「mrcImagePrint」の版間の差分
提供: Eospedia
行578: | 行578: | ||
</table> | </table> | ||
− | ====m=, S=2で実行==== | + | ====m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <th>[[画像:Outdata-m-mrcImagePrint.png]]</th> | + | <th>[[画像:Outdata-m62-mrcImagePrint.png]]</th> |
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -AC=== | ||
+ | ====AC=3, m=62, S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-AC-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -PC=== | ||
+ | ====PC=1, m=62, S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-PC-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -AC2=== | ||
+ | ====AC2=4, m=62, S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-AC2-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> |
2013年11月27日 (水) 06:18時点における版
目次
- 1 オプション一覧
- 2 実行例
- 2.1 入力ファイルの画像
- 2.2 オプション必須項目のみの場合
- 2.3 オプション -S
- 2.4 オプション -H
- 2.5 オプション -L
- 2.6 オプション -Section
- 2.7 オプション -x, -y, -z
- 2.8 オプション -AS
- 2.9 オプション -center
- 2.10 オプション -I
- 2.11 オプション -A
- 2.12 オプション -Y
- 2.13 オプション -ReverseOrder
- 2.14 オプション -untwist
- 2.15 オプション -UpsideDown
- 2.16 オプション -Centre
- 2.17 オプション -m
- 2.18 オプション -AC
- 2.19 オプション -PC
- 2.20 オプション -AC2
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル: psファイル | stdout |
-H | 選択 | High Threshold | 0.0 |
-L | 選択 | Low Threshold | 1.0 |
-Section | 選択 | [z|x|y]Section | z |
-x | 選択 | x section:(xMin, xMax) | (0, 0) |
-y | 選択 | y section:(yMin, yMax) | (0, 0) |
-z | 選択 | z section:(zMin, zMax) | (0, 0) |
-S | 選択 | Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel | 1.0 |
-AS | 選択 | Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) | 1.0 |
-E | 選択 | Enlargement(image center is center) | 1.0 |
-center | 選択 | Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) | (0.0, 0.0) |
-C | 選択 | 可変入力: コンターレベル | 1.0 ... |
-I | 選択 | 反転 | |
-A | 選択 | HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD | |
-AC | 選択 | Auto Contour(thresHigh <-> mean) | 10 |
-PC | 選択 | Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 | 10 |
-AC2 | 選択 | Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) | 10 |
-Y | 選択 | y軸の拡大率 | 1 |
-RGB | 選択 | Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) | (0, 0, 0) |
-RGBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-HSB | 選択 | Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) | (0, 0, 0) |
-HSBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourRGB | 選択 | Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) | (0, 0, 0) |
-LineColourRGBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourHSB | 選択 | Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) | (0, 0, 0) |
-LineColourHSBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineChange | 選択 | Contour Color Change | 0.1 |
-LineWidthStart | 選択 | Contour Line Width Start | 0.1 |
-LineWidthStep | 選択 | Contour Line Width Step | 0.05 |
-ReverseOrder | 選択 | ページを逆順にする | |
-Untwist | 選択 | Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 | 0.0 |
-UpsideDown | 選択 | Upside Down | |
-Centre | 選択 | 画像の中心をページの中心に合わせる | |
-CircleRadius | 選択 | Radius of circles in the case of imageCircles | 0.5 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 49 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-C option is stronger than -AC and -PC -PC option is stronger than -AC -AC: (i+1)*(max-maen) /(AC+1) + mean -PC: (i )*(max+mean)/2)/AC + (max+mean)/2 -AS option is stronger than -S option The default value of -AS option is ignored. The default value of -S option is used. Both options are applied to y-axis.
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | ImageDensity |
2 | Contour(DiffrentLineWidth) |
4 | Contour(SameLineWidth) |
8 | BlackCircles |
16 | 目盛りの表示 |
32 | 中心点の表示 |
16777216 | Amplitude by AsciiFile |
33554432 | Log of Amplitude by AsciiFile |
67108864 | Phase by AsciiFile |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 5 (34, 41, 36) |
オプション必須項目のみの場合
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---|
サムネイル |
オプション -S
S=2で実行
39/69ページ |
---|
サムネイル |
オプション -H
H=1, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -L
L=1.5, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -Section
Section=x, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -x, -y, -z
x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行
11/21ページ |
---|
オプション -AS
AS=1で実行
39/69ページ |
---|
オプション -center
center=(30, 30), S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -I
I, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -A
A, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -Y
Y=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -ReverseOrder
ReverseOrder, S=2で実行
31/69ページ |
---|
サムネイル |
オプション -untwist
untwist=0.1, S=2で実行
39/69ページ |
---|
サムネイル |
オプション -UpsideDown
UpsideDown, S=2で実行
31/69ページ |
---|
サムネイル |
オプション -Centre
Centre, S=2で実行
39/69ページ |
---|
サムネイル |
オプション -m
m=1, S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=17, S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行
39/69ページ |
---|
m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -AC
AC=3, m=62, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -PC
PC=1, m=62, S=2で実行
39/69ページ |
---|
オプション -AC2
AC2=4, m=62, S=2で実行
39/69ページ |
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