mrcImageClusterAnalysis
提供: Eospedia
mrcImageClusterAnalysisとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-I | 必須 | 入力ファイル | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル | stdout |
-O | 選択 | 平均画像ファイルの出力: ファイル名: (入力ファイル名).avg | |
-N | 選択 | クラスターの数 | 1 |
-Min | 選択 | Minimum: Correlation: Conditions for ending | 0.0 |
-Iter | 選択 | 繰り返しを有効にする | |
-AR | 選択 | 回転の刻み数 | 72 |
-ARange | 選択 | 回転の範囲: (最小値, 最大値) | (0, 360) |
-ARiter | 選択 | AutoRotationの繰り返し回数 | 2 |
-ARMethod | 選択 | AutoRotationCorrelationの計算方法 | 0 |
-M | 選択 | 相関のモード | 19 |
-pvm | 選択 | PVMでパラレル解析する | |
-pvmList | 選択 | 入力: pvmリスト | NULL |
-Log | 選択 | 出力: ログ | stdout |
-Log2 | 選択 | 出力: ログ(クラスターノードのみ) | NULL |
-LogIn | 選択 | 入力: 前回のログ | NULL |
-prevF | 選択 | 入力: 前回のログファイル数 | 0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | クラスター間の距離の設定 | 2 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 相関値から算出 |
1 | ユークリッド距離から算出 |
2 | By Ward Method: 回転無し: ユークリッド距離, 回転有り: ユークリッド距離の2乗 |
3 | By Ward Method using Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation) |
4 | By Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation) |