「mrcImageHelicalMaskingBy2DImage」の版間の差分
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| − | '''mrcImageHelicalMaskingBy2DImage''' | + | '''mrcImageHelicalMaskingBy2DImage'''とは3Dのフィラメントを2D画像でマスクする[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td> | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]](3D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](3D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-M</td> | <td>-M</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力マスク | + | <td>入力マスク: [[mrcImage]](2D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| − | === | + | ===[[Media:Input-ThickFilaments0.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Input-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]</td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Input-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> |
| + | xy平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Input1-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> | ||
| + | yz平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
| − | + | 1.43952 (47, 41, 66)<br> | |
| − | + | 0.00305596<br> | |
| − | + | 0.0562718<br> | |
| − | + | 8.15533e-05<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| − | === | + | |
| + | ===[[Media:Input-ThickFilaments0-20.mrc|入力マスク]]の画像=== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行104: | 行110: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
| − | + | 1 (34, 19, 0)<br> | |
| − | + | 0.0042008<br> | |
| − | + | 0.0646773<br> | |
| − | + | 0.000937352<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]</td> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> |
| + | xy平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> | ||
| + | yz平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行123: | 行135: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">-62.5667 (19, 31, 56)<br> |
| − | + | 332.11 (23, 24, 33)<br> | |
| − | + | 0.129677<br> | |
| − | + | 4.1656<br> | |
| − | + | 0.00603711<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション -dz=== | ===オプション -dz=== | ||
| − | ====dz= | + | ====dz=10で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-dz-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> |
| + | xy平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dz-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> | ||
| + | yz平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行143: | 行161: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">-58.8023 (41, 47, 56)<br> |
| − | + | 373.883 (27, 21, 38)<br> | |
| − | + | 0.131239<br> | |
| − | + | 4.28449<br> | |
| − | + | 0.00620941<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション -dp=== | ===オプション -dp=== | ||
| − | ====dp= | + | ====dp=20で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-dp-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> |
| + | xy平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dp-mrcImageHelicalMaskingBy2DImage.png]]<br> | ||
| + | yz平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行163: | 行187: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">-69.6051 (45, 44, 59)<br> |
| − | + | 353.035 (47, 41, 47)<br> | |
| − | + | 0.136908<br> | |
| − | + | 4.30263<br> | |
| − | + | 0.0062357<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
2014年2月5日 (水) 05:02時点における最新版
mrcImageHelicalMaskingBy2DImageとは3Dのフィラメントを2D画像でマスクするEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage(3D) | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage(3D) | NULL |
| -dz | 選択 | deltaz(A) | 27.3 |
| -dp | 選択 | deltaphi(degree) | 13.84 |
| -M | 必須 | 入力マスク: mrcImage(2D) | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
|
|
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.43952 (47, 41, 66) |
入力マスクの画像
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1 (34, 19, 0) |
オプション必須項目のみの場合
|
|
最小 最大 |
-62.5667 (19, 31, 56) 332.11 (23, 24, 33) |
オプション -dz
dz=10で実行
|
|
最小 最大 |
-58.8023 (41, 47, 56) 373.883 (27, 21, 38) |
オプション -dp
dp=20で実行
|
|
最小 最大 |
-69.6051 (45, 44, 59) 353.035 (47, 41, 47) |
