「mrcImageFourierShellCorrelation」の版間の差分

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(実行例)
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<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-i1</td>  
 
<td>-i1</td>  
<td>必須</td>  
+
<td>選択</td>  
<td>入力[mrcImage]: 3D from one set</td>  
+
<td>入力: [[mrcImage]]: 3D from one set</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-i2</td>  
 
<td>-i2</td>  
<td>必須</td>  
+
<td>選択</td>  
<td>入力[mrcImage]: 3D from another set</td>  
+
<td>入力: [[mrcImage]]: 3D from another set</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-d</td>  
 
<td>-d</td>  
<td>必須</td>  
+
<td>選択</td>  
<td>入力: Delta [A-1]</td>  
+
<td>入力: Delta [A-1] (Default 1/(Nx*size of pixel)</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-z</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>相関参照ファイルのzの位置(M=2のみ)</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-L</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Low threshold (m=+2で使用)</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-H</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>High threshold (m=+2で使用)</td>
 +
<td>0</td>
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</tr>
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 +
<td>-I1</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>InputDataFiles</td>
 +
<td>stdin</td>
 +
</tr>
 +
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 +
<td>-c</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>コンフィグファイル設定</td>
 +
<td>NULL</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-m</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>モードを設定</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-h</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>ヘルプを表示</td>
 +
<td> </td>
 
</tr>  
 
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</div>  
 
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===モードの詳細===
+
===-m の詳細===
 
<table border="1">  
 
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<div align="left">  
 
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<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>Fourier Shell Phase Residual(FSPR)</td>  
 
<td>Fourier Shell Phase Residual(FSPR)</td>  
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<tr>
 +
<td>+2</td>
 +
<td>Correlation between L and H</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+4</td>
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<td>Without equator</td>
 
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===-M の詳細===
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<th>モード</th>
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<th>説明</th>
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<td>0</td>
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<td>Correlation between same size images</td>
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<td>1</td>
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<td>Correlation between 2D image and image extracted from 3D image</td>
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</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+2</td>
 +
<td>Correlation between 2D different size images. In1 is compared with center of In2</td>
 +
</tr>
 +
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 +
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==

2013年11月19日 (火) 07:57時点における版

mrcImageFourierShellCorrelationとはmrcImage型の三次元像の表示するためのEosコマンドである。

アルゴリズム

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i1 選択 入力: mrcImage: 3D from one set NULL
-i2 選択 入力: mrcImage: 3D from another set NULL
-d 選択 入力: Delta [A-1] (Default 1/(Nx*size of pixel) 0
-z 選択 相関参照ファイルのzの位置(M=2のみ) 0
-L 選択 Low threshold (m=+2で使用) 0
-H 選択 High threshold (m=+2で使用) 0
-I1 選択 InputDataFiles stdin
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

-m の詳細

モード 説明
0 Fourier Shell Correlation(FSC)
1 Fourier Shell Phase Residual(FSPR)
+2 Correlation between L and H
+4 Without equator

-M の詳細

モード 説明
0 Correlation between same size images
1 Correlation between 2D image and image extracted from 3D image
+2 Correlation between 2D different size images. In1 is compared with center of In2


実行例

$ mrcImageFourierCorrealation -i1 aa1 -i2 aa2 -d 0.005 > aa.FSC

参考文献

[Fourier_Sell_Correlation]