mrcImageInfo
提供: Eospedia
mrcImageInfoとはmrcファイルの画像の情報を表示するためのEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定 | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル設定 | stdout(設定しなければ標準出力) |
-I[nfo] | 選択 | このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される | |
-X | 選択 | X Section at y=X(value) | 0.0 |
-Y | 選択 | Y Section at y=Y(value) | 0.0 |
-x | 選択 | x Projection[OutPut ASCII FILE] | |
-y | 選択 | y Projection[OutPut ASCII FILE] | |
-H | 選択 | Histgram: Class Number: Normalize | 256 |
-H2 | 選択 | Histgram2: Class Width: Integer: Normalize | 1 |
-H3 | 選択 | Histgram: Class Number: Count | 256 |
-H4 | 選択 | Histgram2: Class Width: Integer: Count | 1 |
-H5 | 選択 | Histgram5: Class Number: Count | 1 |
-H6 | 選択 | Histgram6: Class Width: Integer: Count | 1 |
-Low | 選択 | Low : thres | 1 |
-High | 選択 | High: thres | 1 |
-rmax | 選択 | rmax [A] | 250 |
-c | 選択 | NULL | |
-m | 選択 | 0 | |
-h | 選択 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | mean of all density |
1 | mean of sphere surface density at rmax |
2 | mean of cylinder surface density at rmax |
3 | mean of edge pixels |
4 | mean of Centre |
5 | mean of Sparse |
6 | mean of 2DEdge |
7 | RMS of all pixels |
実行例
入力ファイルの画像
-Iで実行
Min: 0 (41, 10, 0) 最小 Max: 255 (42, 36, 0) 最大 Mean: 111.211 平均値 SD: 32.7239 標準偏差 SE: 0.409049 標準誤差 Sum: 711751