「mrcImageOrientationSearch」の版間の差分

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(ページの作成:「'''mrcImageOrientationSearch'''とはEosコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプション=== <table border="1"> <tr> ...」)
 
(オプション一覧)
 
(同じ利用者による、間の5版が非表示)
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<td>-I1</td>  
 
<td>-I1</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>入力ファイルリスト1設定</td>  
+
<td>入力ファイル1設定: [[ASCII]](ファイルリスト)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-I2</td>  
 
<td>-I2</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>入力ファイルリスト2設定</td>  
+
<td>入力ファイル2設定: [[ASCII]](ファイルリスト)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>出力ファイル設定</td>  
+
<td>出力ファイル設定: 未実装</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行32: 行32:
 
<td>-T</td>  
 
<td>-T</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>Threshold</td>  
+
<td>閾値: 未実装</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行54: 行54:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
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<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
<td>There is    correlation file name in input file (common line position is determined Max correlation)</td>  
+
<td>There is    correlation file name in input file (common line position is determined Max correlation): 未実装</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>2</td>  
 
<td>2</td>  
<td> There is    correlation file name in input file (common line position is determined Threshold), -T</td>  
+
<td> There is    correlation file name in input file (common line position is determined Threshold), -T: 未実装</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
===入力ファイルリスト1のフォーマット===
+
===-i1のフォーマット===
 
====m=0 の場合====
 
====m=0 の場合====
 
<pre>
 
<pre>
filename1 filename2 commonlineposition1 commonlineposition2 commonlinepositionMode
+
XXXX filename1 filename2 commonlineposition1 commonlineposition2 commonlinepositionMode
      .                .                        .                                  .                                    .
+
    .          .                .                        .                                  .                                    .
      .                .                        .                                  .                                    .
+
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      .                .                        .                                  .                                    .
+
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      .                .                        .                                  .                                    .
+
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</pre>
 
</pre>
 +
<div>1列目のデータXXXXは使用しない<br>
 +
commonlinepositionMode: 1 or z-rotation</div>
 +
<br>
  
 
====m=1, 2 の場合====
 
====m=1, 2 の場合====
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</pre>
 
</pre>
 +
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===-i2 のフォーマット===
 +
<pre>
 +
filename
 +
      .
 +
      .
 +
      .
 +
      .
 +
</pre>
 +
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===-i1 のデータ===
 +
<pre>
 +
1 /Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input1.mrc      275.77      152.88 1
 +
2 /Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input2.mrc      355.67      239.91 1
 +
3 /Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input3.mrc      80.08      158.58 1
 +
4 /Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input4.mrc        0.00        0.00 z-rotation
 +
5 /Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input2.mrc      240.00      300.00 1
 +
6 /Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input3.mrc      168.02      311.98 1
 +
7 /Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input4.mrc      332.88      95.77 1
 +
8 /Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input3.mrc      270.12      242.50 1
 +
9 /Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input4.mrc      59.91      175.67 1
 +
10 /Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      338.58      260.08 1
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===-i2 のデータ===
 +
<pre>
 +
/Eos/img/Input0.mrc
 +
/Eos/img/Input1.mrc
 +
/Eos/img/Input2.mrc
 +
/Eos/img/Input3.mrc
 +
/Eos/img/Input4.mrc
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
angle[0] = 4.813094 >> cosine = 0.100535 sine = -0.994933
 +
angle[1] = 2.668259 >> cosine = -0.890054 sine = 0.455856
 +
angle[2] = 6.207613 >> cosine = 0.997146 sine = -0.075501
 +
angle[3] = 4.187219 >> cosine = -0.501360 sine = -0.865239
 +
angle[4] = 4.188790 >> cosine = -0.500000 sine = -0.866025
 +
angle[5] = 5.235988 >> cosine = 0.500000 sine = -0.866025
 +
cosineXr1 = 0.349082 cosineXr2 = -0.224265
 +
ratio = -0.961585
 +
Xrotation1 = 1.214205 Xrotation2 = 1.796985
 +
 +
filename : /Eos/img/Input0.mrc >>> ZENR (0.000000, 0.000000, 0.000000)
 +
filename : /Eos/img/Input1.mrc >>> ZENR (152.880000, 275.770000, 69.568827)
 +
filename : /Eos/img/Input2.mrc >>> ZENR (239.910000, 355.670000, 102.959645)
 +
 +
filename : /Eos/img/Input0.mrc >>> ZENR (0.000000, 0.000000, 0.000000)
 +
filename : /Eos/img/Input1.mrc >>> ZENR (152.880000, 275.770000, 290.431173)
 +
filename : /Eos/img/Input2.mrc >>> ZENR (239.910000, 355.670000, 257.040355)
 +
</pre>
 +
<br>

