mrcImageGaussSphere

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mrcImageGaussSphere

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-sigmax 選択 物体のx軸の幅を設定 10
-sigmay 選択 物体のy軸の幅を設定 20
-sigmaz 選択 物体のz軸の幅を設定 30
-sigma_range 選択 画像データの大きさを設定 3
-weight 選択 物体の高さを設定 10
-size 選択 ピクセルのサイズを設定 5
-W 選択 画像データの幅(x軸)を設定 0
-H 選択 画像データの高さ(y軸)を設定 0
-S 選択 画像データの奥行き(z軸)を設定 0
-m 選択 モード 2
-h 選択 ヘルプを表示  
ファイルサイズ=(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)

モードの詳細

モード 説明
0 char(1バイト)
2 float(4バイト)


実行例

------必須項目のオプションのみの場合------

Outdata-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.222265
0.858162

0.00782576

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.773306
1.80792

0.100285

------オプション -sigmax,-sigmay,-sigmaz------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行

Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.24531
0.898424

0.00188576

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.84426
1.87314

0.0307072

------オプション -sigma_range------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-sigma_range=3(デフォルト)の場合
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

-sigma_range=2の場合
Outdata-xy50z1-sigma range2-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.00335463

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

------オプション -weight------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-weight=10(デフォルト)の場合
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

-weight=30の場合
Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

8.82023e-10

0.0579137
0.00488942
0.010848

0.00012575

------オプション -size------

-sigmaz=1で実行

-size=1で実行
Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.215562
0.852389

0.00375

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.851235
1.87929

0.0218744

------オプション -W,-H------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-W=500,-H=500,-S=500に設定する
Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

0.0192083
1.21294e-05
0.000341949

3.41949e-07

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.00707e-23

0.0192083
0.00060647
0.00234222

2.34222e-05

※ピクセルサイズがデフォルト(5)となっているので、x軸およびy軸の幅は100となる

------オプション -m------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行

モード:0
Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

9
0.0378
0.38963

0.00038963

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

9
0.2476
1.10666

0.0110666

モード:2
Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.19151e-31

9.92528
0.0556833
0.440193

0.000440193

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

5.20371e-21

9.92528
0.313375
1.21027

0.0121027