「mrcImageFeatureExtraction」の版間の差分
提供: Eospedia
(同じ利用者による、間の4版が非表示) | |||
行67: | 行67: | ||
</table> | </table> | ||
− | === | + | ===出力ファイル及び出力結果のフォーマット=== |
<table border="1"> | <table border="1"> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <th> | + | <th>行</th> |
<th>説明</th> | <th>説明</th> | ||
</tr> | </tr> | ||
行197: | 行197: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
− | === | + | ===[[:Media:Input-1VOM-N-2D.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Input- | + | <td>[[画像:Input-1VOM-N-2D.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行207: | 行207: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">-18651.7 (10, 1, 0)<br> |
− | + | 52942.7 (24, 39, 0)<br> | |
− | + | 7214.87<br> | |
− | + | 10067.6<br> | |
− | + | 125.845<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
− | + | <div>実行結果</div> | |
− | + | <pre> | |
− | + | 91.996563 | |
− | + | 1295.891863 | |
− | + | 0.776016 | |
− | + | 3.386222 | |
− | + | 9759.259375 | |
− | + | 0.008844 | |
− | + | 2.132293 | |
− | + | 0.029652 | |
− | + | 2.924688 | |
− | + | 0.677156 | |
− | + | 4.529570 | |
− | + | 0.500184 | |
− | + | 10.848437 | |
− | + | 15.193591 | |
− | + | 1.155461 | |
+ | 1.696806 | ||
+ | 1.225738 | ||
+ | 0.622819 | ||
+ | -0.144452 | ||
+ | 0.485025 | ||
+ | 0.993531 | ||
+ | 2.924688 | ||
+ | 0.273089 | ||
+ | 0.622819 | ||
+ | 1.303438 | ||
+ | 0.491227 | ||
+ | 68.861789 | ||
+ | 523.786401 | ||
+ | 310.082040 | ||
+ | 0.211406 | ||
+ | </pre> | ||
+ | |||
+ | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | 0 0 91.9966 | ||
+ | 1 0 1295.89 | ||
+ | 2 0 0.776016 | ||
+ | 3 0 3.38622 | ||
+ | 4 0 9759.26 | ||
+ | 5 0 0.00884414 | ||
+ | 6 0 2.13229 | ||
+ | 7 0 0.0296521 | ||
+ | 8 0 2.92469 | ||
+ | 9 0 0.677156 | ||
+ | 10 0 4.52957 | ||
+ | 11 0 0.500184 | ||
+ | 12 0 10.8484 | ||
+ | 13 0 15.1936 | ||
+ | 14 0 1.15546 | ||
+ | 15 0 1.69681 | ||
+ | 16 0 1.22574 | ||
+ | 17 0 0.622819 | ||
+ | 18 0 -0.144452 | ||
+ | 19 0 0.485025 | ||
+ | 20 0 0.993531 | ||
+ | 21 0 2.92469 | ||
+ | 22 0 0.273089 | ||
+ | 23 0 0.622819 | ||
+ | 24 0 1.30344 | ||
+ | 25 0 0.491227 | ||
+ | 26 0 68.8618 | ||
+ | 27 0 523.786 | ||
+ | 28 0 310.082 | ||
+ | 29 0 0.211406 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -cr=== | ===オプション -cr=== | ||
− | ====cr= | + | ====cr=2で実行==== |
− | + | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | |
− | + | <pre> | |
− | + | 0 0 91.9966 | |
− | + | 1 0 1295.89 | |
− | + | 2 0 0.776016 | |
− | + | 3 0 3.38622 | |
− | + | 4 0 9759.26 | |
− | + | 5 0 0.00884414 | |
− | + | 6 0 2.13229 | |
− | + | 7 0 0.0281689 | |
− | + | 8 0 3.50906 | |
− | + | 9 0 0.612649 | |
− | + | 10 0 4.52957 | |
− | + | 11 0 0.474789 | |
− | + | 12 0 10.8484 | |
− | + | 13 0 14.6092 | |
− | + | 14 0 1.15028 | |
+ | 15 0 1.72495 | ||
+ | 16 0 1.47398 | ||
+ | 17 0 0.654255 | ||
+ | 18 0 -0.115791 | ||
+ | 19 0 0.436992 | ||
+ | 20 0 0.937231 | ||
+ | 21 0 3.50906 | ||
+ | 22 0 0.259241 | ||
+ | 23 0 0.654255 | ||
+ | 24 0 1.42656 | ||
+ | 25 0 0.491227 | ||
+ | 26 0 68.8618 | ||
+ | 27 0 523.786 | ||
+ | 28 0 310.082 | ||
+ | 29 0 0.211406 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
===オプション -ct=== | ===オプション -ct=== | ||
− | ====ct= | + | ====ct=10で実行==== |
− | + | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | |
− | + | <pre> | |
− | + | 0 0 91.9966 | |
− | + | 1 0 1295.89 | |
− | + | 2 0 0.776016 | |
− | + | 3 0 3.38622 | |
− | + | 4 0 9759.26 | |
− | + | 5 0 0.00884414 | |
− | + | 6 0 2.13229 | |
− | + | 7 0 0.145147 | |
− | + | 8 0 0 | |
− | + | 9 0 1 | |
− | + | 10 0 4.52957 | |
− | + | 11 0 1 | |
− | + | 12 0 10.8484 | |
− | + | 13 0 18.1183 | |
− | + | 14 0 0.915479 | |
+ | 15 0 0.915479 | ||
+ | 16 0 0 | ||
+ | 17 0 -0 | ||
+ | 18 0 -0.988124 | ||
+ | 19 0 0.916365 | ||
+ | 20 0 1 | ||
+ | 21 0 0 | ||
+ | 22 0 1 | ||
+ | 23 0 -0 | ||
+ | 24 0 0 | ||
+ | 25 0 0.491227 | ||
+ | 26 0 68.8618 | ||
+ | 27 0 523.786 | ||
+ | 28 0 310.082 | ||
+ | 29 0 0.211406 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
− | ===オプション -=== | + | ===オプション -rt=== |
− | ==== | + | ====rt=1で実行==== |
− | + | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | |
− | + | <pre> | |
− | + | 0 0 91.9966 | |
− | + | 1 0 1295.89 | |
− | + | 2 0 0.776016 | |
− | + | 3 0 3.38622 | |
− | + | 4 0 9759.26 | |
− | + | 5 0 0.00884414 | |
− | + | 6 0 2.13229 | |
− | + | 7 0 0.0296521 | |
− | + | 8 0 2.92469 | |
− | + | 9 0 0.677156 | |
− | + | 10 0 4.52957 | |
− | + | 11 0 0.500184 | |
− | + | 12 0 10.8484 | |
− | + | 13 0 15.1936 | |
− | + | 14 0 1.15546 | |
+ | 15 0 1.69681 | ||
+ | 16 0 1.22574 | ||
+ | 17 0 0.622819 | ||
+ | 18 0 -0.144452 | ||
+ | 19 0 0.485025 | ||
+ | 20 0 0.993531 | ||
+ | 21 0 2.92469 | ||
+ | 22 0 0.273089 | ||
+ | 23 0 0.622819 | ||
+ | 24 0 1.30344 | ||
+ | 25 0 0.491227 | ||
+ | 26 0 68.8618 | ||
+ | 27 0 523.786 | ||
+ | 28 0 310.082 | ||
+ | 29 0 0.211406 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -rt=== | ||
+ | ====rt=1で実行==== | ||
+ | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | 0 0 91.9966 | ||
+ | 1 0 1295.89 | ||
+ | 2 0 0.776016 | ||
+ | 3 0 3.38622 | ||
+ | 4 0 9759.26 | ||
+ | 5 0 0.00884414 | ||
+ | 6 0 2.13229 | ||
+ | 7 0 0.0296521 | ||
+ | 8 0 2.92469 | ||
+ | 9 0 0.677156 | ||
+ | 10 0 4.52957 | ||
+ | 11 0 0.500184 | ||
+ | 12 0 10.8484 | ||
+ | 13 0 15.1936 | ||
+ | 14 0 1.15546 | ||
+ | 15 0 1.69681 | ||
+ | 16 0 1.22574 | ||
+ | 17 0 0.622819 | ||
+ | 18 0 -0.144452 | ||
+ | 19 0 0.485025 | ||
+ | 20 0 0.993531 | ||
+ | 21 0 2.92469 | ||
+ | 22 0 0.273089 | ||
+ | 23 0 0.622819 | ||
+ | 24 0 1.30344 | ||
+ | 25 0 0.00015625 | ||
+ | 26 0 6400 | ||
+ | 27 0 80 | ||
+ | 28 0 80 | ||
+ | 29 0 0.0125 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> |
2014年1月29日 (水) 06:35時点における最新版
mrcImageFeatureExtractionとは画像の特徴量(現時点で30通り)の抽出を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-cr | 選択 | Co-Occurrence radius | 1 |
-ct | 選択 | Co-Occurrence theta | 0 |
-rt | 選択 | RunLength theta | 0 |
-rd | 選択 | RunLength devision | 4 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
出力ファイル及び出力結果のフォーマット
行 | 説明 |
---|---|
0 | densityhistgram average |
1 | densityhistgram variance |
2 | densityhistgram skewness |
3 | densityhistgram kurtosis |
4 | densityhistgram contrast |
5 | densityhistgram energy |
6 | densityhistgram entropy |
7 | co-occurrence anguler second moment |
8 | co-occurrence contrast |
9 | co-occurrence correlation |
10 | co-occurrence sum of square: variance |
11 | co-occurrence inverse difference moment |
12 | co-occurrence sum average |
13 | co-occurrence sum variance |
14 | co-occurrence sum entropy |
15 | co-occurrence entropy |
16 | co-occurrence difference variance |
17 | co-occurrence difference entropy |
18 | co-occurrence information measure of correlation 1 |
19 | co-occurrence information measure of correlation 2 |
20 | co-occurrence maximal correlation coefficient |
21 | difference statistics contrast |
22 | difference statistics anguler second moment |
23 | difference statistics entropy |
24 | difference statistics mean |
25 | runlength short runs emphasis |
26 | runlength long runs emphasis |
27 | runlength gray level nonuniformity |
28 | runlength run length nonuniformity |
29 | runlength run percentage |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
オプション必須項目のみの場合
実行結果
91.996563 1295.891863 0.776016 3.386222 9759.259375 0.008844 2.132293 0.029652 2.924688 0.677156 4.529570 0.500184 10.848437 15.193591 1.155461 1.696806 1.225738 0.622819 -0.144452 0.485025 0.993531 2.924688 0.273089 0.622819 1.303438 0.491227 68.861789 523.786401 310.082040 0.211406
出力ファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 91.9966 1 0 1295.89 2 0 0.776016 3 0 3.38622 4 0 9759.26 5 0 0.00884414 6 0 2.13229 7 0 0.0296521 8 0 2.92469 9 0 0.677156 10 0 4.52957 11 0 0.500184 12 0 10.8484 13 0 15.1936 14 0 1.15546 15 0 1.69681 16 0 1.22574 17 0 0.622819 18 0 -0.144452 19 0 0.485025 20 0 0.993531 21 0 2.92469 22 0 0.273089 23 0 0.622819 24 0 1.30344 25 0 0.491227 26 0 68.8618 27 0 523.786 28 0 310.082 29 0 0.211406
オプション -cr
cr=2で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 91.9966 1 0 1295.89 2 0 0.776016 3 0 3.38622 4 0 9759.26 5 0 0.00884414 6 0 2.13229 7 0 0.0281689 8 0 3.50906 9 0 0.612649 10 0 4.52957 11 0 0.474789 12 0 10.8484 13 0 14.6092 14 0 1.15028 15 0 1.72495 16 0 1.47398 17 0 0.654255 18 0 -0.115791 19 0 0.436992 20 0 0.937231 21 0 3.50906 22 0 0.259241 23 0 0.654255 24 0 1.42656 25 0 0.491227 26 0 68.8618 27 0 523.786 28 0 310.082 29 0 0.211406
オプション -ct
ct=10で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 91.9966 1 0 1295.89 2 0 0.776016 3 0 3.38622 4 0 9759.26 5 0 0.00884414 6 0 2.13229 7 0 0.145147 8 0 0 9 0 1 10 0 4.52957 11 0 1 12 0 10.8484 13 0 18.1183 14 0 0.915479 15 0 0.915479 16 0 0 17 0 -0 18 0 -0.988124 19 0 0.916365 20 0 1 21 0 0 22 0 1 23 0 -0 24 0 0 25 0 0.491227 26 0 68.8618 27 0 523.786 28 0 310.082 29 0 0.211406
オプション -rt
rt=1で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 91.9966 1 0 1295.89 2 0 0.776016 3 0 3.38622 4 0 9759.26 5 0 0.00884414 6 0 2.13229 7 0 0.0296521 8 0 2.92469 9 0 0.677156 10 0 4.52957 11 0 0.500184 12 0 10.8484 13 0 15.1936 14 0 1.15546 15 0 1.69681 16 0 1.22574 17 0 0.622819 18 0 -0.144452 19 0 0.485025 20 0 0.993531 21 0 2.92469 22 0 0.273089 23 0 0.622819 24 0 1.30344 25 0 0.491227 26 0 68.8618 27 0 523.786 28 0 310.082 29 0 0.211406
オプション -rt
rt=1で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 91.9966 1 0 1295.89 2 0 0.776016 3 0 3.38622 4 0 9759.26 5 0 0.00884414 6 0 2.13229 7 0 0.0296521 8 0 2.92469 9 0 0.677156 10 0 4.52957 11 0 0.500184 12 0 10.8484 13 0 15.1936 14 0 1.15546 15 0 1.69681 16 0 1.22574 17 0 0.622819 18 0 -0.144452 19 0 0.485025 20 0 0.993531 21 0 2.92469 22 0 0.273089 23 0 0.622819 24 0 1.30344 25 0 0.00015625 26 0 6400 27 0 80 28 0 80 29 0 0.0125