mrcImageCTFCompensationForTiltImage

提供: Eospedia
2013年12月18日 (水) 00:44時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

移動: 案内検索

mrcImageCTFCompensationForTiltImageとは傾斜画像に関するCTFの補正を行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage NULL
-I 必須 ROI情報の設定: テキスト NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage(CTF) NULL
-cut 選択 補正しない範囲(中心からのピクセル数) 6
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0

-I のフォーマット

ROI情報のフォーマットについてはmrcImageROIs参照


実行例

入力ファイルのデータ

-i の画像

Input-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

255 (49, 32, 0)
21.0538
47.6709

0.595886


-I のデータ

/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0000.roi Rect 6 6 26 6 26 26 6 26
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0001.roi Rect 20 6 40 6 40 26 20 26
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0002.roi Rect 40 6 60 6 60 26 40 26
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0003.roi Rect 54 6 74 6 74 26 54 26
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0004.roi Rect 6 20 26 20 26 40 6 40
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0005.roi Rect 20 20 40 20 40 40 20 40
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0006.roi Rect 40 20 60 20 60 40 40 40
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0007.roi Rect 54 20 74 20 74 40 54 40
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0008.roi Rect 6 40 26 40 26 60 6 60
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0009.roi Rect 20 40 40 40 40 60 20 60
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0010.roi Rect 40 40 60 40 60 60 40 60
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0011.roi Rect 54 40 74 40 74 60 54 60
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0012.roi Rect 6 54 26 54 26 74 6 74
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0013.roi Rect 20 54 40 54 40 74 20 74
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0014.roi Rect 40 54 60 54 60 74 40 74
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0015.roi Rect 54 54 74 54 74 74 54 74

使用するROIファイル: 入力ファイル


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1 (7, 7, 0)

255 (22, 7, 0)
155.874
73.4908

0.918635


オプション -cut

cut=20で実行

Outdata-cut-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.01 (7, 7, 0)

255 (25, 20, 0)
118.004
59.0793

0.738491