |
| -H | 選択 | HighLevel | |
| -L | 選択 | Lowlevel | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | デフォルト |
| 1 | Origin is Center (1) or BottomLeft (0) |
| 2 | Posi-Nega Reverse (2) or Direct (0) |
実行例
入力ファイルの画像
-i のデータの画像
 |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
入力データ(一部)
-前略- ATOM 1 N MET A 1 -7.176 32.630 -6.655 1.00 14.06 N ATOM 2 CA MET A 1 -5.913 31.928 -6.676 1.00 17.27 C ATOM 3 C MET A 1 -5.903 30.860 -5.600 1.00 16.41 C ATOM 4 O MET A 1 -6.703 30.881 -4.654 1.00 16.12 O ATOM 5 CB MET A 1 -4.712 32.869 -6.415 1.00 17.94 C -中略- ATOM 1072 N TYR A 137 8.072 9.694 11.240 1.00 22.19 N ATOM 1073 CA TYR A 137 6.799 10.326 10.949 1.00 21.10 C ATOM 1074 C TYR A 137 6.558 10.381 9.457 1.00 21.55 C ATOM 1075 O TYR A 137 5.430 10.686 9.022 1.00 22.61 O ATOM 1076 CB TYR A 137 6.716 11.763 11.446 1.00 20.05 C ATOM 1077 CG TYR A 137 6.733 11.981 12.947 1.00 21.79 C ATOM 1078 CD1 TYR A 137 6.487 10.945 13.835 1.00 22.83 C ATOM 1079 CD2 TYR A 137 6.962 13.274 13.426 1.00 23.07 C ATOM 1080 CE1 TYR A 137 6.470 11.218 15.200 1.00 24.28 C ATOM 1081 CE2 TYR A 137 6.939 13.548 14.787 1.00 22.74 C -中略- HETATM 1547 O HOH A 359 -4.312 38.871 -6.155 1.00 34.57 O HETATM 1548 O HOH A 360 4.226 11.323 17.624 1.00 41.71 O HETATM 1549 O HOH A 361 22.341 27.132 10.735 1.00 24.44 O HETATM 1550 O HOH A 362 14.256 10.610 17.524 1.00 40.11 O HETATM 1551 O HOH A 363 26.542 18.231 27.104 1.00 35.00 O -後略-
-r のデータの画像
|
|
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3500.79 (24, 28, 5) |
オプション必須項目のみの場合
-o のデータ(一部)
-前略- ATOM 1 N MET A 1 -7.176 32.630 -6.655 1.00 2.67 0 N ATOM 2 CA MET A 1 -5.913 31.928 -6.676 1.00 0.34 0 C ATOM 3 C MET A 1 -5.903 30.860 -5.600 1.00 0.01 0 C ATOM 4 O MET A 1 -6.703 30.881 -4.654 1.00 0.00 0 O ATOM 5 CB MET A 1 -4.712 32.869 -6.415 1.00 0.00 0 C -中略- ATOM 1072 N TYR A 137 8.072 9.694 11.240 1.00 0.00 0 N ATOM 1073 CA TYR A 137 6.799 10.326 10.949 1.00 0.00 0 C ATOM 1074 C TYR A 137 6.558 10.381 9.457 1.00 0.00 0 C ATOM 1075 O TYR A 137 5.430 10.686 9.022 1.00 0.00 0 O ATOM 1076 CB TYR A 137 6.716 11.763 11.446 1.00 0.00 0 C ATOM 1077 CG TYR A 137 6.733 11.981 12.947 1.00 0.00 0 C ATOM 1078 CD1 TYR A 137 6.487 10.945 13.835 1.00 0.00 0 C ATOM 1079 CD2 TYR A 137 6.962 13.274 13.426 1.00 0.00 0 C ATOM 1080 CE1 TYR A 137 6.470 11.218 15.200 1.00 0.00 0 C ATOM 1081 CE2 TYR A 137 6.939 13.548 14.787 1.00 0.00 0 C -中略- HETATM 1547 O HOH A 359 -4.312 38.871 -6.155 1.00 0.00 0 O HETATM 1548 O HOH A 360 4.226 11.323 17.624 1.00 0.00 0 O HETATM 1549 O HOH A 361 22.341 27.132 10.735 1.00 71.20 0 O HETATM 1550 O HOH A 362 14.256 10.610 17.524 1.00 0.74 0 O HETATM 1551 O HOH A 363 26.542 18.231 27.104 1.00 85.43 0 O -後略-
