「mrcImageDeconvolution」の版間の差分

2014年6月13日 (金) 06:31時点における最新版

mrcImageDeconvolutionとはEosのコマンドである。

DeconvolutionのアルゴリズムはmrcImageCTFCompensation（電子顕微鏡のＣＴＦに特化）で利用したアルゴリズムに準拠している。

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-k	必須	カーネルファイル: mrcImage	NULL
-kcentre	選択	KernelCentre	1
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-oconv	選択	出力ファイル: mrcImage (Conv*Dst to compare with in)	NULL
-o	選択	パラメータ: ASCII	stdout
-ORSMD	選択	パラメータ: mrcImage	NULL
-thresCTF	選択	threshold CTF for InverseFilter	1e-4
-NSRatio	選択	N/S Ratio for R-dependent Wiener Filter	0.0
-NSCoeff	選択	N/S Coeff for R-dependent Wiener Filter	0.0
-Pad3DMode	選択	lmrcImage3DPad Mode	1
-r	選択	Pad3D: [pix] Threshold radius of signal.Default is min(Nx,Ny).	0
-w	選択	Pad3D: [pix] Width of slope. For mode 1.	1
-v	選択	Pad3D: Value of out of threshold.	0
-Floating	選択	Pad3D: Floating
-maxIter	選択	maxIteration for Iterative	0
-minRSMD	選択	min of MRSD for Iterative	0.0
-lambda	選択	lambda for Iterative	0.5
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モード	説明
0	No deconvolution
1	CTF/\|CTF\| (phase flipping)
2	CTF (CTF-Multi)
3	1/CTF (Inverse Filter)
4	CTF/(SQR(CTF)+SQR(NS)) (Wiener Filter)
5	SQR(CTF) x CTF/\|CTF\| (phase flipping + ctfWeighted)
6	1/\|CTF\| (No phase-flipping: Inverse Filter)
7	\|CTF\|/(SQR(CTF)+SQR(NS)) (No phase-flipping: Wiener Filter)
8	CTF /(SQR(CTF)+SQR(NSexp(aR))) (phase-flipping: Wiener Filter + Noise)
9	\|CTF\|/(SQR(CTF)+SQR(NSexp(aR))) (No phase-flipping: Wiener Filter + Noise)

モード	説明
0

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 '''mrcImageDeconvolution'''とは[[Eos]]の[[コマンド]]である。
+== アルゴリズム ==
+<div>Deconvolutionのアルゴリズムは[[mrcImageCTFCompensation]]（電子顕微鏡のＣＴＦに特化）で利用したアルゴリズムに準拠している。</div>
+<br>
 == オプション一覧 ==