「mrcImageMakeFromTextFile」の版間の差分

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'''mrcImageMakeFromTextFile'''とは[[Eos]]の[[コマンド]]である。
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'''mrcImageMakeFromTextFile'''とはテキスト形式の画像データから[[mrcImage]]を作成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。
  
  
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<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>入力ファイル: テキスト</td>  
+
<td>入力ファイル: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
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<td>-d</td>  
 
<td>-d</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>d</td>  
+
<td>1ピクセルの刻み幅</td>  
 
<td>2.5</td>  
 
<td>2.5</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行50: 行50:
 
<td>-v</td>  
 
<td>-v</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>default value</td>  
+
<td>デフォルトの値</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
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</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
 +
===入力ファイルのフォーマット===
 +
<pre>
 +
x0 y0 z0 値0
 +
x1 y1 z1 値1
 +
.
 +
.
 +
 +
</pre>
  
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルのデータ===
 +
<pre>
 +
0 0 0 0
 +
1 0 0 3
 +
2 0 0 6
 +
3 0 0 9
 +
4 0 0 12
 +
 +
-中略-
 +
 +
25 0 0 75
 +
26 0 0 78
 +
27 0 0 81
 +
28 0 0 84
 +
29 0 0 87
 +
0 1 0 3
 +
1 1 0 6
 +
2 1 0 9
 +
3 1 0 12
 +
4 1 0 15
 +
 +
-中略-
 +
 +
25 29 0 162
 +
26 29 0 165
 +
27 29 0 168
 +
28 29 0 171
 +
29 29 0 174
 +
</pre>
 +
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-mrcImageMakeFromTextFile.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">174 (0, 0, 0)<br>
 +
174 (0, 0, 0)<br>
 +
174<br>
 +
0<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
===オプション -nx, -ny, -nz===
 +
====nx=50, ny=50, nz=1で実行====
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-n-mrcImageMakeFromTextFile.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
174 (29, 29, 0)<br>
 +
31.32<br>
 +
47.2161<br>
 +
0.944321<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
=====d=1で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-d-mrcImageMakeFromTextFile.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
174 (29, 29, 0)<br>
 +
31.32<br>
 +
47.2161<br>
 +
0.944321<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<div>画像に変化はないが、[[mrcInfo]]にて以下の情報が変化する</div>
 +
<pre>
 +
Length      : (    1.000,      1.000,      1.000)
 +
</pre>
 +
 +
 +
=====v=255で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-v-mrcImageMakeFromTextFile.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
255 (30, 0, 0)<br>
 +
194.52<br>
 +
83.5959<br>
 +
1.67192<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>

2014年7月25日 (金) 05:06時点における最新版

mrcImageMakeFromTextFileとはテキスト形式の画像データからmrcImageを作成するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: ASCII NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-nx 選択 ピクセルサイズ x 1
-ny 選択 ピクセルサイズ y 1
-nz 選択 ピクセルサイズ z 1
-d 選択 1ピクセルの刻み幅 2.5
-v 選択 デフォルトの値 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0

入力ファイルのフォーマット

x0 y0 z0 値0
x1 y1 z1 値1
.
.


実行例

入力ファイルのデータ

0 0 0 0
1 0 0 3
2 0 0 6
3 0 0 9
4 0 0 12

-中略-

25 0 0 75
26 0 0 78
27 0 0 81
28 0 0 84
29 0 0 87
0 1 0 3
1 1 0 6
2 1 0 9
3 1 0 12
4 1 0 15

-中略-

25 29 0 162
26 29 0 165
27 29 0 168
28 29 0 171
29 29 0 174


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageMakeFromTextFile.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

174 (0, 0, 0)

174 (0, 0, 0)
174
0

0


オプション -nx, -ny, -nz

nx=50, ny=50, nz=1で実行

その他のオプション設定なし
Outdata-n-mrcImageMakeFromTextFile.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

174 (29, 29, 0)
31.32
47.2161

0.944321


d=1で実行
Outdata-d-mrcImageMakeFromTextFile.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

174 (29, 29, 0)
31.32
47.2161

0.944321

画像に変化はないが、mrcInfoにて以下の情報が変化する
Length       : (     1.000,      1.000,      1.000)


v=255で実行
Outdata-v-mrcImageMakeFromTextFile.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

255 (30, 0, 0)
194.52
83.5959

1.67192