「mrcImageCTFSN」の版間の差分
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2015年6月2日 (火) 03:24時点における版
CTFのThon Ringの0のところの値を使って、ノイズレベルを指数関数でフィットし、N(R) = An exp( Bn x R )を求めます。その際、負にならないように、Anを調整します。 その後、各空間周波数毎に強度I(R)/N(R) - 1 として、出力したものである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage(FFT) | stdin |
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage(FFT) | stdout |
-kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
-Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 1.7 |
-df | 必須 | デフォーカス量(+がアンダーフォーカス): [A] | 2.7 |
-n1 | 選択 | Degree of zero point minimum | 2 |
-n2 | 選択 | Degree of zero point maximum | 4 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
実行例
入力ファイルの画像
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
df=27000で実行
他のオプション設定なし
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション -kV
kV=100で実行
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション -Cs
Cs=2.7で実行
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション -n1, -n2
n1=1, n2=7で実行
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |