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Input-1VOM-N-2D.mrc
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<td>[[画像:Input-1VOM-N-Rot-2D.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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<td><p align="left">-11367.8 (51, 62, 0)<br>
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51939.8 (29, 26, 0)<br>
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<td>[[画像:Input-1VOM-N-Rot1-2D.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td>
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<td><p align="left">-14918 (53, 17, 0)<br>
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58621.8 (30, 26, 0)<br>
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2014年5月7日 (水) 02:29時点における版

mrcImageClusterAnalysisとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I 必須 入力ファイル NULL
-o 選択 出力ファイル stdout
-O 選択 平均画像ファイルの出力: ファイル名: (入力ファイル名).avg
-N 選択 クラスターの数 1
-Min 選択 Minimum: Correlation: Conditions for ending 0.0
-Iter 選択 繰り返しを有効にする
-AR 選択 回転の刻み数 72
-ARange 選択 回転の範囲: (最小値, 最大値) (0, 360)
-ARiter 選択 AutoRotationの繰り返し回数 2
-ARMethod 選択 AutoRotationCorrelationの計算方法 0
-M 選択 相関のモード 19
-pvm 選択 PVMでパラレル解析する
-pvmList 選択 入力: pvmリスト NULL
-Log 選択 出力: ログ stdout
-Log2 選択 出力: ログ(クラスターノードのみ) NULL
-LogIn 選択 入力: 前回のログ NULL
-prevF 選択 入力: 前回のログファイル数 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 クラスター間の距離の設定 2
-h 選択 ヘルプを表示  


-m の詳細

モード 説明
0 相関値から算出
1 ユークリッド距離から算出
2 By Ward Method: 回転無し: ユークリッド距離, 回転有り: ユークリッド距離の2乗
3 By Ward Method using Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)
4 By Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)


実行例

-I のデータ

Input-1VOM-N-2D.mrc
Input-1VOM-N-Rot-2D.mrc
Input-1VOM-N-Rot1-2D.mrc

Input-1VOM-N-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-18651.7 (10, 1, 0)

52942.7 (24, 39, 0)
7214.87
10067.6

125.845

Input-1VOM-N-Rot-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-11367.8 (51, 62, 0)

51939.8 (29, 26, 0)
6580.18
9247.8

115.597

Input-1VOM-N-Rot1-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-14918 (53, 17, 0)

58621.8 (30, 26, 0)
6579.96
9022.72

112.784