「mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis」の版間の差分

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<td>-i</td>  
 
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<td>入力ファイル</td>  
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<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
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<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>出力ファイル</td>  
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<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
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<td>NULL</td>  
 
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<div>-i, -o のファイル名は合わせて半角100文字程度まで入力可能</div>
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<div>-deltadY は未実装</div>
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===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
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== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
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===[[Media:Input-AutoFilament.mrc | 入力ファイル]]の画像===
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<td>[[画像:Input-AutoFilament.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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<td><p align="left">0 (65, 0, 0)<br>
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10.8167 (60, 12, 0)<br>
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0.752281<br>
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1.80953<br>
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===オプション -y===
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<div>-y はデフォルトが0であるので、設定する必要がある。</div>
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====y=30で実行====
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td> 
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<div>以降はy=30で実行</div>
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===オプション -truePitch===
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====truePitch=250で実行====
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-truePitch-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td> 
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<td><p align="left">-2.19053 (114, 47, 0)<br>
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10.5375 (52, 43, 0)<br>
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0.600831<br>
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</td>
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===オプション -PixelSize===
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====PixelSize=10で実行====
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td> 
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<td><p align="left">-1.92139 (25, 13, 0)<br>
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10.8001 (99, 37, 0)<br>
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0.601505<br>
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1.53942<br>
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</tr>
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===オプション -Mag===
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====Mag=0.4で実行====
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-Mag-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td> 
 +
<td><p align="left">-2.30451 (198, 81, 0)<br>
 +
11.0425 (198, 75, 0)<br>
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0.601022<br>
 +
1.53561<br>
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0.0116508<br></p>
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</td>
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</tr>
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2014年2月24日 (月) 01:17時点における最新版

mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysisとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: mrcImage NULL
-truePitch 選択 True Pitch 430
-PixelSize 選択 Pixel Size [A] 5
-deltadY 選択 A range of deltadY to determine dY. 0.5
-y 選択 y [pixel] for final extraction 0
-Mag 選択 magnification ratio 1.1
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
-i, -o のファイル名は合わせて半角100文字程度まで入力可能
-deltadY は未実装


モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-AutoFilament.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (65, 0, 0)

10.8167 (60, 12, 0)
0.752281
1.80953

0.0207349


オプション -y

-y はデフォルトが0であるので、設定する必要がある。

y=30で実行

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

0 (0, 0, 0)
0
0

0


以降はy=30で実行

オプション -truePitch

truePitch=250で実行

Outdata-truePitch-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.19053 (114, 47, 0)

10.5375 (52, 43, 0)
0.600831
1.53525

0.0200725


オプション -PixelSize

PixelSize=10で実行

Outdata-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.92139 (25, 13, 0)

10.8001 (99, 37, 0)
0.601505
1.53942

0.0233594


オプション -Mag

Mag=0.4で実行

Outdata-Mag-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.30451 (198, 81, 0)

11.0425 (198, 75, 0)
0.601022
1.53561

0.0116508