「mrcImageFOMCalc」の版間の差分

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行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイル: (テストデータ)</td>  
+
<td>入力ファイル: [[mrcImage]](FFT)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト: (テストデータセット)</td>  
+
<td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-r</td>  
 
<td>-r</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>参照ファイル: (モデルデータ)</td>  
+
<td>参照ファイル: [[mrcImage]](FFT)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行32: 行32:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>出力ファイル</td>  
+
<td>出力ファイル: [[ASCII]]</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行108: 行108:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<div>-i, -I のいずれかは必須項目</div>
 +
<br>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
行120: 行122:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
−
 
+
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルの画像===
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-N-2D.fft|-iのファイル]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N-2D-FFT.png]]<br>
 +
[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">54.0292 (62, 14, 0)<br>
 +
577190 (0, 0, 0)<br>
 +
6065.8<br>
 +
13473.6<br>
 +
168.42<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-2D.fft|-rのファイル]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-2D-FFT.png]]<br>
 +
[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">18.4637 (75, 36, 0)<br>
 +
577032 (0, 0, 0)<br>
 +
3573.53<br>
 +
13475.7<br>
 +
168.446<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>-I のデータ</div>
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-N-2D.fft
 +
Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft
 +
Input-1VOM-N-Rot5-2D.fft
 +
</pre>
 +
<div>Input-1VOM-N-2D.fftは-i のファイルを使用する</div>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft|Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N-Rot3-2D-FFT.png]]<br>
 +
[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">57.2237 (78, 32, 0)<br>
 +
520564 (0, 0, 0)<br>
 +
4898.64<br>
 +
12077.5<br>
 +
150.969<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-N-Rot5-2D.fft|Input-1VOM-N-Rot5-2D.fft]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N-Rot5-2D-FFT.png]]<br>
 +
[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">83.3568 (76, 55, 0)<br>
 +
521761 (0, 0, 0)<br>
 +
4886.83<br>
 +
12609.7<br>
 +
157.621<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===-i のデータで実行===
 +
====その他のオプション設定なし====
 +
<pre>
 +
##Sector index    0/    1        0.00      90.00      90.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152          114    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====w=2.0で実行====
 +
<pre>
 +
##Sector index    0/    1        0.00      90.00      90.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01        0.8142          114    8.6251e+02    2.0000e+00
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====RR=(0.1, 0.2)で実行====
 +
<pre>
 +
##Sector index    0/    1        0.00      90.00      90.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  1.0000e-01    2.0000e-01        0.8018          316    5.6657e+03    1.0000e+00
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====dR=0.01で実行====
 +
<pre>
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-02          nan            0    0.0000e+00    1.0000e+00
 +
  1.0000e-02    2.0000e-02        0.9995            6    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
  2.0000e-02    3.0000e-02        0.9683            8    1.1485e+03    1.0000e+00
 +
  3.0000e-02    4.0000e-02        0.9902            10    4.7958e+02    1.0000e+00
 +
  4.0000e-02    5.0000e-02        0.9774            4    4.0431e+02    1.0000e+00
 +
  5.0000e-02    6.0000e-02        0.9765            14    3.3161e+02    1.0000e+00
 +
  6.0000e-02    7.0000e-02        0.9611            16    1.1842e+02    1.0000e+00
 +
  7.0000e-02    8.0000e-02        0.8315            18    3.6601e+01    1.0000e+00
 +
  8.0000e-02    9.0000e-02        0.8072            18    1.2327e+02    1.0000e+00
 +
  9.0000e-02    1.0000e-01        0.9391            16    1.8912e+02    1.0000e+00
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===-I のデータで実行===
 +
====その他のオプション設定なし====
 +
<pre>
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
====nS=5で実行====
 +
<pre>
 +
##Sector index    0/    5        0.00      18.00      18.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152          114    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
##Sector index    1/    5      18.00      36.00      18.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01          nan            0    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
##Sector index    2/    5      36.00      54.00      18.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01          nan            0    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
##Sector index    3/    5      54.00      72.00      18.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01          nan            0    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
##Sector index    4/    5      72.00      90.00      18.00
 +
##      minR<        <=maxR          FOM          Num          XMax      Scaling
 +
  0.0000e+00    1.0000e-01          nan            0    5.7563e+03    1.0000e+00
 +
</pre>
 +
<br>

2014年3月17日 (月) 08:30時点における版

mrcImageFOMCalcとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: mrcImage(FFT) NULL
-I 選択 入力ファイルリスト: ASCII NULL
-r 必須 参照ファイル: mrcImage(FFT) NULL
-o 選択 出力ファイル: ASCII stdout
-w 選択 Weight 1.0
-RR 選択 Ring Range (Rmin, Rmax) (0.0, 0.1)
-dR 選択 Ring Width 0.0
-nS 選択 Sector Number 1
-dA 選択 delta Alpha 5
-XMax 選択 Xmax: If not set, one calc Xmax 0.0
-AS 選択 Auto Scaling
-AAS 選択 All Area Auto Scaling 0.05
-RS 選択 R Scaling
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　
-i, -I のいずれかは必須項目


モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-1VOM-N-2D-FFT.png
mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

54.0292 (62, 14, 0)

577190 (0, 0, 0)
6065.8
13473.6

168.42


Input-1VOM-2D-FFT.png
mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

18.4637 (75, 36, 0)

577032 (0, 0, 0)
3573.53
13475.7

168.446


-I のデータ
Input-1VOM-N-2D.fft
Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft
Input-1VOM-N-Rot5-2D.fft
Input-1VOM-N-2D.fftは-i のファイルを使用する

Input-1VOM-N-Rot3-2D-FFT.png
mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

57.2237 (78, 32, 0)

520564 (0, 0, 0)
4898.64
12077.5

150.969

Input-1VOM-N-Rot5-2D-FFT.png
mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

83.3568 (76, 55, 0)

521761 (0, 0, 0)
4886.83
12609.7

157.621


-i のデータで実行

その他のオプション設定なし

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152           114    5.7563e+03    1.0000e+00


w=2.0で実行

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.8142           114    8.6251e+02    2.0000e+00


RR=(0.1, 0.2)で実行

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   1.0000e-01    2.0000e-01        0.8018           316    5.6657e+03    1.0000e+00


dR=0.01で実行

##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-02           nan             0    0.0000e+00    1.0000e+00
   1.0000e-02    2.0000e-02        0.9995             6    5.7563e+03    1.0000e+00
   2.0000e-02    3.0000e-02        0.9683             8    1.1485e+03    1.0000e+00
   3.0000e-02    4.0000e-02        0.9902            10    4.7958e+02    1.0000e+00
   4.0000e-02    5.0000e-02        0.9774             4    4.0431e+02    1.0000e+00
   5.0000e-02    6.0000e-02        0.9765            14    3.3161e+02    1.0000e+00
   6.0000e-02    7.0000e-02        0.9611            16    1.1842e+02    1.0000e+00
   7.0000e-02    8.0000e-02        0.8315            18    3.6601e+01    1.0000e+00
   8.0000e-02    9.0000e-02        0.8072            18    1.2327e+02    1.0000e+00
   9.0000e-02    1.0000e-01        0.9391            16    1.8912e+02    1.0000e+00


-I のデータで実行

その他のオプション設定なし


nS=5で実行

##Sector index     0/    5        0.00       18.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152           114    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     1/    5       18.00       36.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     2/    5       36.00       54.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     3/    5       54.00       72.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     4/    5       72.00       90.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00



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