「mrcImageModelSubfilamentsCreate」の版間の差分
(ページの作成:「'''mrcImageModelSubfilamentsCreate'''とはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプショ...」) |
|||
(同じ利用者による、間の1版が非表示) | |||
行128: | 行128: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 2.09707 (58, 41, 0)<br> | |
− | + | 0.00306044<br> | |
− | + | 0.0749793<br> | |
− | 0. | + | 0.00108666<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]] | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | xy平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align=" | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | yz平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行167: | 行153: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 1.98112 (31, 52, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.00741447<br> |
− | + | 0.0893007<br> | |
− | 0. | + | 0.000125776<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
− | ===オプション -ny=== | + | |
− | ====ny= | + | ===オプション -nx, -ny, -nz=== |
+ | ====nx=99, ny=99, nz=99で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | xy平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align=" | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | yz平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行207: | 行179: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 2.09707 (87, 56, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.00445187<br> |
− | + | 0.0691579<br> | |
− | + | 5.70376e-05<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | ===オプション -lx=== | + | |
− | ====lx= | + | ===オプション -lx, -ly, lz=== |
+ | ====lx=8, ly=8, lz=8で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | xy平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align=" | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
− | + | yz平面<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行247: | 行205: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 2.02889 (41, 2, 20)<br> | |
− | 0. | + | 0.00867218<br> |
− | 0. | + | 0.0969264<br> |
− | 0. | + | 0.000136516<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
===オプション -position=== | ===オプション -position=== | ||
行260: | 行219: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行267: | 行231: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 2.09707 (66, 42, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.00869178<br> |
− | + | 0.0977788<br> | |
− | 0. | + | 0.000137717<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行280: | 行244: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行287: | 行256: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 1.98112 (31, 52, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.0148289<br> |
− | + | 0.125854<br> | |
− | 0. | + | 0.000177259<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行300: | 行269: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行307: | 行281: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 1.98112 (31, 52, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.00741588<br> |
− | + | 0.0894188<br> | |
− | 0. | + | 0.000125942<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行320: | 行294: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> |
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行327: | 行306: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0<br> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 1.98112 (18, 31, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.00741446<br> |
− | + | 0.0893007<br> | |
− | 0. | + | 0.000125776<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> |
2013年12月12日 (木) 05:51時点における最新版
mrcImageModelSubfilamentsCreateとはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-nx | 選択 | Real length = nx * lx | 71 |
-ny | 選択 | Real length = ny * ly | 71 |
-nz | 選択 | Real length = nz * lz | 100 |
-lx | 選択 | ピクセルサイズ[Angstrom] | 5.0 |
-ly | 選択 | ピクセルサイズ[Angstrom] | 5.0 |
-lz | 選択 | ピクセルサイズ[Angstrom] | 5.0 |
-position | 選択 | subfilaments position from center [A] | 70 |
-n | 選択 | n-helix | 3 |
-dphi | 選択 | 回転角度 [degree] | 1.395348837 |
-sphi | 選択 | start angle [degree] | 0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2.09707 (58, 41, 0) |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) |
オプション -nx, -ny, -nz
nx=99, ny=99, nz=99で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2.09707 (87, 56, 0) |
オプション -lx, -ly, lz
lx=8, ly=8, lz=8で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2.02889 (41, 2, 20) |
オプション -position
position=35で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2.09707 (66, 42, 0) |
オプション -n
n=6で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) |
オプション -dphi
dphi=2で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) |
オプション -sphi
sphi=90で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.98112 (18, 31, 0) |