mrcImageInfo

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2013年11月20日 (水) 03:31時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

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mrcImageInfoとはmrcImageファイルの画像の情報を表示するためのEosコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 NULL
-o 選択 出力ファイル設定 stdout(設定しなければ標準出力)
-I 選択 このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される
-X 選択 出力: x=Xの値: テキスト 0.0
-Y 選択 出力: y=Yの値: テキスト 0.0
-x 選択 出力: x軸への投影: テキスト
-y 選択 出力: y軸への投影: テキスト
-H 選択 ヒストグラム出力(Normalize): 分割数設定 256
-H2 選択 ヒストグラム出力(Normalize): 幅設定 1
-H3 選択 ヒストグラム出力(Count): 分割数設定 256
-H4 選択 ヒストグラム出力(Count): 幅設定 1
-H5 選択 ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 分割数設定 1
-H6 選択 ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 幅設定 1
-Low 選択 閾値(出力の開始点) 1
-High 選択 閾値(出力の終了点) 1
-rmax 選択 rmax [A] 250
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 mean of all density
1 mean of sphere surface density at rmax
2 mean of cylinder surface density at rmax
3 mean of edge pixels
4 mean of Centre
5 mean of Sparse
6 mean of 2DEdge
7 RMS of all pixels


実行例

入力ファイルの画像

B120-2-mrcImageInfo.png


オプション必須項目のみの場合

オプションなしでは何も出力されない。

オプション -I

Min:               0 (41, 10, 0)	最小値(最小を取る座標)
Max:             255 (42, 36, 0)	最大値(最大を取る座標)
Mean:         111.211		平均値
SD:          32.7239			標準偏差
SE:         0.409049			標準誤差
Sum:          711751			

オプション -X

X=40で実行

    0             117
    1             118
    2             128
    3             100
    4             133
    5              70

-中略-

   74             118
   75              73
   76              83
   77              97
   78              79
   79              96


オプション -Y

Y=40で実行

    0             105
    1             130
    2              76
    3              98
    4             113
    5              86

-中略-

   74             131
   75             111
   76              97
   77              79
   78              71
   79             128

オプション -x

    0             230
    1               2
    2              23
    3             157
    4             107
    5             108

-中略-

   74             197
   75              57
   76             118
   77             157
   78              49
   79             102

オプション -y

    0              66
    1             116
    2             223
    3             135
    4             185
    5             231

-中略-

   74             154
   75             158
   76             177
   77             189
   78             244
   79               5

オプション -H

H=256で実行

              0      0.00990099 | *
              1               0 |*
              2               0 |*
              3               0 |*
              4               0 |*
              5               0 |*

-中略-

             62        0.217822 |    *
             63        0.326733 |      *
             64        0.306931 |     *
             65        0.267327 |     *
             66        0.326733 |      *
             67        0.336634 |      *
             68        0.287129 |     *
             69        0.356436 |      *
             70        0.356436 |      *
             71        0.386139 |       *
             72         0.39604 |       *
             73        0.386139 |       *
             74        0.415842 |       *
             75        0.386139 |       *
             76        0.465347 |        *
             77        0.475248 |        *
             78        0.475248 |        *
             79        0.584158 |          *
             80         0.50495 |         *

-中略-

            116        0.920792 |               *
            117        0.920792 |               *
            118        0.683168 |           *
            119               1 |                *
            120        0.782178 |             *
            121        0.712871 |            *
            122        0.623762 |          *
            123        0.594059 |          *
            124        0.653465 |           *
            125         0.70297 |            *
            126         0.70297 |            *
            127        0.653465 |           *
            128        0.613861 |          *
            129        0.633663 |           *
            130        0.485149 |        *
            131        0.564356 |          *
            132        0.514851 |         *
            133        0.475248 |        *
            134        0.405941 |       *

-中略-

            250               0 |*
            251               0 |*
            252               0 |*
            253               0 |*
            254               0 |*
            255      0.00990099 | *


オプション -H2

H2=2で実行

              0      0.00540541 | *
              2               0 |*
              4               0 |*
              6               0 |*
              8       0.0108108 | *
             10               0 |*

-中略-

             62        0.259459 |     *
             64        0.345946 |      *
             66        0.324324 |      *
             68        0.340541 |      *
             70        0.389189 |       *
             72        0.427027 |       *
             74        0.437838 |        *
             76        0.464865 |        *
             78        0.518919 |         *
             80        0.594595 |          *

-中略-

            116        0.989189 |                *
            118        0.875676 |               *
            120        0.972973 |                *
            122         0.72973 |            *
            124        0.681081 |           *
            126        0.767568 |             *
            128        0.691892 |            *
            130        0.610811 |          *
            132        0.589189 |          *
            134        0.481081 |        *

-中略-

            244      0.00540541 | *
            246       0.0108108 | *
            248      0.00540541 | *
            250               0 |*
            252               0 |*
            254               0 |*

オプション -H3

H3=256で実行

              0               1 
              1               0 
              2               0 
              3               0 
              4               0 
              5               0 

-中略-

            125              71 
            126              71 
            127              66 
            128              62 
            129              64 
            130              49 
            131              57 

-中略-

            250               0 
            251               0 
            252               0 
            253               0 
            254               0 
            255               1 

オプション -H4

H4=1で実行

              0               1 
              1               0 
              2               0 
              3               0 
              4               0 
              5               0 

-中略-

            125              71 
            126              71 
            127              66 
            128              62 
            129              64 
            130              49 
            131              57 

-中略-

            250               0 
            251               0 
            252               0 
            253               0 
            254               0 
            255               1 

オプション -H5

H5=1で実行

            nan     4.54753e-11 | *

オプション -H6

H6=1で実行

              1     4.54753e-11