「mrcImageGaussSphere」の版間の差分
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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− | + | <div>ファイルサイズ=(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)</div> | |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
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==実行例== | ==実行例== | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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===------オプション -sigma_range------=== | ===------オプション -sigma_range------=== | ||
====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ||
− | ====-sigma_range=3(デフォルト)の場合==== | + | =====-sigma_range=3(デフォルト)の場合===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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</td> | </td> | ||
</table> | </table> | ||
− | ====-sigma_range=2の場合==== | + | =====-sigma_range=2の場合===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-sigma_range2-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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===------オプション -weight------=== | ===------オプション -weight------=== | ||
====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ||
− | ====-weight=10(デフォルト)の場合==== | + | =====-weight=10(デフォルト)の場合===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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</table> | </table> | ||
− | ====-weight=30の場合==== | + | =====-weight=30の場合===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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===------オプション -size------=== | ===------オプション -size------=== | ||
====-sigmaz=1で実行==== | ====-sigmaz=1で実行==== | ||
− | ====-size=1で実行==== | + | =====-size=1で実行===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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===------オプション -W,-H------=== | ===------オプション -W,-H------=== | ||
====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行==== | ||
− | ====-W=500,-H=500,-S=500に設定する==== | + | =====-W=500,-H=500,-S=500に設定する===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行308: | 行309: | ||
<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行323: | 行324: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | + | <div>※ピクセルサイズがデフォルト(5)となっているので、x軸およびy軸の幅は100となる</div> | |
===------オプション -m------=== | ===------オプション -m------=== | ||
====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行==== | ====-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行==== | ||
− | ====モード:0==== | + | =====モード:0===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行345: | 行346: | ||
<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行361: | 行362: | ||
</table> | </table> | ||
− | ====モード:2==== | + | =====モード:2===== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行379: | 行380: | ||
<td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | <td>z軸の中央部分の切断面を表示<br> | ||
------></td> | ------></td> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> |
2014年7月25日 (金) 00:16時点における最新版
mrcImageGaussSphereとはガウス球の作成を行うEosのコマンドである。。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | NULL | デフォルト |
---|---|---|---|
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage | NULL |
-sigmax | 選択 | 物体のx軸の幅を設定 | 10 |
-sigmay | 選択 | 物体のy軸の幅を設定 | 20 |
-sigmaz | 選択 | 物体のz軸の幅を設定 | 30 |
-sigma_range | 選択 | 画像データの大きさを設定 | 3 |
-weight | 選択 | 物体の高さを設定 | 10 |
-size | 選択 | ピクセルのサイズを設定 | 5 |
-W | 選択 | 画像データの幅(x軸)を設定 | 0 |
-H | 選択 | 画像データの高さ(y軸)を設定 | 0 |
-S | 選択 | 画像データの奥行き(z軸)を設定 | 0 |
-m | 選択 | モード | 2 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | char(1バイト) |
2 | float(4バイト) |
実行例
------必須項目のオプションのみの場合------
最小 最大 |
1.87953e-11 10 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
1.523e-07 10 |
------オプション -sigmax,-sigmay,-sigmaz------
-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行
最小 最大 |
1.87953e-11 10 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
1.523e-07 10 |
------オプション -sigma_range------
-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行
-sigma_range=3(デフォルト)の場合
最小 最大 |
2.94008e-10 0.0193046 |
-sigma_range=2の場合
最小 最大 |
0.00335463 0.0193046 |
------オプション -weight------
-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行
-weight=10(デフォルト)の場合
最小 最大 |
2.94008e-10 0.0193046 |
-weight=30の場合
最小 最大 |
8.82023e-10 0.0579137 |
------オプション -size------
-sigmaz=1で実行
-size=1で実行
最小 最大 |
1.87953e-11 10 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
1.523e-07 10 |
------オプション -W,-H------
-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行
-W=500,-H=500,-S=500に設定する
最小 最大 |
0 0.0192083 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
1.00707e-23 0.0192083 |
------オプション -m------
-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行
モード:0
最小 最大 |
0 9 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
0 9 |
モード:2
最小 最大 |
1.19151e-31 9.92528 |
z軸の中央部分の切断面を表示 ------> |
最小 最大 |
5.20371e-21 9.92528 |