「mrcImageNfoldAxisSearch」の版間の差分
提供: Eospedia
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| 行20: | 行20: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力: centre</td> | + | <td>出力: [[ASCII]](centre)</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-O</td> | <td>-O</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力: shifted Image</td> | + | <td>出力: [[mrcImage]](shifted Image)</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行32: | 行32: | ||
<td>-res</td> | <td>-res</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行181: | 行181: | ||
| − | ===オプション -=== | + | ===オプション -delPHI=== |
| − | ==== | + | ====delPHI=0.1, n=2で実行==== |
<div>出力結果</div> | <div>出力結果</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
| − | + | GC in lmrcImageDeterminationOfPolarAxisByAssumingNfold : 49.2168 51.5903 52.2385 | |
| + | Rotational Symmetry: 2 | ||
</pre> | </pre> | ||
<div>-oのデータ</div> | <div>-oのデータ</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
| + | Centre: 52.2168 48.5903 52.2385 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <div>-Oの画像</div> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-delPHI-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> | ||
| + | xy平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-delPHI-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> | ||
| + | yz平面<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-395.564 (43, 42, 55)<br> | ||
| + | 3015.16 (48, 63, 47)<br> | ||
| + | 11.0585<br> | ||
| + | 120.46<br> | ||
| + | 0.12046<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | <div>-resの画像</div> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata2-delPHI-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">1.29133 (6, 0, 0)<br> | ||
| + | 1.33874 (0, 6, 0)<br> | ||
| + | 1.30831<br> | ||
| + | 0.0115864<br> | ||
| + | 0.0016552<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ===オプション -rangex, -rangey, -rangez=== | ||
| + | ====rangex=(-10, 10, 2), rangey=(-10, 10, 2), rangez=(-10, 10, 2), n=2で実行==== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | GC in lmrcImageDeterminationOfPolarAxisByAssumingNfold : 49.2168 51.5903 52.2385 | ||
| + | Rotational Symmetry: 2 | ||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | <div>-oのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | Centre: 53.2168 55.5903 42.2385 | ||
</pre> | </pre> | ||
| 行196: | 行254: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td><p align="Center">[[画像:Outdata--mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-range-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> |
xy平面<br></p> | xy平面<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1--mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> | + | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-range-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]<br> |
yz平面<br></p> | yz平面<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| 行208: | 行266: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">-395.564 (42, 35, 65)<br> |
| − | <br> | + | 3015.16 (47, 56, 57)<br> |
| − | <br> | + | 11.0585<br> |
| − | <br> | + | 120.46<br> |
| − | <br></p> | + | 0.12046<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行220: | 行278: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata2--mrcImageNfoldAxisSearch.png]]</td> | + | <td>[[画像:Outdata2-range-mrcImageNfoldAxisSearch.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
| 行227: | 行285: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">1.28733 (7, 7, 0)<br> |
| − | <br> | + | 1.37795 (0, 10, 0)<br> |
| − | <br> | + | 1.32145<br> |
| − | <br> | + | 0.0217527<br> |
| − | <br></p> | + | 0.000596245<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
2014年7月28日 (月) 05:06時点における最新版
mrcImageNfoldAxisSearchとは回転対称軸の探索を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力: ASCII(centre) | stdout |
| -O | 選択 | 出力: mrcImage(shifted Image) | stdout |
| -res | 選択 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -n | 必須 | 入力: nFold | 2 |
| -delPHI | 選択 | 入力: delPHI: [degree] | 1.0 |
| -rangex | 選択 | 入力: range: [pixel size]: (minx, maxx, delx) | (-3, 3, 1) |
| -rangey | 選択 | 入力: range: [pixel size]: (miny, maxy, dely) | (-3, 3, 1) |
| -rangez | 選択 | 入力: range: [pixel size]: (minz, maxz, delz) | (-3, 3, 1) |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
|
|
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3500.79 (49, 53, 30) |
オプション必須項目のみの場合
n=2で実行
出力結果
GC in lmrcImageDeterminationOfPolarAxisByAssumingNfold : 49.2168 51.5903 52.2385 Rotational Symmetry: 2
-oのデータ
Centre: 52.2168 53.5903 52.2385
-Oの画像
|
|
最小 最大 |
-395.564 (43, 37, 55) 3015.16 (48, 58, 47) |
-resの画像
 |
最小 最大 |
1.28742 (6, 5, 0) 1.33361 (0, 6, 0) |
オプション -delPHI
delPHI=0.1, n=2で実行
出力結果
GC in lmrcImageDeterminationOfPolarAxisByAssumingNfold : 49.2168 51.5903 52.2385 Rotational Symmetry: 2
-oのデータ
Centre: 52.2168 48.5903 52.2385
-Oの画像
|
|
最小 最大 |
-395.564 (43, 42, 55) 3015.16 (48, 63, 47) |
-resの画像
 |
最小 最大 |
1.29133 (6, 0, 0) 1.33874 (0, 6, 0) |
オプション -rangex, -rangey, -rangez
rangex=(-10, 10, 2), rangey=(-10, 10, 2), rangez=(-10, 10, 2), n=2で実行
出力結果
GC in lmrcImageDeterminationOfPolarAxisByAssumingNfold : 49.2168 51.5903 52.2385 Rotational Symmetry: 2
-oのデータ
Centre: 53.2168 55.5903 42.2385
-Oの画像
|
|
最小 最大 |
-395.564 (42, 35, 65) 3015.16 (47, 56, 57) |
-resの画像
 |
最小 最大 |
1.28733 (7, 7, 0) 1.37795 (0, 10, 0) |
