「mrcImageRadonTransform」の版間の差分
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− | '''mrcImageRadonTransform''' | + | '''mrcImageRadonTransform'''とはラドン変換を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
==オプション一覧== | ==オプション一覧== | ||
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイル設定</td> | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](Radon)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td | + | <td>[[画像:Input2-121P.png]]</td> |
− | + | <td><p align="left">使用ツール<br> | |
− | </td> | + | スタイル<br> |
− | <td><p align=" | + | ボクセルサイズ<br> |
− | + | 回転軸<br> | |
− | </td> | + | 角度<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | surface(Level: 236)<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 0<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input3-121P.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">使用ツール<br> | ||
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | surface(Level: 236)<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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118.123<br> | 118.123<br> | ||
0.118123<br></p> | 0.118123<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-mrcImageRadonTransform.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">使用ツール<br> | ||
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | solid<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata1-mrcImageRadonTransform.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">使用ツール<br> | ||
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | solid<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (0, 1, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">( 100, 180, 360)<br> | ||
+ | mrcFloatRadonImage <br> | ||
+ | 0 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 681534 (48, 135, 0)<br> | ||
+ | 110585<br> | ||
+ | 157900<br> | ||
+ | 62.0289<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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===オプション -dtheta=== | ===オプション -dtheta=== | ||
− | ==== | + | ====dtheta=30で実行==== |
<div>[[Media:Outdata-dtheta-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div> | <div>[[Media:Outdata-dtheta-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | + | <td>[[画像:Outdata-dtheta2-mrcImageRadonTransform.png]]</td> | |
− | <td>[[画像:Outdata-dtheta2-mrcImageRadonTransform.png]]</td> | + | <td><p align="left">使用ツール<br> |
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | solid<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
<td><p align="left">サイズ<br> | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
モード<br> | モード<br> | ||
行85: | 行185: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">( | + | <td><p align="left">( 100, 6, 360)<br> |
mrcFloatRadonImage <br> | mrcFloatRadonImage <br> | ||
− | 0 (0, | + | 0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 681291 (41, 0, 45)<br> | |
− | + | 110585<br> | |
− | + | 157972<br> | |
− | + | 339.901<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行102: | 行202: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td | + | <td>[[画像:Outdata-dphi2-mrcImageRadonTransform.png]]</td> |
− | + | <td><p align="left">使用ツール<br> | |
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | solid<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
<td><p align="left">サイズ<br> | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
モード<br> | モード<br> | ||
行113: | 行227: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left"> ( 100, 6, 180)<br> |
− | <br> | + | mrcFloatRadonImage <br> |
− | 0 (0, | + | 0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 595996 (57, 3, 7)<br> | |
− | + | 110585<br> | |
− | + | 157936<br> | |
− | + | 480.582<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行125: | 行239: | ||
<br> | <br> | ||
− | ==== | + | ====dphi=30, dtheta=30で実行==== |
+ | <div>[[Media:Outdata1-dphi-mrcImageRadonTransform.radon | 出力ファイル]]</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td | + | <td>[[画像:Outdata-dphi3-mrcImageRadonTransform.png]]</td> |
− | + | <td><p align="left">使用ツール<br> | |
+ | スタイル<br> | ||
+ | ボクセルサイズ<br> | ||
+ | 回転軸<br> | ||
+ | 角度<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
+ | <td><p align="left">Chimera<br> | ||
+ | solid<br> | ||
+ | (1, 1, 1)<br> | ||
+ | (1, 0, 0)<br> | ||
+ | 90<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
<td><p align="left">サイズ<br> | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
モード<br> | モード<br> | ||
行139: | 行268: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left"> ( 100, 6, 12)<br> |
− | <br> | + | mrcFloatRadonImage <br> |
− | 0<br> | + | 0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 548332 (43, 5, 5)<br> | |
− | + | 110585<br> | |
− | + | 157847<br> | |
− | + | 1860.25<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | + | <br> |
2014年7月30日 (水) 02:04時点における最新版
mrcImageRadonTransformとはラドン変換を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
実行例
入力ファイルの画像
使用ツール スタイル |
Chimera surface(Level: 236) |
使用ツール スタイル |
Chimera surface(Level: 236) |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3500.79 (49, 53, 30) |
オプション必須項目のみの場合
使用ツール スタイル |
Chimera solid |
使用ツール スタイル |
Chimera solid |
サイズ モード |
( 100, 180, 360) mrcFloatRadonImage |
オプション -dtheta
dtheta=30で実行
使用ツール スタイル |
Chimera solid |
サイズ モード |
( 100, 6, 360) mrcFloatRadonImage |
オプション -dphi
dphi=2, dtheta=30で実行
使用ツール スタイル |
Chimera solid |
サイズ モード |
( 100, 6, 180) mrcFloatRadonImage |
dphi=30, dtheta=30で実行
使用ツール スタイル |
Chimera solid |
サイズ モード |
( 100, 6, 12) mrcFloatRadonImage |