mrcImageFOMCalc

mrcImageFOMCalcとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	選択	入力ファイル: mrcImage(FFT)	NULL
-I	選択	入力ファイルリスト: ASCII	NULL
-r	必須	参照ファイル: mrcImage(FFT)	NULL
-o	選択	出力ファイル: ASCII	stdout
-w	選択	Weight	1.0
-RR	選択	Ring Range (Rmin, Rmax)	(0.0, 0.1)
-dR	選択	Ring Width	0.0
-nS	選択	Sector Number	1
-dA	選択	delta Alpha	5
-XMax	選択	Xmax: If not set, one calc Xmax	0.0
-AS	選択	Auto Scaling
-AAS	選択	All Area Auto Scaling	0.05
-RS	選択	R Scaling
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-i, -I のいずれかは必須項目

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

-iのファイルの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

54.0292 (62, 14, 0) 577190 (0, 0, 0) 6065.8 13473.6 168.42

-rのファイルの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

18.4637 (75, 36, 0) 577032 (0, 0, 0) 3573.53 13475.7 168.446

-I のデータ

Input-1VOM-N-2D.fft
Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft
Input-1VOM-N-Rot5-2D.fft

Input-1VOM-N-2D.fftは-i のファイルを使用する

Input-1VOM-N-Rot3-2D.fftの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

57.2237 (78, 32, 0) 520564 (0, 0, 0) 4898.64 12077.5 150.969

Input-1VOM-N-Rot5-2D.fftの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

83.3568 (76, 55, 0) 521761 (0, 0, 0) 4886.83 12609.7 157.621

-i のデータで実行

その他のオプション設定なし

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152           114    5.7563e+03    1.0000e+00

w=2.0で実行

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.8142           114    8.6251e+02    2.0000e+00

RR=(0.1, 0.2)で実行

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   1.0000e-01    2.0000e-01        0.8018           316    5.6657e+03    1.0000e+00

dR=0.01で実行

##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-02           nan             0    0.0000e+00    1.0000e+00
   1.0000e-02    2.0000e-02        0.9995             6    5.7563e+03    1.0000e+00
   2.0000e-02    3.0000e-02        0.9683             8    1.1485e+03    1.0000e+00
   3.0000e-02    4.0000e-02        0.9902            10    4.7958e+02    1.0000e+00
   4.0000e-02    5.0000e-02        0.9774             4    4.0431e+02    1.0000e+00
   5.0000e-02    6.0000e-02        0.9765            14    3.3161e+02    1.0000e+00
   6.0000e-02    7.0000e-02        0.9611            16    1.1842e+02    1.0000e+00
   7.0000e-02    8.0000e-02        0.8315            18    3.6601e+01    1.0000e+00
   8.0000e-02    9.0000e-02        0.8072            18    1.2327e+02    1.0000e+00
   9.0000e-02    1.0000e-01        0.9391            16    1.8912e+02    1.0000e+00

-I のデータで実行

その他のオプション設定なし

##Sector index     0/    1        0.00       90.00       90.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        1.3958           342    5.7563e+03    1.0000e+00    2.0000e+00    3.0000e+00

nS=5で実行

##Sector index     0/    5        0.00       18.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01        0.9152           114    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     1/    5       18.00       36.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     2/    5       36.00       54.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     3/    5       54.00       72.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00
##Sector index     4/    5       72.00       90.00       18.00
##      minR<        <=maxR           FOM           Num          XMax       Scaling
   0.0000e+00    1.0000e-01           nan             0    5.7563e+03    1.0000e+00