mrcImageCTFObservation
提供: Eospedia
mrcImageCTFObservationとはmrcImage形式の画像に電子顕微鏡で撮影した際の画像変調をシミュレートするためのEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル(mrcImage形式) | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル(mrcImage形式) | NULL |
-kV | 選択 | 加速電圧[kV] | 200 |
-Cs | 選択 | 球面収差係数[mm] | 2.1 |
-df | 選択 | デフォーカス量[A(+がアンダーフォーカス)] | 27000 |
-A | 選択 | 強度コントラスト比(Amplitude/Phase) | 0.0 |
-Ain | 選択 | 照射角[mrad] | 0.0 |
-white | 選択 | 白色ノイズ比(Noise/Signal) | 1.0 |
-SinWin | 選択 | RMin[A-1] RMax[A-1] | 0.1 1.0 |
-ctfMode | 選択 | ctfMode | 0 |
-Astig | 選択(設定された場合に意味がある) | dfMin[A] dfMax[A] ASaxis[degree] | 0 0 0 |
-c | 選択 | configFile | NULL |
-m | 選択 | mode | 0 |
モードの詳細
モード(-ctfMode) | 説明 |
---|---|
0 | 位相のみ |
1 | 位相+強度コントラスト |
+32 | 照射角を考慮する |
+256 | 絶対値を割り当てる(位相を補正しない) |