「mrcImageHelicalAveraging」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイル</td> | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
− | === | + | ===[[Media:Input-ThickFilaments1.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
− | [[Media:Input-ThickFilaments1.mrc | 入力ファイル]] | + | |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Input-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Input-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Input1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Input1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-N-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-N-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-N-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-N-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-dz-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-dz-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-dz-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dz-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行188: | 行195: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-dp-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-dp-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-dp-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dp-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-m1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-m1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m1-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m1W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-m1W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-m1W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m1W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行259: | 行272: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m2-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-m2-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-m2-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m2-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m2W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-m2W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
− | xy平面<br></td> | + | xy平面<br></p> |
− | <td>[[画像:Outdata1-m2W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> | + | </td> |
− | yz平面<br></td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m2W-mrcImageHelicalAveraging.png]]<br> |
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> |
2014年7月25日 (金) 00:59時点における最新版
mrcImageHelicalAveragingとはらせん対称(連続らせん)に従って平均した画像を求めるEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-dz | 選択 | deltaz [A] | 27.3 |
-dp | 選択 | deltaphi [degree] | -167.143 |
-N | 選択 | 平均粒子数 | 1 |
-W | 選択 | Window size to average [pixel] | 1 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | Discrete (-Nが必要) |
1 | Continuous (-Wが必要) |
2 | Continuous (-Wが必要), Data are weighted by exp(- (dz/W)^2) |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 4.07334 (34, 9, 75) |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 4.07334 (34, 9, 75) |
オプション -N
N=3で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 10.9537 (59, 35, 0) |
オプション -dz
dz=10, N=3で実行
最小 最大 |
-0.178582 (10, 26, 64) 1.35778 (34, 9, 75) |
オプション -dp
dp=100, N=3で実行
最小 最大 |
-0.188671 (36, 59, 41) 1.35778 (34, 9, 75) |
オプション -m
m=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
-0.592748 (68, 64, 76) 4.09975 (67, 63, 76) |
W=3で実行
最小 最大 |
-0.592748 (68, 64, 76) 4.32666 (1, 67, 44) |
m=2で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
-0.21806 (68, 64, 76) 4.07334 (34, 9, 75) |
W=3で実行
最小 最大 |
-0.614633 (38, 8, 36) 4.23353 (37, 59, 40) |