「mrcImageROIs」の版間の差分
(→メインオプション) |
(→-M の詳細) |
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(同じ利用者による、間の1版が非表示) | |||
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</table> | </table> | ||
− | === | + | ===-m の詳細=== |
[[補間]]の仕方を指定する。 | [[補間]]の仕方を指定する。 | ||
<table border="1"> | <table border="1"> | ||
行86: | 行86: | ||
<td>3</td> | <td>3</td> | ||
<td>2次曲面補間法</td> | <td>2次曲面補間法</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </div> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===-M の詳細=== | ||
+ | 出力ファイルフォーマットを指定する。 | ||
+ | <table border="1"> | ||
+ | <div align="left"> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>モード</th> | ||
+ | <th>説明</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | <td>Char</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>1</td> | ||
+ | <td>Short</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>2</td> | ||
+ | <td>Float</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
行101: | 行125: | ||
中心と半径の指定 | 中心と半径の指定 | ||
− | OutFileName Circle centerx centery radius | + | OutFileName Circle centerx centery radius |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
− | + | ||
== 実行例 == | == 実行例 == |
2014年7月30日 (水) 01:18時点における最新版
mrcImageROIsとはmrcImageファイルから、複数の気になる領域を切り出すためのEosのコマンドである。
目次
アルゴリズム
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-I | 必須 | 入力ファイル:ASCII(ROI情報の設定) | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル:モンタージュファイルの指定 | stdout(設定しなければ標準出力) |
-S | 選択 | 入力:入力ファイルとROI情報を設定した画像の間で縮小率が異なっていた場合 | NULL(縮小が掛かっていないとする) |
-w | 選択 | 入力:全てのROIの幅を指定した一定幅にする | 0.0(ROI情報ファイルのまま) |
-h | 選択 | 入力:全てのROIの高さを指定した一定高さにする | 0.0(ROI情報ファイルのまま) |
-m | 選択 | 補間方法の指定 | 0 |
-M | 選択 | 出力ファイルフォーマットの指定 | 2 |
-m の詳細
補間の仕方を指定する。
モード | 説明 |
---|---|
0 | 最近傍法 |
1 | 線形補間法 |
2 | 3次補間法 |
3 | 2次曲面補間法 |
-M の詳細
出力ファイルフォーマットを指定する。
モード | 説明 |
---|---|
0 | Char |
1 | Short |
2 | Float |
ROI情報ファイルのフォーマット
出力ファイル名 形 パラメータ
長方形(4隅を指定)
OutFileName Rect blx bly brx bry trx try tlx tly
長方形(中心と大きさの指定)
OutFileName Rect2 centerx centery width height
中心と半径の指定
OutFileName Circle centerx centery radius
実行例
------入力ファイルの画像------
最小 最大 |
0 255 |
ノイズを加えたものを使用 ------> |
最小 最大 |
0 255 |
------Infomationファイルの内容------
ファイル形式1: OutFileName Rect blx bly brx bry trx try tlx tly
inputnoise-0000.roi Rect 6 6 26 6 26 26 6 26 inputnoise-0001.roi Rect 20 6 40 6 40 26 20 26 inputnoise-0002.roi Rect 40 6 60 6 60 26 40 26 inputnoise-0003.roi Rect 54 6 74 6 74 26 54 26 inputnoise-0004.roi Rect 6 20 26 20 26 40 6 40 inputnoise-0005.roi Rect 20 20 40 20 40 40 20 40 inputnoise-0006.roi Rect 40 20 60 20 60 40 40 40 inputnoise-0007.roi Rect 54 20 74 20 74 40 54 40 inputnoise-0008.roi Rect 6 40 26 40 26 60 6 60 inputnoise-0009.roi Rect 20 40 40 40 40 60 20 60 inputnoise-0010.roi Rect 40 40 60 40 60 60 40 60 inputnoise-0011.roi Rect 54 40 74 40 74 60 54 60 inputnoise-0012.roi Rect 6 54 26 54 26 74 6 74 inputnoise-0013.roi Rect 20 54 40 54 40 74 20 74 inputnoise-0014.roi Rect 40 54 60 54 60 74 40 74 inputnoise-0015.roi Rect 54 54 74 54 74 74 54 74
ファイル形式2: OutFileName Rect2 centerx centery width height
------オプション必須項目のみの場合の出力結果画像------
Infomationファイルタイプ:Rect
Infomationファイルタイプ:Rect2
------オプション -oを使用------
最小 最大 |
-168.927 160.828 |
------オプション -Sを使用------
Infomationファイルの15番を表示
-S=3の時
最小 最大 |
0 255 |
-S=5の時
最小 最大 |
0 255 |
------オプション -width,-heightを使用------
-width=10,-height=10に設定
最小 最大 |
0 255 |
-width=50,-height=50に設定
最小 最大 |
0 255 |
------モード1:0~2での処理------
Infomationファイル:Rectで実行
モード:0
最小 最大 |
0 165 |
モード:1
最小 最大 |
0 65445 |
モード:2
最小 最大 |
-168.927 160.828 |
------モード2:0~2での処理------
Infomationファイル:Rect2で実行
モード:0
最小 最大 |
0 255 |
モード:1
最小 最大 |
0 255 |
モード:2
最小 最大 |
-65.1789 323.14 |
モード:3
最小 最大 |
-13045.1 399922 |