「mrcImageCorrelation」の版間の差分
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(ページの作成:「'''mrcImageCorrelation'''は相関図を作成するEosのコマンド。 ==オプション一覧== ===メインオプション=== <table border="1"> <div ali...」) |
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| − | '''mrcImageCorrelation'''は相関図を作成する[[Eos]]の[[コマンド]] | + | '''mrcImageCorrelation'''は相関図を作成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
==オプション一覧== | ==オプション一覧== | ||
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル設定</td> | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
| − | <td> | + | <td>選択</td> |
| − | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](相関マップ)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-O</td> | <td>-O</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](相関マップ2)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行32: | 行32: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>参照ファイル設定</td> | + | <td>参照ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>- | + | <td>-corInfo</td> |
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>相関関係の詳細をファイルに書き込む</td> | + | <td>相関関係の詳細をファイルに書き込む: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行44: | 行44: | ||
<td>-a</td> | <td>-a</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>２つの画像の平均画像ファイル</td> | + | <td>２つの画像の平均画像ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行50: | 行50: | ||
<td>-s</td> | <td>-s</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>入力ファイルを参照ファイルに最も近くなるようにシフトする: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行62: | 行62: | ||
RefineMode：モードの設定</td> | RefineMode：モードの設定</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-c</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>コンフィグファイル設定</td> | ||
| + | <td>NULL</td> | ||
| + | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-m</td> | <td>-m</td> | ||
| 行80: | 行86: | ||
<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | </div> | ||
</table> | </table> | ||
| 行143: | 行150: | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B112-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行157: | 行164: | ||
</td> | </td> | ||
<td></td> | <td></td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行176: | 行183: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行189: | 行196: | ||
0.16355<br></p> | 0.16355<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B060-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行208: | 行215: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行221: | 行228: | ||
5.49214<br></p> | 5.49214<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行236: | 行243: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | 入力画像をどの程度移動すると参照画像に近くなるかが分かる。<br> | ||
| + | <br> | ||
===------オプション -O------=== | ===------オプション -O------=== | ||
| − | + | <div>オプション-Oでは、オプション-refineを設定しなければならない</div> | |
====-refineを1.75 70 0に設定==== | ====-refineを1.75 70 0に設定==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.Out0-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行255: | 行264: | ||
0.000245606<br></p> | 0.000245606<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.Out0-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行274: | 行283: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.Out1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行287: | 行296: | ||
0.000226438<br></p> | 0.000226438<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.Out1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行306: | 行315: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.Out2-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行319: | 行328: | ||
0.000201842<br></p> | 0.000201842<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.Out2-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行335: | 行344: | ||
</table> | </table> | ||
| − | ===------オプション - | + | ===------オプション -corInfo------=== |
| − | + | <div>下記のようなデータが格納されたファイルが作成される</div> | |
====オプション-Mが0の場合==== | ====オプション-Mが0の場合==== | ||
| − | [[画像: | + | [[画像:A044.out-cM0-mrcImageCorrelation.png]] |
====オプション-Mが1の場合==== | ====オプション-Mが1の場合==== | ||
| − | [[画像: | + | [[画像:A044.out-cM1-mrcImageCorrelation.png]] |
===------オプション -a------=== | ===------オプション -a------=== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-a1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行359: | 行368: | ||
0.126383<br></p> | 0.126383<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.Out-a1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行378: | 行387: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-s1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行391: | 行400: | ||
0.16355<br></p> | 0.16355<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.Out-s1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行411: | 行420: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行424: | 行433: | ||
5.49214<br></p> | 5.49214<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行443: | 行452: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-m1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行456: | 行465: | ||
0.012499<br></p> | 0.012499<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-m1-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行475: | 行484: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-m2-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行488: | 行497: | ||
0.149225<br></p> | 0.149225<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-m2-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行507: | 行516: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-m3-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行520: | 行529: | ||
0.000530111<br></p> | 0.000530111<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-m3-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行539: | 行548: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:B116.out-m16-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行552: | 行561: | ||
5.49214<br></p> | 5.49214<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:A044.out-m16-mrcImageCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
2015年3月31日 (火) 01:45時点における最新版
mrcImageCorrelationは相関図を作成するEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ) | NULL |
| -O | 選択 | 出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ2) | NULL |
| -r | 必須 | 参照ファイル設定: mrcImage | NULL |
| -corInfo | 選択 | 相関関係の詳細をファイルに書き込む: ASCII | stdout |
| -a | 選択 | ２つの画像の平均画像ファイル: mrcImage | NULL |
| -s | 選択 | 入力ファイルを参照ファイルに最も近くなるようにシフトする: mrcImage | NULL |
| -refine | 選択 | 改良点を設定 | (RefineStep RefineRange RefineMode)→(0.25 3.0 2) RefineStep：刻み幅の設定 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モード１ | 0 |
| -M | 選択 | モード２ | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モード１の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 正規相関：FxG* |
| 1 | 位相相関：FxG*/|FxG*| |
| 2 | 位相相関：FxG*/sqrt(|FxG*|) |
| 3 | 標準化された正規相関：FxG*/(|F||G|) |
| 16 | (0,0) = 0 |
モード２の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 高速フーリエ変換による相関関係。出力はmrcImageファイル |
| 1 | 正規空間で増える位相関係。出力は実際の値で表示される |
実行例
------入力ファイルの画像------
| ノイズあり | ノイズなし | |||||
 |
最小 最大 |
-45.2205 61.1583 |
 |
最小 最大 |
0 39.0578 |
------参照ファイルの画像------
 |
最小 最大 |
-44.5884 62.2917 |
 |
最小 最大 |
0 40.8834 |
------オプション -o------
 |
最小 最大 |
-696.555 2670.19 |
 |
最小 最大 |
-0.000195313 2169.32 |
入力画像をどの程度移動すると参照画像に近くなるかが分かる。
------オプション -O------
オプション-Oでは、オプション-refineを設定しなければならない
-refineを1.75 70 0に設定
 |
最小 最大 |
1.23885 1.44004 |
 |
最小 最大 |
0.262565 1.41038 |
-refineを1.75 70 1に設定
 |
最小 最大 |
1.45204 1.63609 |
 |
最小 最大 |
0.696388 1.63042 |
-refineを1.75 70 2に設定
 |
最小 最大 |
1.71269 1.86756 |
 |
最小 最大 |
1.12474 1.99758 |
------オプション -corInfo------
下記のようなデータが格納されたファイルが作成される
オプション-Mが0の場合
オプション-Mが1の場合
------オプション -a------
 |
最小 最大 |
-35.1267 59.0675 |
 |
最小 最大 |
0 38.1336 |
------オプション -s------
 |
最小 最大 |
-44.5884 62.2917 |
 |
最小 最大 |
0 39.0578 |
------オプション -m------
モード：０
|
最小 最大 |
-696.555 2670.19 |
|
最小 最大 |
-0.000195313 2169.32 |
モード：１
 |
最小 最大 |
-3.67017 3.71466 |
 |
最小 最大 |
-9.80742 7.48342 |
モード：２
 |
最小 最大 |
-44.7368 62.2468 |
 |
最小 最大 |
-6.01609 44.7194 |
モード：３
 |
最小 最大 |
-0.0672328 0.257732 |
 |
最小 最大 |
-1.78814e-08 0.199896 |
モード：１６
 |
最小 最大 |
-826.059 2540.68 |
 |
最小 最大 |
-135.653 2033.67 |