2015年3月24日 (火) 00:24時点における最新版

mrcImageOrientationSearchとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I1 必須 入力ファイル1設定: ASCII(ファイルリスト) NULL
-I2 必須 入力ファイル2設定: ASCII(ファイルリスト) NULL
-o 必須 出力ファイル設定: 未実装 NULL
-T 選択 閾値: 未実装 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  


モードの詳細

モード 説明
0 There is one common line position in input file (using Test)
1 There is correlation file name in input file (common line position is determined Max correlation): 未実装
2 There is correlation file name in input file (common line position is determined Threshold), -T: 未実装


-i1のフォーマット

m=0 の場合

XXXX filename1 filename2 commonlineposition1 commonlineposition2 commonlinepositionMode
    .           .                .                        .                                  .                                     .
    .           .                .                        .                                  .                                     .
    .           .                .                        .                                  .                                     .
    .           .                .                        .                                  .                                     .
1列目のデータXXXXは使用しない
commonlinepositionMode: 1 or z-rotation


m=1, 2 の場合

correlationfilename filename1 filename2
            .                        .               .
            .                        .               .
            .                        .               .
            .                        .               .


-i2 のフォーマット

filename 
      .
      .
      .
      .


実行例

-i1 のデータ

1	/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input1.mrc      275.77      152.88 1
2	/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input2.mrc      355.67      239.91 1
3	/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input3.mrc       80.08      158.58 1
4	/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input4.mrc        0.00        0.00 z-rotation
5	/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input2.mrc      240.00      300.00 1
6	/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input3.mrc      168.02      311.98 1
7	/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input4.mrc      332.88       95.77 1
8	/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input3.mrc      270.12      242.50 1
9	/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input4.mrc       59.91      175.67 1
10	/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      338.58      260.08 1


-i2 のデータ

/Eos/img/Input0.mrc
/Eos/img/Input1.mrc
/Eos/img/Input2.mrc
/Eos/img/Input3.mrc
/Eos/img/Input4.mrc


オプション必須項目のみの場合

出力結果
angle[0] = 4.813094 >> cosine = 0.100535 sine = -0.994933
angle[1] = 2.668259 >> cosine = -0.890054 sine = 0.455856
angle[2] = 6.207613 >> cosine = 0.997146 sine = -0.075501
angle[3] = 4.187219 >> cosine = -0.501360 sine = -0.865239
angle[4] = 4.188790 >> cosine = -0.500000 sine = -0.866025
angle[5] = 5.235988 >> cosine = 0.500000 sine = -0.866025
cosineXr1 = 0.349082 cosineXr2 = -0.224265 
ratio = -0.961585 
Xrotation1 = 1.214205 Xrotation2 = 1.796985

filename : /Eos/img/Input0.mrc >>> ZENR (0.000000, 0.000000, 0.000000)
filename : /Eos/img/Input1.mrc >>> ZENR (152.880000, 275.770000, 69.568827)
filename : /Eos/img/Input2.mrc >>> ZENR (239.910000, 355.670000, 102.959645)

filename : /Eos/img/Input0.mrc >>> ZENR (0.000000, 0.000000, 0.000000)
filename : /Eos/img/Input1.mrc >>> ZENR (152.880000, 275.770000, 290.431173)
filename : /Eos/img/Input2.mrc >>> ZENR (239.910000, 355.670000, 257.040355)