「mrcImageCorrelation」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイル設定</td> | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
− | <td> | + | <td>選択</td> |
<td>出力ファイル設定</td> | <td>出力ファイル設定</td> | ||
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
行32: | 行32: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>参照ファイル設定</td> | + | <td>参照ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>- | + | <td>-corInfo</td> |
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>相関関係の詳細をファイルに書き込む</td> | + | <td>相関関係の詳細をファイルに書き込む: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行62: | 行62: | ||
RefineMode:モードの設定</td> | RefineMode:モードの設定</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>-c</td> | ||
+ | <td>選択</td> | ||
+ | <td>コンフィグファイル設定</td> | ||
+ | <td>NULL</td> | ||
+ | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-m</td> | <td>-m</td> | ||
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</table> | </table> | ||
− | ===------オプション - | + | ===------オプション -corInfo------=== |
<div>下記のようなデータが格納されたファイルが作成される</div> | <div>下記のようなデータが格納されたファイルが作成される</div> | ||
====オプション-Mが0の場合==== | ====オプション-Mが0の場合==== |
2014年8月26日 (火) 00:41時点における版
mrcImageCorrelationは相関図を作成するEosのコマンド。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル設定 | NULL |
-O | 選択 | 出力ファイル設定 | NULL |
-r | 必須 | 参照ファイル設定: mrcImage | NULL |
-corInfo | 選択 | 相関関係の詳細をファイルに書き込む: ASCII | stdout |
-a | 選択 | 2つの画像の平均画像ファイル | NULL |
-s | 選択 | 入力ファイルをシフトする | NULL |
-refine | 選択 | 改良点を設定 | (RefineStep RefineRange RefineMode)→(0.25 3.0 2) RefineStep:刻み幅の設定 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モード1 | 0 |
-M | 選択 | モード2 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モード1の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 正規相関:FxG* |
1 | 位相相関:FxG*/|FxG*| |
2 | 位相相関:FxG*/sqrt(|FxG*|) |
3 | 標準化された正規相関:FxG*/(|F||G|) |
16 | (0,0) = 0 |
モード2の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 高速フーリエ変換による相関関係。出力はmrcImageファイル |
1 | 正規空間で増える位相関係。出力は実際の値で表示される |
実行例
------入力ファイルの画像------
ノイズあり | ノイズなし | |||||
最小 最大 |
-45.2205 61.1583 |
最小 最大 |
0 39.0578 |
------参照ファイルの画像------
最小 最大 |
-44.5884 62.2917 |
最小 最大 |
0 40.8834 |
------オプション -o------
最小 最大 |
-696.555 2670.19 |
最小 最大 |
-0.000195313 2169.32 |
------オプション -O------
-refineを1.75 70 0に設定
最小 最大 |
1.23885 1.44004 |
最小 最大 |
0.262565 1.41038 |
-refineを1.75 70 1に設定
最小 最大 |
1.45204 1.63609 |
最小 最大 |
0.696388 1.63042 |
-refineを1.75 70 2に設定
最小 最大 |
1.71269 1.86756 |
最小 最大 |
1.12474 1.99758 |
------オプション -corInfo------
オプション-Mが0の場合
オプション-Mが1の場合
------オプション -a------
最小 最大 |
-35.1267 59.0675 |
最小 最大 |
0 38.1336 |
------オプション -s------
最小 最大 |
-44.5884 62.2917 |
最小 最大 |
0 39.0578 |
------オプション -m------
モード:0
最小 最大 |
-696.555 2670.19 |
最小 最大 |
-0.000195313 2169.32 |
モード:1
最小 最大 |
-3.67017 3.71466 |
最小 最大 |
-9.80742 7.48342 |
モード:2
最小 最大 |
-44.7368 62.2468 |
最小 最大 |
-6.01609 44.7194 |
モード:3
最小 最大 |
-0.0672328 0.257732 |
最小 最大 |
-1.78814e-08 0.199896 |
モード:16
最小 最大 |
-826.059 2540.68 |
最小 最大 |
-135.653 2033.67 |