mrcImageCircumferentialProjection
mrcImageCircumferentialProjectionとは3D画像から円筒座標系に変換し、特定範囲のみを表示する。Eosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-dang | 選択 | 角度の加算値: [deree] | 10 |
-zmin | 選択 | Zの最小値: [A] | 0 |
-zmax | 選択 | Zの最大値: [A] | 100 |
-dz | 選択 | Zの加算値: [A] | 10 |
-rmin | 選択 | 半径の最小値: [A] | 0 |
-rmax | 選択 | 半径の最大値: [A] | 200 |
-dr | 選択 | 半径の加算値: [A] | 10 |
-threshold | 選択 | 閾値を設定(平均密度が閾値以上) | 0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 平均密度を出力 (dataSum = dataSum / nang) |
1 | 加重密度を出力 (dataSum = dataSum / nang *(2*PI*r)) |
2 | 閾値以上の平均密度を出力 (dataSum = dataSum / [nang number more than threshold value] *(2*PI*r)) |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 5.57707 (44, 26, 0) |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3.12088 (10, 6, 0) |
オプション -rmin, -rmax, dr
rmin=90, rmax=110, dr=1で実行
その他のオプション設定なし
最小 最大 |
0.0895108 (20, 4, 0) 3.12088 (10, 6, 0) |
dang=1で実行
最小 最大 |
0.0659651 (20, 4, 0) 3.25403 (9, 6, 0) |
zmin=10, zmax=50, dz=1で実行
最小 最大 |
0.0895382 (20, 4, 0) 2.17163 (10, 25, 0) |
オプション -threshold
threshold=1.5, rmax=170で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2 (0, 9, 0) |
オプション -m
m=1, rmax=170で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 742.872 (9, 5, 0) |
m=2, rmax=170で実行
最小 最大 |
0 (8, 0, 0) 1.94595 (0, 9, 0) |