「mrcImageCircumferentialProjection」の版間の差分
| 行160: | 行160: | ||
===オプション -rmin, -rmax, dr=== | ===オプション -rmin, -rmax, dr=== | ||
====rmin=90, rmax=110, dr=1で実行==== | ====rmin=90, rmax=110, dr=1で実行==== | ||
| − | |||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行179: | 行178: | ||
</table> | </table> | ||
| − | =====dang= | + | |
| + | <div>以降はrmin=90, rmax=110, dr=1で実行</div> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ===オプション -dang=== | ||
| + | ====dang=1で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行199: | 行203: | ||
| − | =====zmin=10, zmax=50, dz=1で実行===== | + | ===オプション -zmin, -zmax, -dz=== |
| + | ====zmin=10, zmax=50, dz=1で実行==== | ||
| + | =====その他のオプション設定なし===== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行219: | 行225: | ||
| − | = | + | =====threshold=1.8で実行===== |
| − | ====threshold=1. | + | |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行231: | 行236: | ||
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| − | + | 1.78549 (11, 25, 0)<br> | |
| − | 0. | + | 0.511454<br> |
| − | 0. | + | 0.599524<br> |
| − | 0. | + | 0.0204317<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション -m=== | ===オプション -m=== | ||
| − | ====m= | + | ====m=1で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行250: | 行256: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">61.8654 (20, 4, 0)<br> |
| − | + | 1960.91 (10, 6, 0)<br> | |
| − | + | 705.471<br> | |
| − | + | 447<br> | |
| − | + | 29.4105<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| − | ====m=2, | + | |
| + | ====m=2, threshold=2で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行269: | 行276: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">0 ( | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
| − | + | 3.68241 (11, 6, 0)<br> | |
| − | + | 1.1925<br> | |
| − | + | 1.19853<br> | |
| − | 0. | + | 0.0788573<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
2014年1月7日 (火) 05:12時点における最新版
mrcImageCircumferentialProjectionとは３D画像から円筒座標系に変換し、特定範囲のみを表示する。Eosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -dang | 選択 | 角度の加算値: [deree] | 10 |
| -zmin | 選択 | Zの最小値: [A] | 0 |
| -zmax | 選択 | Zの最大値: [A] | 100 |
| -dz | 選択 | Zの加算値: [A] | 10 |
| -rmin | 選択 | 半径の最小値: [A] | 0 |
| -rmax | 選択 | 半径の最大値: [A] | 200 |
| -dr | 選択 | 半径の加算値: [A] | 10 |
| -threshold | 選択 | 閾値を設定(平均密度が閾値以上) | 0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 平均密度を出力 (dataSum = dataSum / nang) |
| 1 | 加重密度を出力 (dataSum = dataSum / nang *(2*PI*r)) |
| 2 | 閾値以上の平均密度を出力 (dataSum = dataSum / [nang number more than threshold value] *(2*PI*r)) |
実行例
入力ファイルの画像
|
|
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 5.57707 (44, 26, 0) |
オプション必須項目のみの場合
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3.12088 (10, 6, 0) |
オプション -rmin, -rmax, dr
rmin=90, rmax=110, dr=1で実行
 |
最小 最大 |
0.0895108 (20, 4, 0) 3.12088 (10, 6, 0) |
オプション -dang
dang=1で実行
 |
最小 最大 |
0.0659651 (20, 4, 0) 3.25403 (9, 6, 0) |
オプション -zmin, -zmax, -dz
zmin=10, zmax=50, dz=1で実行
その他のオプション設定なし
 |
最小 最大 |
0.0895382 (20, 4, 0) 2.17163 (10, 25, 0) |
threshold=1.8で実行
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.78549 (11, 25, 0) |
オプション -m
m=1で実行
 |
最小 最大 |
61.8654 (20, 4, 0) 1960.91 (10, 6, 0) |
m=2, threshold=2で実行
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3.68241 (11, 6, 0) |
