「mrcImageRadonTransform」の版間の差分

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'''mrcImageRadonTransform'''はラドン変換を行う[[Eos]]の[[コマンド]]。
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'''mrcImageRadonTransform'''とはラドン変換を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。
  
 
==オプション一覧==
 
==オプション一覧==
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<td>-i</td>
 
<td>-i</td>
 
<td>必須</td>
 
<td>必須</td>
−
<td>入力ファイル設定</td>
+
<td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td>
 
<td>NULL</td>
 
<td>NULL</td>
 
</tr>
 
</tr>
行19: 行19:
 
<td>-o</td>
 
<td>-o</td>
 
<td>必須</td>
 
<td>必須</td>
−
<td>出力ファイル設定</td>
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](Radon)</td>
 
<td>NULL</td>
 
<td>NULL</td>
 
</tr>
 
</tr>
行45: 行45:
  
 
==実行例==
 
==実行例==
−
===------入力ファイルの画像------===
+
===[[Media:Input-121P.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input2-121P.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 236)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input3-121P.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 236)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:b120-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td><p align="left">最小<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
最大<br>
−
最大<br>
+
平均値<br>
−
平均値<br>
+
標準偏差<br>
−
標準偏差<br>
+
標準誤差<br></p>
−
標準誤差<br></p>
+
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3500.79 (49, 53, 30)<br>
 +
11.0585<br>
 +
118.123<br>
 +
0.118123<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>  
 +
スタイル<br>  
 +
ボクセルサイズ<br>  
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left">Chimera<br>
−
65.5929<br>
+
solid<br>
−
5.45036<br>
+
(1, 1, 1)<br>  
−
12.3043<br>
+
(1, 0, 0)<br>
−
0.153804<br></p>
+
90<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
−
 
−
===------必須項目のオプションのみの場合------===
 
−
 
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata1-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
<td><p align="left">使用ツール<br>  
−
最大<br>
+
スタイル<br>  
−
平均値<br>
+
ボクセルサイズ<br>  
−
標準偏差<br>
+
回転軸<br>
−
標準誤差<br></p>
+
角度<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left">Chimera<br>
−
34882.3<br>
+
solid<br>
−
436.012<br>
+
(1, 1, 1)<br>  
−
662.148<br>
+
(0, 1, 0)<br>
−
0.290819<br></p>
+
90<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">サイズ<br>
 +
モード<br>
 +
最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">(      100,        180,        360)<br>
 +
mrcFloatRadonImage <br>
 +
0 (0, 0, 0)<br>
 +
681534 (48, 135, 0)<br>
 +
110585<br>
 +
157900<br>
 +
62.0289<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
  
−
===------オプション　-dtheta------===
+
===オプション　-dtheta===
−
====-dtheta=2で実行====
+
====dtheta=30で実行====
 +
<div>[[Media:Outdata-dtheta-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div>
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-dtheta2-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-dtheta2-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
<td><p align="left">使用ツール<br>  
−
最大<br>
+
スタイル<br>  
−
平均値<br>
+
ボクセルサイズ<br>  
−
標準偏差<br>
+
回転軸<br>
−
標準誤差<br></p>
+
角度<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left">Chimera<br>
−
34882.3<br>
+
solid<br>
−
436.007<br>
+
(1, 1, 1)<br>  
−
662.183<br>
+
(1, 0, 0)<br>
−
0.411302<br></p>
+
90<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
−
 
−
====-dtheta=3で実行====
 
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-dtheta3-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td><p align="left">サイズ<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
モード<br>
 +
最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
 
平均値<br>
 
平均値<br>
行114: 行185:
 
標準誤差<br></p>
 
標準誤差<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left">(      100,          6,        360)<br>
−
34882.3<br>
+
mrcFloatRadonImage <br>
−
436.002<br>
+
0 (0, 0, 0)<br>
−
664.341<br>
+
681291 (41, 0, 45)<br>
−
0.509646<br></p>
+
110585<br>
 +
157972<br>
 +
339.901<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
 +
<br>
  
−
===------オプション　-dphi------===
+
===オプション　-dphi===
−
====ｙｚ平面を表示できないため、データ詳細を表示====
+
====dphi=2, dtheta=30で実行====
−
====-dphi=2で実行====
+
<div>[[Media:Outdata-dphi-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div>
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-dphi2-info-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-dphi2-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
solid<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">サイズ<br>
 +
モード<br>
 +
最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
 
平均値<br>
 
平均値<br>
行135: 行227:
 
標準誤差<br></p>
 
標準誤差<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left"> (      100,          6,        180)<br>
−
34882.3<br>
+
mrcFloatRadonImage <br>
−
435.995<br>
+
0 (0, 0, 0)<br>
−
662.283<br>
+
595996 (57, 3, 7)<br>
−
0.411364<br></p>
+
110585<br>
 +
157936<br>
 +
480.582<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
 +
<br>
  
−
====-dphi=3で実行====
+
====dphi=30, dtheta=30で実行====
 +
<div>[[Media:Outdata1-dphi-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-dphi3-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
solid<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-dphi3-info-mrcImageRadonTransform.png]]</td>
+
<td><p align="left">サイズ<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
モード<br>
 +
最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
 
平均値<br>
 
平均値<br>
行154: 行268:
 
標準誤差<br></p>
 
標準誤差<br></p>
 
</td>
 
</td>
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="left"> (      100,          6,        12)<br>
−
34882.3<br>
+
mrcFloatRadonImage <br>
−
435.977<br>
+
0 (0, 0, 0)<br>
−
658.9<br>
+
548332 (43, 5, 5)<br>
−
0.503344<br></p>
+
110585<br>
 +
157847<br>
 +
1860.25<br></p>
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
 +
<br>

2014年7月30日 (水) 02:04時点における最新版

mrcImageRadonTransformとはラドン変換を行うEosのコマンドである。

オプション一覧

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage(Radon) NULL
-dtheta 選択 ｙ軸のピクセルサイズを設定 1
-dphi 選択 ｚ軸のピクセルサイズを設定 1
-h 選択 ヘルプを表示 　


実行例

入力ファイルの画像

Input2-121P.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 236)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Input3-121P.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 236)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (49, 53, 30)
11.0585
118.123

0.118123


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90
Outdata1-mrcImageRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid
(1, 1, 1)
(0, 1, 0)

90

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 100, 180, 360)

mrcFloatRadonImage
0 (0, 0, 0)
681534 (48, 135, 0)
110585
157900

62.0289


オプション　-dtheta

dtheta=30で実行

Outdata-dtheta2-mrcImageRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 100, 6, 360)

mrcFloatRadonImage
0 (0, 0, 0)
681291 (41, 0, 45)
110585
157972

339.901


オプション　-dphi

dphi=2, dtheta=30で実行

Outdata-dphi2-mrcImageRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 100, 6, 180)

mrcFloatRadonImage
0 (0, 0, 0)
595996 (57, 3, 7)
110585
157936

480.582


dphi=30, dtheta=30で実行

Outdata-dphi3-mrcImageRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 100, 6, 12)

mrcFloatRadonImage
0 (0, 0, 0)
548332 (43, 5, 5)
110585
157847

1860.25



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